
PFRMAT AL
TARGET T0087
AUTHOR 3995-5176-6362
METHOD Chandonia & Cohen, mostly unpublished.
METHOD Uses a combination of PSI-BLAST scoring matrix
METHOD and Pred2ary secondary structure prediction.
METHOD Pred2ary page is http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/pred2ary/
METHOD The potential is documented in the paper by
METHOD Schwartz et al which is referenced on
METHOD my research page: http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/research.html
MODEL 1
PARENT 1cp2_A
M 1 M 1
S 2 R 2
K 3 Q 3
I 4 V 4
L 5 A 5
V 6 I 6
F 7 Y 7
G 8 G 8
H 9 K 9
Q 10 G 10
N 11 G 11
I 17 I 12
G 18 G 13
S 19 K 14
S 20 S 15
M 21 Q 19
A 22 N 20
Y 23 L 21
A 24 T 22
Y 25 S 23
L 26 G 24
K 27 L 25
R 28 H 26
Q 29 A 27
L 30 M 28
G 31 G 29
V 32 K 30
A 34 T 31
Q 35 I 32
A 36 M 33
V 37 V 34
A 38 V 35
L 39 G 36
G 40 C 37
N 41 D 38
P 42 P 39
N 43 K 40
E 44 A 41
E 45 D 42
T 46 S 43
A 47 T 44
F 48 R 45
V 49 L 46
L 50 L 47
Y 52 L 48
F 53 G 49
G 54 G 50
I 55 L 51
Q 56 A 52
A 57 Q 53
P 58 K 54
P 59 S 55
V 60 V 56
V 61 L 57
K 62 D 58
S 63 T 59
A 64 L 60
Q 65 R 61
A 66 E 62
E 67 E 63
G 68 G 64
A 69 E 65
K 70 D 66
Q 71 V 67
E 79 E 68
F 80 L 69
Q 81 D 70
Q 82 S 71
S 83 I 72
V 92 L 73
V 93 K 74
E 94 E 75
V 95 G 76
V 96 Y 77
D 97 G 78
H 98 G 79
H 99 I 80
R 100 R 81
V 101 C 82
A 102 V 83
N 103 E 84
F 104 S 85
E 105 G 86
T 106 G 87
A 107 P 88
N 108 E 89
P 109 P 90
L 110 G 91
V 117 V 92
G 118 G 93
S 119 C 94
A 120 A 95
S 121 G 96
S 122 R 97
I 123 I 99
V 124 I 100
Y 125 T 101
R 126 N 104
L 127 M 105
Y 128 L 106
K 129 E 107
E 130 Q 108
N 131 L 109
G 132 G 110
V 133 A 111
A 134 Y 112
I 135 T 113
P 136 D 114
K 137 D 115
S 149 L 116
D 150 D 117
T 151 Y 118
L 152 V 119
L 153 F 120
L 154 Y 121
K 155 D 122
S 156 V 123
P 157 L 124
T 158 G 125
G 175 D 126
V 176 V 127
D 177 V 128
L 178 C 129
Q 179 G 130
E 180 G 131
Y 181 F 132
G 182 A 133
L 183 M 134
A 184 P 135
M 185 I 136
L 186 R 137
K 187 E 138
A 188 G 139
G 189 K 140
T 190 A 141
N 191 Q 142
L 192 M 152
A 193 M 153
S 194 A 154
K 195 L 155
T 196 Y 156
A 197 A 157
A 198 A 158
Q 199 N 159
L 200 N 160
V 201 I 161
D 202 S 162
I 203 K 163
D 204 G 164
A 205 I 165
K 206 Q 166
T 207 K 167
F 208 Y 168
E 209 A 169
L 210 K 170
N 211 S 171
G 212 G 172
Q 214 G 173
V 215 V 174
R 216 R 175
V 217 L 176
A 218 G 177
Q 219 G 178
V 220 I 179
N 221 I 180
T 222 C 181
V 223 N 182
D 224 S 183
I 225 R 184
N 226 K 185
E 227 V 186
V 228 A 187
L 229 N 188
E 230 E 189
E 236 Y 190
E 237 E 191
A 238 L 192
I 239 L 193
K 240 D 194
A 241 A 195
S 242 F 196
Q 243 A 197
A 244 K 198
A 245 E 199
N 246 L 200
G 247 G 201
Y 248 S 202
S 249 Q 203
D 250 L 204
F 251 I 205
V 252 H 206
L 253 F 207
M 254 V 208
I 255 P 209
T 256 R 210
D 257 S 211
I 258 P 212
L 259 N 220
N 260 K 221
S 261 Q 222
N 262 T 223
S 263 V 224
E 264 I 225
I 265 E 226
L 266 Y 227
A 267 D 228
L 268 P 229
G 269 T 230
N 270 C 231
N 271 E 232
T 272 Q 233
D 273 A 234
K 274 E 235
V 275 E 236
E 276 Y 237
A 277 R 238
A 278 E 239
F 279 L 240
N 280 A 241
F 281 R 242
T 282 K 243
L 283 V 244
K 284 D 245
N 285 A 246
N 286 N 247
H 287 E 248
A 288 L 249
F 289 F 250
L 290 V 251
A 291 I 252
G 292 P 253
A 293 K 254
V 294 P 255
S 295 M 256
R 296 T 257
K 297 Q 258
K 298 E 259
Q 299 R 260
V 300 L 261
V 301 E 262
P 302 E 263
Q 303 I 264
L 304 L 265
T 305 M 266
E 306 Q 267
S 307 Y 268
G 310 G 269
TER
END

