
PFRMAT AL
TARGET T0087
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  4
PARENT 1ske
M   1    N   30
S   2    F   31
K   3    N   32
I   4    R   33
L   5    H   34
V   6    L   35
F   7    H   36
G   8    F   37
H   9    T   38
Q  10    L   39
N  11    V   40
P  12    K   41
D  13    D   42
S  14    R   43
D  15    N   44
A  16    V   45
I  17    A   46
G  18    T   47
S  19    P   48
S  20    R   49
M  21    D   50
A  22    Y   51
Y  23    Y   52
A  24    F   53
Y  25    A   54
L  26    L   55
K  27    A   56
R  28    H   57
Q  29    T   58
D  33    D  109
A  34    E  110
Q  35    A  111
A  36    T  112
V  37    Y  113
A  38    Q  114
L  39    L  115
G  40    G  116
N  41    L  117
P  42    D  118
N  43    M  119
E  44    E  120
E  45    E  121
T  46    L  122
A  47    E  123
F  48    E  124
V  49    I  125
L  50    E  126
D  51    E  127
A  57    R  184
P  58    Y  185
P  59    G  186
V  60    N  187
V  61    P  188
K  62    W  189
S  63    E  190
A  64    K  191
Q  65    A  192
A  66    R  193
E  67    P  194
G  68    E  195
A  69    F  196
K  70    T  197
Q  71    L  198
V  72    P  199
I  73    V  200
L  74    H  201
T  75    F  202
D  76    Y  203
H  77    G  204
N  78    R  205
Q  82    H  208
S  83    T  209
I  84    S  210
A  85    Q  211
E  89    K  214
V  93    D  217
E  94    T  218
V  95    Q  219
V  96    V  220
D  97    V  221
H  98    L  222
H  99    A  223
R 100    M  224
V 101    P  225
A 102    Y  226
N 103    D  227
F 104    T  228
E 105    P  229
T 106    V  230
A 107    P  231
N 108    G  232
P 109    Y  233
L 110    R  234
Y 111    N  235
M 112    N  236
R 113    V  237
L 114    V  238
E 115    N  239
P 116    T  240
V 117    M  241
G 118    R  242
S 119    L  243
A 120    W  244
S 121    S  245
S 122    A  246
I 123    K  247
V 124    A  248
Y 125    P  249
R 126    N  250
L 127    D  251
Y 128    F  252
K 129    N  253
E 130    L  254
N 131    K  255
G 132    D  256
P 136    A  265
K 137    V  266
E 138    L  267
I 139    D  268
A 140    R  269
G 141    N  270
V 142    L  271
M 143    A  272
L 144    E  273
S 145    N  274
G 146    I  275
L 147    S  276
I 148    R  277
S 149    V  278
D 150    L  279
T 151    Y  280
L 152    P  281
L 153    N  282
L 154    D  283
K 155    N  284
S 156    F  285
P 157    F  286
T 158    E  287
T 159    G  288
H 160    K  289
A 161    E  290
S 162    L  291
D 163    R  292
P 164    L  293
A 165    K  294
V 166    Q  295
A 167    E  296
E 168    Y  297
D 169    F  298
L 170    V  299
A 171    V  300
K 172    A  301
I 173    A  302
A 174    T  303
G 175    L  304
E 180    A  364
Y 181    W  365
G 182    E  366
L 183    V  367
A 184    T  368
M 185    V  369
L 186    K  370
K 187    T  371
A 188    C  372
G 189    A  373
T 190    Y  374
N 191    T  375
L 192    N  376
A 193    H  377
S 194    T  378
K 195    V  379
T 196    L  380
A 197    P  381
A 198    E  382
Q 199    A  383
L 200    L  384
V 201    E  385
D 202    R  386
I 203    W  387
D 204    P  388
A 205    V  389
K 206    H  390
T 207    L  391
F 208    L  392
E 209    E  393
L 210    T  394
N 211    L  395
G 212    L  396
S 213    P  397
V 217    I  403
A 218    Y  404
Q 219    E  405
V 220    I  406
N 221    N  407
T 222    Q  408
V 223    R  409
D 224    F  410
I 225    L  411
N 226    N  412
E 227    R  413
V 228    V  414
L 229    A  415
E 230    A  416
R 231    A  417
Q 232    F  418
N 233    P  419
E 234    G  420
I 235    D  421
E 236    V  422
E 237    D  423
A 238    R  424
I 239    L  425
K 240    R  426
A 241    R  427
S 242    M  428
Q 243    S  429
A 244    L  430
A 245    V  431
N 246    E  432
G 247    E  433
Y 248    G  434
S 249    A  435
D 250    V  436
F 251    K  437
V 252    R  438
L 253    I  439
M 254    N  440
I 255    M  441
T 256    A  442
D 257    H  443
I 258    L  444
L 259    C  445
N 260    I  446
S 261    A  447
N 262    G  448
S 263    S  449
E 264    H  450
I 265    A  451
L 266    V  452
A 267    N  453
L 268    G  454
G 269    V  455
N 270    A  456
N 271    R  457
E 276    A  700
A 277    E  701
A 278    E  702
F 279    A  703
N 280    G  704
F 281    E  705
T 282    E  706
L 283    N  707
K 284    F  708
N 285    F  709
N 286    I  710
H 287    F  711
A 288    G  712
F 289    M  713
L 290    R  714
A 291    V  715
G 292    E  716
A 293    D  717
V 294    V  718
S 295    D  719
R 296    R  720
K 297    L  721
K 298    D  722
Q 299    Q  723
V 300    R  724
V 301    G  725
P 302    Y  726
Q 303    N  727
L 304    A  728
T 305    Q  729
E 306    E  730
S 307    Y  731
F 308    Y  732
N 309    D  733
G 310    R  734
TER
END


