
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=4.38 
REMARK CONFIDENCE: GUESS     (50% confidence [ ZSCORE>=3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: hs1elo_
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and environment-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  4
PARENT 1elo
M   1     H    20 
I   2     I    21 
D   3     D    22 
L   4     A    23 
S   5     G    24 
K   6     K    25 
T   7     T    26 
V   8     T    27 
F   9     T    28 
Y  10     T    29 
T  11     E    30 
S  12     R    31 
I  13     I    32 
D  14     L    33 
I  15     Y    34 
G  16     Y    35 
S  17     T    36 
R  18     G    37 
Y  19     R    38 
I  20     I    39 
K  21     A    68 
G  22     V    69 
L  23     T    70 
V  24     T    71 
L  25     C    72 
G  26     F    73 
K  27     W    74 
R  28     K    75 
D  29     D    76 
Q  30     H    77 
E  31     R    78 
W  32     I    79 
E  33     N    80 
A  34     I    81 
L  35     I    82 
A  36     T    91 
F  37     I    92 
S  38     E    93 
S  39     V    94 
V  40     E    95 
K  41     R    96 
S  42     S    97 
R  43     Q   124 
G  44     A   125 
L  45     E   126 
D  46     K   127 
E  47     Y   128 
G  48     K   129 
E  49     V   130 
I  50     A   136 
K  51     N   137 
D  52     K   138 
A  53     M   139 
I  54     D   140 
A  55     K   141 
F  56     T   142 
K  57     G   143 
E  58     A   144 
S  59     D   145 
V  60     L   146 
N  61     W   147 
T  62     L   148 
L  63     V   149 
L  64     I   150 
K  65     R   151 
E  66     T   152 
L  67     M   153 
E  68     Q   154 
E  69     E   155 
Q  70     R   156 
L  71     L   157 
Q  72     V   163 
K  73     M   164 
S  74     Q   165 
L  75     L   166 
R  76     P   167 
S  77     I   168 
D  78     G   169 
F  79     R   170 
V  80     E   171 
I  81     D   172 
S  82     T   173 
F  83     F   174 
S  84     S   175 
S  85     G   176 
V  86     I   177 
S  87     R   182 
F  88     M   183 
E  89     K   184 
R  90     A   185 
E  91     Y   186 
D  92     T   187 
T  93     Y   188 
V  94     G   189 
I  95     N   190 
E  96     D   191 
R  97     L   192 
D  98     G   193 
F  99     T   194 
G 100     D   195 
E 101     I   196 
E 102     R   197 
K 103     E   198 
R 104     I   199 
S 105     P   200 
I 106     I   201 
T 107     P   202 
L 108     E   203 
D 109     E   204 
I 110     Y   205 
L 111     L   206 
S 112     D   207 
E 113     Q   208 
M 114     A   209 
Q 115     R   210 
S 116     E   211 
E 117     Y   212 
A 118     H   213 
L 119     E   214 
E 120     K   215 
K 121     L   216 
L 122     V   217 
K 123     E   218 
E 124     V   219 
N 125     A   220 
G 126     A   221 
K 127     D   222 
T 128     F   223 
P 129     D   224 
L 130     E   225 
H 131     N   226 
I 132     I   227 
F 133     M   228 
S 134     L   229 
K 135     K   230 
R 136     Y   231 
L 139     L   232 
D 140     E   233 
D 141     G   234 
E 142     E   235 
R 143     E   236 
I 144     P   237 
V 145     T   238 
F 146     E   239 
N 147     E   240 
P 148     E   241 
L 149     L   242 
D 150     V   243 
M 151     A   244 
K 152     A   245 
A 153     I   246 
S 154     R   247 
K 155     K   248 
I 156     G   249 
A 157     T   250 
I 158     I   251 
E 159     D   252 
Y 160     L   253 
T 161     K   254 
V 164     I   255 
V 165     T   256 
P 166     P   257 
L 167     V   258 
K 168     F   259 
V 169     L   260 
Y 170     G   261 
E 171     S   262 
M 172     A   263 
F 173     L   264 
Y 174     K   265 
N 175     N   266 
F 176     K   267 
L 177     G   268 
Q 178     V   269 
D 179     Q   270 
T 180     L   271 
V 181     L   272 
K 182     L   273 
S 183     D   274 
P 184     A   275 
F 185     V   276 
Q 186     V   277 
L 187     D   278 
K 188     Y   279 
S 189     T   292 
S 190     T   293 
L 191     P   294 
V 192     E   295 
S 193     G   296 
T 194     E   297 
A 195     V   298 
E 196     V   299 
G 197     E   300 
V 198     I   301 
L 199     H   302 
T 200     P   303 
