
PFRMAT AL
TARGET T0087
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1EBF_A
REMARK DATE	2000-03-08
REMARK SCORE	?
S 14 A 13
D 15 G 14
A 16 V 15
I 17 V 16
G 18 G 17
S 19 S 18
S 20 A 19
M 21 F 20
A 22 L 21
Y 23 L 24
A 24 L 25
Y 25 A 26
L 26 M 27
K 27 K 28
R 28 S 29
Q 29 T 30
L 30 I 31
G 31 T 32
V 32 Y 33
D 33 N 34
A 34 L 35
Q 35 V 36
A 36 L 37
V 37 L 38
A 38 A 39
L 39 E 40
G 40 A 41
N 41 E 42
P 42 R 43
N 43 S 44
E 44 L 45
E 45 I 46
T 46 S 47
A 47 K 48
F 48 D 49
V 49 F 50
L 50 S 51
D 51 A 61
Y 52 A 62
F 53 L 63
G 54 A 64
I 55 A 65
Q 56 S 66
A 57 T 67
P 58 T 68
P 59 K 69
V 60 T 70
V 61 L 71
K 62 P 72
S 63 L 73
A 64 D 74
Q 65 D 75
A 66 L 76
E 67 T 82
G 68 S 83
A 69 P 84
K 70 K 85
Q 71 P 86
V 72 V 87
I 73 I 88
L 74 L 89
T 75 V 90
D 76 D 91
H 77 N 92
N 78 T 93
E 79 S 94
F 80 S 95
Q 81 A 96
Q 82 Y 97
S 83 I 98
I 84 T 103
A 85 K 104
D 86 F 105
I 87 V 106
R 88 E 107
E 89 N 108
V 90 G 109
E 91 I 110
V 92 S 111
V 93 I 112
E 94 A 113
V 95 P 115
V 96 N 116
D 97 K 117
H 98 K 118
H 99 A 119
R 100 F 120
V 101 S 121
A 102 S 122
N 103 D 123
F 104 L 124
E 105 A 125
T 106 T 126
A 107 W 127
N 108 K 128
P 109 A 129
L 110 L 130
Y 111 F 131
M 112 S 132
R 113 N 133
L 114 K 134
E 115 P 135
P 116 T 136
V 117 N 137
G 118 G 138
S 119 F 139
A 120 V 140
S 121 Y 141
S 122 H 142
I 123 E 143
V 124 A 144
Y 125 A 148
R 126 G 149
L 127 L 150
Y 128 P 151
K 129 I 152
E 130 I 153
N 131 S 154
G 132 F 155
V 133 L 156
A 134 R 157
I 135 E 158
P 136 I 159
K 137 I 160
E 138 Q 161
I 139 T 162
A 140 G 163
G 141 I 172
V 142 F 173
M 143 S 174
L 144 G 175
S 145 T 176
G 146 L 177
L 147 S 178
I 148 Y 179
S 149 I 180
D 150 F 181
T 151 N 182
L 152 E 183
L 153 F 184
L 154 S 185
K 155 T 186
S 156 V 192
P 157 K 193
T 158 F 194
T 159 S 195
H 160 D 196
A 161 V 197
S 162 V 198
D 163 K 199
P 164 V 200
A 165 A 201
V 166 K 202
A 167 K 203
E 168 L 204
D 169 G 205
L 170 D 213
A 171 D 214
K 172 L 215
I 173 N 216
A 174 G 217
G 175 L 218
V 176 V 224
D 177 T 225
L 178 I 226
Q 179 V 227
E 180 G 228
Y 181 R 229
G 182 I 230
L 183 S 231
A 184 G 232
M 185 V 233
L 186 E 234
K 187 V 235
A 188 E 236
G 189 S 237
T 190 V 243
N 191 Q 244
L 192 S 245
A 193 L 246
S 194 I 247
K 195 K 249
T 196 P 250
A 197 L 251
A 198 E 252
Q 199 S 253
L 200 V 254
V 201 K 255
D 202 S 256
I 203 A 257
D 204 D 258
A 205 E 259
K 206 F 260
T 207 L 261
F 208 E 262
E 209 K 263
L 210 L 264
N 211 S 265
G 212 D 266
S 213 Y 267
Q 214 D 268
V 215 K 269
R 216 D 270
V 217 L 271
A 218 T 272
Q 219 Q 273
V 220 L 274
N 221 K 275
T 222 K 276
V 223 A 279
D 224 T 280
I 225 E 281
N 226 N 282
E 227 K 283
V 228 V 284
L 229 L 285
E 230 R 286
R 231 F 287
Q 232 I 288
N 233 G 289
E 234 K 290
I 235 V 291
E 236 D 292
E 237 V 293
A 238 A 294
I 239 T 295
K 240 K 296
A 241 S 297
S 242 V 298
Q 243 S 299
A 244 V 300
A 245 G 301
N 246 I 302
G 247 E 303
Y 248 K 304
S 249 Y 305
D 250 D 306
F 251 Y 307
V 252 L 314
L 253 K 315
M 254 G 316
I 255 S 317
T 256 D 318
D 257 N 319
I 258 V 320
L 259 I 321
N 260 S 322
S 261 I 323
N 262 K 324
S 263 T 325
E 264 K 326
I 265 R 327
L 266 Y 328
A 267 T 329
L 268 N 330
G 269 P 331
N 270 V 332
N 271 V 333
T 272 I 334
D 273 Q 335
K 274 G 336
V 275 A 337
E 276 G 338
A 277 A 339
A 278 G 340
F 279 A 341
N 280 A 342
F 281 V 343
T 282 T 344
L 283 A 345
K 284 A 346
N 285 G 347
N 286 V 348
H 287 L 349
A 288 G 350
F 289 D 351
L 290 V 352
A 291 I 353
G 292 K 354
A 293 I 355
V 294 A 356
S 295 Q 357
R 296 R 358
K 297 L 359
TER
END

