
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  5
PARENT 1hlu_A
S 162 V 103
I 163 L 104
V 164 L 105
V 165 T 106
P 166 E 107
L 167 A 108
K 168 P 109
V 169 L 110
Y 170 N 111
E 171 P 112
M 172 K 113
F 173 A 114
Y 174 N 115
N 175 R 116
F 176 E 117
L 177 K 118
Q 178 M 119
D 179 T 120
T 180 Q 121
V 181 I 122
Q 186 M 123
L 187 F 124
K 188 E 125
S 189 T 126
S 190 F 127
L 191 N 128
V 192 T 129
S 193 P 130
T 194 A 131
A 195 M 132
E 196 A 135
G 197 I 136
V 198 Q 137
L 199 A 138
T 200 V 139
T 201 L 140
P 202 L 142
E 203 Y 143
K 204 A 144
D 205 S 145
R 206 G 146
G 207 R 147
V 208 T 148
V 209 T 149
V 210 G 150
V 211 I 151
N 212 V 152
L 213 M 153
G 214 D 154
Y 215 S 155
N 216 G 156
F 217 D 157
T 218 G 158
G 219 V 159
L 220 T 160
I 221 H 161
A 222 T 162
Y 223 V 163
K 224 P 164
N 225 I 165
G 226 Y 166
V 227 E 167
P 228 G 168
I 229 Y 169
K 230 A 170
I 231 L 171
S 232 P 172
Y 233 H 173
V 234 A 174
P 235 I 175
V 236 L 176
G 237 R 177
M 238 L 178
K 239 A 181
H 240 G 182
V 241 R 183
I 242 D 184
K 243 L 185
D 244 T 186
V 245 D 187
S 246 Y 188
A 247 L 189
V 248 M 190
L 249 K 191
D 250 I 192
T 251 L 193
S 252 Y 198
F 253 S 199
E 254 F 200
E 255 T 201
S 256 T 202
E 257 T 203
R 258 A 204
L 259 E 205
I 260 R 206
I 261 I 212
T 262 K 213
H 263 E 214
G 264 K 215
N 265 L 216
A 266 C 217
V 267 Y 218
Y 268 V 219
N 269 A 220
D 270 L 221
L 271 D 222
K 272 F 223
E 273 E 224
E 274 Q 225
E 275 E 226
I 276 M 227
Q 277 A 228
Y 278 T 229
R 279 A 230
G 280 A 231
L 281 S 232
D 282 S 233
G 283 S 234
N 284 S 235
T 285 L 236
I 286 E 237
K 287 K 238
T 288 S 239
T 289 Y 240
T 290 E 241
A 291 L 242
K 292 P 243
K 293 D 244
L 294 G 245
S 295 Q 246
V 296 V 247
I 297 I 248
I 298 T 249
H 299 I 250
A 300 G 251
R 301 N 252
L 302 E 253
R 303 R 254
E 304 F 255
I 305 R 256
M 306 C 257
S 307 P 258
K 308 E 259
S 309 A 260
K 310 L 261
K 311 I 274
F 312 H 275
F 313 E 276
R 314 T 277
E 315 T 278
V 316 F 279
E 317 N 280
A 318 S 281
K 319 I 282
I 320 M 283
V 321 K 284
E 322 C 285
E 323 D 286
G 324 V 287
E 325 D 288
I 326 I 289
G 327 R 290
I 328 K 291
P 329 D 292
G 330 L 293
G 331 Y 294
V 332 A 295
V 333 N 296
L 334 T 297
T 335 V 298
G 336 L 299
G 337 S 300
G 338 G 301
A 339 G 302
K 340 T 303
I 341 T 304
P 342 M 305
R 343 Y 306
I 344 P 307
N 345 G 308
E 346 I 309
L 347 A 310
A 348 D 311
T 349 R 312
E 350 M 313
V 351 Q 314
F 352 K 315
K 353 E 316
G 359 I 317
C 360 T 318
Y 361 A 319
A 362 L 320
N 363 A 321
S 364 P 322
D 365 S 323
R 366 T 324
P 367 M 325
S 368 K 326
I 369 I 327
I 370 K 328
N 371 I 329
A 372 I 330
D 373 A 331
E 374 P 332
V 375 P 333
A 376 E 334
N 377 R 335
A 382 K 336
A 383 Y 337
A 384 S 338
F 385 V 339
G 386 W 340
N 387 I 341
V 388 G 342
F 389 G 343
A 390 S 344
V 391 I 345
S 392 L 346
E 393 A 347
N 394 S 348
P 395 L 349
Y 396 S 350
E 397 T 351
E 398 F 352
P 400 Q 353
V 401 Q 354
K 402 M 355
S 403 W 356
E 404 I 357
N 405 S 358
P 406 K 359
L 407 Q 360
K 408 E 361
K 409 Y 362
I 410 D 363
F 411 E 364
R 412 S 365
L 413 G 366
TER
END