T 201     D   304 
P 202     P   305 
E 203     N   306 
K 204     G   307 
D 205     P   308 
R 206     L   309 
G 207     A   310 
V 208     A   311 
V 209     L   312 
V 210     A   313 
V 211     F   314 
N 212     K   315 
L 213     I   316 
G 214     M   317 
Y 215     A   318 
N 216     D   319 
F 217     P   320 
T 218     Y   321 
G 219     V   322 
L 220     L   325 
I 221     T   326 
A 222     F   327 
Y 223     I   328 
K 224     R   329 
N 225     V   330 
G 226     Y   331 
V 227     S   332 
P 228     G   333 
I 229     T   334 
K 230     L   335 
I 231     V   341 
S 232     Y   342 
Y 233     N   343 
V 234     T   344 
P 235     T   345 
V 236     K   346 
G 237     G   347 
M 238     R   348 
K 239     K   349 
H 240     E   350 
V 241     R   351 
I 242     V   352 
K 243     A   353 
D 244     R   354 
V 245     L   355 
S 246     L   356 
A 247     R   357 
V 248     M   358 
L 249     H   359 
D 250     A   360 
T 251     N   361 
S 252     H   362 
F 253     R   363 
E 254     E   364 
E 255     E   365 
S 256     G   391 
E 257     E   392 
R 258     D   393 
L 259     A   394 
I 260     P   395 
I 261     R   396 
T 262     V   397 
H 263     I   398 
G 264     L   399 
N 265     I   409 
A 266     D   410 
V 267     V   411 
Y 268     A   412 
N 269     I   413 
D 270     E   414 
L 271     P   415 
K 272     K   416 
E 273     S   425 
E 274     Q   426 
E 275     A   427 
I 276     L   428 
Q 277     A   429 
Y 278     R   430 
R 279     L   431 
G 280     A   432 
L 281     E   433 
D 282     E   434 
G 283     D   435 
N 284     P   436 
T 285     T   437 
I 286     F   438 
K 287     R   439 
T 288     V   440 
T 289     S   441 
T 290     T   442 
A 291     E   456 
K 292     L   457 
K 293     H   458 
L 294     L   459 
S 295     E   460 
V 296     I   461 
I 297     I   462 
I 298     V   463 
H 299     D   464 
A 300     R   465 
R 301     L   466 
L 302     K   467 
R 303     R   468 
E 304     E   469 
I 305     F   470 
M 306     V   476 
S 307     G   477 
K 308     K   478 
S 309     P   479 
K 310     Q   480 
K 311     V   481 
F 312     A   482 
F 313     Y   483 
R 314     R   484 
E 315     E   485 
V 316     T   486 
E 317     I   487 
A 318     T   488 
K 319     K   489 
I 320     I   498 
V 321     R   499 
E 322     Q   500 
E 323     T   501 
G 324     G   502 
E 325     G   503 
I 326     R   504 
G 327     G   505 
I 328     Q   506 
P 329     Y   507 
G 330     G   508 
G 331     H   509 
V 332     V   510 
V 333     K   511 
L 334     I   512 
T 335     K   513 
G 336     G   531 
G 337     G   532 
G 338     K   536 
A 339     E   537 
K 340     Y   538 
I 341     I   539 
P 342     P   540 
R 343     A   541 
I 344     V   542 
N 345     Q   543 
E 346     K   544 
L 347     G   545 
A 348     I   546 
T 349     E   547 
E 350     E   548 
V 351     A   549 
F 352     M   550 
K 353     Q   551 
S 354     S   552 
P 355     G   553 
V 356     I   563 
R 357     K   564 
T 358     V   565 
G 359     T   566 
C 360     L   567 
Y 361     Y   568 
A 362     D   569 
N 363     G   570 
S 364     S   571 
D 365     Y   572 
R 366     H   573 
P 367     E   574 
I 370     V   575 
N 371     D   576 
A 372     S   577 
D 373     S   578 
E 374     E   579 
V 375     M   580 
A 376     A   581 
N 377     F   582 
D 378     K   583 
P 379     I   584 
S 380     A   585 
F 381     G   586 
A 382     S   587 
A 383     M   588 
A 384     A   589 
F 385     I   590 
G 386     K   591 
N 387     E   592 
V 388     A   593 
F 389     V   594 
A 390     Q   595 
V 391     K   596 
S 392     G   597 
E 393     D   598 
N 394     P   599 
T 399     V   600 
P 400     I   601 
V 401     L   602 
K 402     E   603 
S 403     P   604 
E 404     I   605 
N 405     M   606 
P 406     R   607 
L 407     V   608 
K 408     E   609 
K 409     Y   616 
I 410     M   617 
F 411     G   618 
R 412     D   619 
L 413     V   620 
F 414     I   621 
K 415     G   622 
E 416     D   623 
L 417     L   624 
M 418     N   625 
E 419     A   626 
TER
END

