


PFRMAT AL
TARGET T0087
AUTHOR 9885-9936-6780
METHOD Smith-Waterman alignment of
METHOD secondary structure annotated
METHOD sequence.
MODEL 1
PARENT 8abp
S    2   N    2
K    3   L    3
I    4   K    4
L    5   L    5
V    6   G    6
F    7   F    7
G    8   L    8
H    9   V    9
Q   10   K   10
N   11   Q   11
P   12   P   12
D   13   E   13
S   14   E   14
D   15   P   15
A   16   W   16
I   17   F   17
G   18   Q   18
S   19   T   19
S   20   E   20
M   21   W   21
A   22   K   22
Y   23   F   23
A   24   A   24
Y   25   K   26
L   26   A   27
K   27   G   28
R   28   K   29
Q   29   D   30
L   30   L   31
G   31   G   32
V   32   F   33
D   33   E   34
A   34   V   35
Q   35   I   36
A   36   K   37
V   37   I   38
A   38   A   39
N   41   V   40
P   42   P   41
N   43   D   42
E   44   G   43
E   45   E   44
T   46   K   45
A   47   T   46
L   50   L   47
D   51   N   48
V   60   A   49
V   61   I   50
K   62   D   51
S   63   S   52
A   64   L   53
Q   65   A   54
A   66   A   55
E   67   S   56
G   68   G   57
A   69   A   58
K   70   K   59
Q   71   G   60
V   72   F   61
I   73   V   62
L   74   I   63
T   75   C   64
D   76   T   65
N   78   P   66
E   79   K   69
F   80   L   70
Q   81   G   71
Q   82   S   72
S   83   A   73
I   84   I   74
A   85   A   76
D   86   K   77
I   87   A   78
R   88   R   79
E   89   D   82
E   91   M   83
V   92   K   84
V   93   V   85
E   94   I   86
V   95   A   87
V   96   V   88
D   97   D   89
H   98   D   90
H   99   Q   91
R  100   F   92
V  101   V   93
A  102   A   95
N  103   K   96
F  104   G   97
E  105   K   98
T  106   M  100
A  107   D  101
N  108   T  102
P  109   P  104
L  110   L  105
Y  111   V  106
M  112   M  107
V  117   L  108
G  118   A  109
A  120   A  110
S  121   T  111
S  122   K  112
I  123   I  113
V  124   G  114
Y  125   E  115
R  126   R  116
L  127   Q  117
Y  128   G  118
K  129   Q  119
E  130   E  120
I  135   L  121
P  136   Y  122
K  137   K  123
E  138   E  124
I  139   M  125
M  143   Q  126
L  144   K  127
S  145   R  128
G  146   G  129
I  148   W  130
S  149   S  135
T  151   A  136
L  152   V  137
L  153   M  138
L  154   I  140
K  155   T  141
S  156   A  142
P  157   N  143
T  158   E  144
T  159   L  145
H  160   D  146
A  161   A  148
S  162   R  149
D  163   R  150
P  164   R  151
A  165   T  152
V  166   T  153
A  167   G  154
E  168   S  155
D  169   D  157
L  170   A  158
A  171   L  159
K  172   K  160
I  173   A  161
A  174   A  162
G  175   G  163
V  176   F  164
D  177   P  165
L  178   E  166
Q  179   K  167
E  180   Q  168
Y  181   Y  170
L  183   V  172
A  184   P  173
L  186   T  174
K  187   K  175
A  188   S  176
G  189   N  177
T  190   D  178
N  191   I  179
L  192   P  180
A  193   G  181
S  194   A  182
K  195   F  183
A  197   D  184
A  198   A  185
Q  199   A  186
L  200   N  187
V  201   S  188
D  202   M  189
I  203   L  190
D  204   V  191
L  210   Q  192
N  211   H  193
S  213   P  194
Q  214   E  195
V  215   V  196
R  216   K  197
V  217   H  198
A  218   W  199
Q  219   L  200
V  220   I  201
T  222   V  202
V  223   M  204
N  226   N  205
E  227   D  206
N  233   S  207
E  234   T  208
I  235   V  209
E  236   L  210
E  237   G  211
A  238   G  212
I  239   V  213
K  240   R  214
A  241   A  215
S  242   T  216
Q  243   E  217
A  245   G  218
N  246   Q  219
G  247   G  220
Y  248   F  221
S  249   K  222
D  250   D  225
F  251   I  226
V  252   I  227
L  253   I  229
M  254   G  230
I  255   I  231
T  256   V  234
D  257   D  235
I  258   V  237
L  259   S  238
N  260   E  239
S  261   S  241
N  262   K  242
S  263   A  243
E  264   G  247
I  265   F  248
L  266   Y  249
A  267   L  252
L  268   L  253
N  270   P  254
N  271   S  255
T  272   P  256
D  273   D  257
K  274   V  258
V  275   H  259
E  276   G  260
A  277   Y  261
A  278   K  262
F  279   S  263
N  280   S  264
F  281   E  265
T  282   M  266
L  283   L  267
H  287   Y  268
A  288   N  269
F  289   W  270
L  290   V  271
A  291   A  272
A  293   D  274
V  294   V  275
S  295   E  276
R  296   P  277
K  297   P  278
K  298   K  279
TER
END
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Ajay K. Royyuru, PhD                   Phone: (914) 945-1335
Manager, Structural Biology            Fax: (914) 945-4104
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