
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  4
PARENT 1dkg_D
REMARK Y 10 G 2
T 11 K 3
S 12 I 4
I 13 I 5
D 14 G 6
I 15 I 7
G 16 D 8
S 17 L 9
R 18 G 10
Y 19 T 11
I 20 T 12
K 21 N 13
G 22 S 14
L 23 C 15
V 24 V 16
L 25 A 17
G 26 I 18
K 27 M 19
R 28 D 20
D 29 G 21
Q 30 T 22
E 31 T 23
W 32 P 24
E 33 R 25
A 34 V 26
L 35 N 29
A 36 A 30
F 37 E 31
S 38 G 32
S 39 D 33
V 40 R 34
K 41 T 35
S 42 T 36
R 43 P 37
G 44 S 38
L 45 I 39
D 46 I 40
E 47 A 41
G 48 K 55
E 49 R 56
I 50 Q 57
K 51 A 58
D 52 V 59
A 53 T 60
I 54 N 61
A 55 P 62
F 56 Q 63
K 57 N 64
E 58 T 65
S 59 L 66
V 60 F 67
N 61 A 68
T 62 I 69
L 63 K 70
L 64 R 71
K 65 L 72
E 66 I 73
L 67 G 74
E 68 R 75
E 69 R 76
Q 70 F 77
L 71 Q 78
Q 72 D 79
K 73 E 80
S 74 E 81
L 75 V 82
R 76 Q 83
D 78 R 84
F 79 D 85
V 80 V 86
I 81 S 87
S 82 I 88
F 83 M 89
S 84 P 90
S 85 F 91
V 86 K 92
S 87 I 93
F 88 I 94
E 89 A 95
R 90 A 96
E 91 D 97
D 92 N 98
T 93 D 100
V 94 A 101
I 95 W 102
E 96 V 103
R 97 E 104
D 98 V 105
F 99 K 106
G 100 G 107
E 101 Q 108
E 102 K 109
K 103 M 110
R 104 A 111
S 105 P 112
I 106 P 113
T 107 Q 114
L 108 I 115
D 109 S 116
I 110 A 117
L 111 E 118
S 112 V 119
E 113 L 120
M 114 K 121
Q 115 K 122
S 116 M 123
E 117 K 124
A 118 K 125
L 119 T 126
E 120 A 127
K 121 E 128
L 122 D 129
K 123 Y 130
E 124 L 131
N 125 G 132
G 126 E 133
K 127 P 134
T 128 V 135
P 129 T 136
L 130 E 137
H 131 A 138
I 132 V 139
F 133 I 140
S 134 T 141
K 135 V 142
R 136 P 143
Y 137 A 144
L 138 Y 145
L 139 F 146
D 140 N 147
E 142 D 148
R 143 A 149
I 144 Q 150
V 145 R 151
F 173 Q 152
Y 174 A 153
N 175 T 154
F 176 K 155
L 177 D 156
Q 178 A 157
D 179 G 158
T 180 R 159
V 181 I 160
K 182 A 161
S 183 G 162
P 184 L 163
F 185 E 164
Q 186 V 165
L 187 K 166
K 188 R 167
S 189 I 168
S 190 I 169
L 191 N 170
V 192 E 171
S 193 P 172
T 194 T 173
A 195 A 174
E 196 A 175
G 197 A 176
V 198 L 177
L 199 A 178
T 200 Y 179
T 201 G 180
P 202 L 181
E 203 D 182
K 204 K 183
REMARK D 205 G 184
R 206 G 186
G 207 N 187
V 208 R 188
V 209 T 189
V 210 I 190
V 211 A 191
N 212 V 192
L 213 Y 193
G 214 D 194
Y 215 L 195
N 216 G 196
F 217 G 197
T 218 G 198
G 219 T 199
L 220 F 200
I 221 D 201
A 222 I 202
Y 223 S 203
K 224 I 204
N 225 I 205
G 226 E 206
V 227 I 207
P 228 D 208
I 229 E 209
K 230 L 219
I 231 A 220
S 232 T 221
Y 233 N 222
V 234 G 223
P 235 D 224
V 236 T 225
G 237 H 226
M 238 L 227
K 239 G 228
H 240 G 229
V 241 E 230
I 242 D 231
K 243 F 232
D 244 D 233
V 245 S 234
S 246 R 235
A 247 L 236
V 248 I 237
L 249 N 238
D 250 Y 239
T 251 L 240
S 252 Q 260
F 253 R 261
E 254 L 262
E 255 K 263
S 256 E 264
E 257 A 265
R 258 A 266
L 259 E 267
I 260 K 268
I 261 A 269
T 262 K 270
H 263 I 271
G 264 E 272
N 265 L 273
A 266 S 274
V 267 S 275
Y 268 A 276
N 269 Q 277
D 270 Q 278
L 271 T 279
K 272 D 280
E 273 V 281
Q 277 N 282
Y 278 L 283
R 279 P 284
G 280 Y 285
L 281 I 286
D 282 T 287
G 283 A 288
N 284 D 289
T 285 A 290
I 286 T 291
K 287 G 292
T 288 P 293
T 289 K 294
T 290 H 295
A 291 V 300
K 292 T 301
K 293 R 302
L 294 A 303
S 295 K 304
V 296 L 305
I 297 E 306
I 298 S 307
H 299 L 308
A 300 V 309
R 301 E 310
L 302 D 311
R 303 L 312
E 304 V 313
I 305 N 314
M 306 R 315
S 307 S 316
K 308 I 317
S 309 E 318
K 310 L 319
K 311 L 320
F 312 K 321
F 313 V 322
R 314 A 323
E 315 L 324
V 316 Q 325
E 317 D 326
A 318 A 327
E 325 G 328
I 326 L 329
G 327 S 330
I 328 V 331
P 329 S 332
G 330 D 333
G 331 I 334
V 332 D 335
V 333 D 336
L 334 V 337
T 335 I 338
G 336 L 339
G 337 V 340
G 338 G 341
A 339 G 342
K 340 Q 343
I 341 T 344
P 342 R 345
R 343 M 346
I 344 P 347
N 345 M 348
E 346 V 349
L 347 Q 350
A 348 K 351
T 349 K 352
E 350 V 353
V 351 A 354
F 352 E 355
K 353 F 356
S 354 F 357
P 355 G 358
V 356 K 359
R 357 E 360
T 358 P 361
G 359 R 362
C 360 K 363
Y 361 V 365
A 362 N 366
N 363 P 367
S 364 D 368
D 365 E 369
R 366 A 370
P 367 V 371
S 368 A 372
I 369 I 373
I 370 G 374
N 371 A 375
A 372 A 376
D 373 V 377
E 374 Q 378
V 375 G 379
A 376 G 380
N 377 V 381
TER
END

