
PFRMAT AL
TARGET T0087
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  4
PARENT 2CMD
REMARK DATE	1994-01-31
REMARK SCORE	?
K 3 K 2
I 4 V 3
L 5 A 4
V 6 V 5
F 7 L 6
G 8 G 7
H 9 G 11
Q 10 I 12
N 11 G 13
P 12 Q 14
D 13 A 15
S 14 L 16
D 15 A 17
A 16 L 18
I 17 L 19
G 18 L 20
S 19 K 21
S 20 T 22
M 21 Q 23
A 22 L 24
Y 23 P 25
A 24 S 26
Y 25 G 27
L 26 S 28
K 27 E 29
R 28 L 30
Q 29 S 31
L 30 L 32
G 31 Y 33
V 32 D 34
D 33 I 35
A 34 A 36
Q 35 P 37
A 36 V 38
V 37 T 39
A 38 P 40
L 39 G 41
G 40 V 42
N 41 A 43
P 42 V 44
N 43 D 45
E 44 L 46
E 45 S 47
T 46 H 48
A 47 I 49
F 48 P 50
V 49 T 51
L 50 A 52
D 51 V 53
Y 52 K 54
F 53 I 55
G 54 K 56
I 55 G 57
Q 56 F 58
A 57 S 59
P 58 G 60
P 59 E 61
V 60 D 62
V 61 A 63
K 62 T 64
S 63 P 65
A 64 V 72
Q 65 V 73
A 66 L 74
E 67 I 75
G 68 S 76
A 69 A 77
K 70 G 78
Q 71 V 79
V 72 R 80
I 73 R 81
L 74 K 82
T 75 P 83
D 76 G 84
H 77 S 88
N 78 D 89
E 79 L 90
F 80 F 91
Q 81 N 92
Q 82 V 93
S 83 N 94
I 84 A 95
A 85 G 96
D 86 I 97
I 87 V 98
R 88 K 99
E 89 N 100
V 90 L 101
E 91 V 102
V 92 Q 103
V 93 Q 104
E 94 V 105
V 95 A 106
V 96 K 107
D 97 T 108
H 98 C 109
H 99 P 110
R 100 K 111
V 101 A 112
A 102 C 113
N 103 I 114
F 104 G 115
E 105 I 116
T 106 I 117
A 107 T 118
N 108 P 120
P 109 V 121
L 110 N 122
Y 111 T 123
M 112 T 124
R 113 V 125
L 114 A 126
E 115 I 127
P 116 A 128
V 117 A 129
G 118 E 130
S 119 V 131
A 120 L 132
S 121 K 133
S 122 K 134
I 123 A 135
V 124 G 136
Y 125 V 137
R 126 Y 138
L 127 D 139
Y 128 K 140
K 129 N 141
E 130 K 142
N 131 L 143
G 132 F 144
V 133 G 145
A 134 V 146
I 135 T 147
P 136 T 148
K 137 L 149
E 138 D 150
I 139 I 151
A 140 I 152
G 141 R 153
V 142 S 154
M 143 N 155
L 144 T 156
S 145 F 157
G 146 V 158
L 147 A 159
I 148 E 160
S 149 L 161
D 150 K 162
T 151 G 163
L 152 K 164
L 153 Q 165
L 154 P 166
K 155 G 167
S 156 E 168
P 157 V 169
T 158 E 170
T 159 V 171
H 160 P 172
A 161 V 173
S 162 I 174
D 163 V 189
P 164 P 190
A 165 G 191
V 166 V 192
A 167 S 193
E 168 F 194
D 169 T 195
L 170 E 196
A 171 Q 197
K 172 E 198
I 173 V 199
A 174 A 200
G 175 D 201
V 176 L 202
D 177 T 203
L 178 K 204
Q 179 R 205
E 180 I 206
Y 181 Q 207
G 182 N 208
L 183 A 209
A 184 G 210
M 185 T 211
L 186 E 212
K 187 V 213
A 188 V 214
G 189 E 215
T 190 A 216
N 191 K 217
L 192 A 218
A 193 G 219
S 194 G 220
K 195 G 221
T 196 S 222
A 197 A 223
A 198 T 224
Q 199 L 225
L 200 S 226
V 201 M 227
D 202 G 228
I 203 Q 229
D 204 A 230
A 205 A 231
K 206 A 232
T 207 R 233
F 208 F 234
E 209 G 235
L 210 L 236
N 211 S 237
G 212 L 238
S 213 V 239
Q 214 R 240
V 215 A 241
R 216 L 242
V 217 Q 243
A 218 G 244
Q 219 E 245
V 220 Q 246
N 221 G 247
T 222 V 248
V 223 V 249
D 224 E 250
I 225 C 251
N 226 A 252
E 227 Y 253
V 228 V 254
L 229 E 255
E 230 G 256
R 231 D 257
Q 232 G 258
N 233 Q 259
E 234 Y 260
I 235 A 261
E 236 S 265
E 237 Q 266
A 238 P 267
I 239 L 268
K 240 L 269
A 241 L 270
S 242 G 271
Q 243 K 272
A 244 N 273
A 245 G 274
N 246 E 276
G 247 E 277
Y 248 R 278
S 249 K 279
D 250 S 280
F 251 I 281
V 252 G 282
L 253 T 283
M 254 L 284
I 255 S 285
T 256 A 286
D 257 F 287
I 258 E 288
L 259 Q 289
N 260 N 290
S 261 A 291
N 262 L 292
S 263 E 293
E 264 G 294
I 265 M 295
L 266 L 296
A 267 D 297
L 268 T 298
G 269 L 299
N 270 K 300
N 271 K 301
T 272 D 302
D 273 I 303
K 274 A 304
V 275 L 305
E 276 G 306
A 277 Q 307
A 278 E 308
TER
END

