
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1qqo_A
REMARK L 4 M 1
REMARK S 5 S 2
REMARK K 6 K 3
V 8 G 4
F 9 P 5
Y 10 A 6
T 11 V 7
S 12 G 8
I 13 I 9
D 14 D 10
I 15 L 11
G 16 G 12
S 17 T 13
R 18 T 14
Y 19 Y 15
I 20 S 16
K 21 C 17
V 24 V 18
L 25 G 19
G 26 V 20
K 27 F 21
R 28 Q 22
D 29 H 23
Q 30 G 24
E 31 K 25
W 32 V 26
E 33 E 27
A 34 I 28
L 35 I 29
A 36 G 34
F 37 N 35
S 38 R 36
S 39 T 37
V 40 T 38
K 41 P 39
S 42 S 40
R 43 D 53
G 44 A 54
L 45 A 55
D 46 K 56
E 47 N 57
G 48 Q 58
E 49 V 59
I 50 A 60
K 51 M 61
D 52 N 62
A 53 P 63
I 54 T 64
A 55 N 65
F 56 T 66
K 57 V 67
E 58 F 68
S 59 D 69
V 60 A 70
N 61 K 71
T 62 R 72
L 63 L 73
L 64 I 74
K 65 G 75
E 66 R 76
L 67 R 77
E 68 F 78
E 69 D 79
Q 70 D 80
L 71 A 81
Q 72 V 82
K 73 V 83
S 74 Q 84
R 76 S 85
S 77 D 86
D 78 M 87
F 79 K 88
V 80 H 89
I 81 W 90
S 82 P 91
F 83 F 92
S 84 M 93
S 85 V 94
V 86 V 95
S 87 N 96
E 89 D 97
R 90 A 98
E 91 G 99
D 92 R 100
T 93 P 101
V 94 K 102
I 95 V 103
E 96 Q 104
R 97 V 105
D 98 E 106
F 99 Y 107
G 100 K 108
E 101 G 109
E 102 E 110
K 103 T 111
R 104 K 112
S 105 S 113
I 106 F 114
T 107 Y 115
L 108 P 116
D 109 E 117
I 110 E 118
L 111 V 119
S 112 S 120
E 113 S 121
M 114 M 122
Q 115 V 123
L 119 L 124
E 120 T 125
K 121 K 126
L 122 M 127
K 123 K 128
E 124 E 129
N 125 I 130
G 126 A 131
K 127 E 132
T 128 A 133
P 129 Y 134
L 130 L 135
H 131 G 136
REMARK I 132 K 137
I 132 A 137
A 157 T 138
I 158 V 139
E 159 T 140
Y 160 N 141
T 161 A 142
S 162 V 143
I 163 V 144
V 164 T 145
V 165 V 146
P 166 P 147
L 167 A 148
K 168 Y 149
V 169 F 150
Y 170 N 151
E 171 D 152
M 172 S 153
F 173 Q 154
Y 174 R 155
N 175 Q 156
F 176 A 157
L 177 T 158
Q 178 K 159
D 179 D 160
T 180 A 165
V 181 G 166
K 182 L 167
S 183 N 168
P 184 V 169
F 185 L 170
Q 186 R 171
L 187 I 172
K 188 I 173
S 189 N 174
REMARK S 190 E 175
S 190 S 175
L 191 P 176
V 192 T 177
S 193 A 178
T 194 A 179
A 195 A 180
E 196 I 181
G 197 A 182
V 198 Y 183
L 199 G 184
T 200 L 185
T 201 D 186
P 202 V 189
E 203 G 190
K 204 A 191
D 205 E 192
R 206 R 193
G 207 N 194
V 208 V 195
V 209 L 196
V 210 I 197
V 211 F 198
N 212 D 199
L 213 L 200
G 214 G 201
Y 215 G 202
N 216 G 203
F 217 T 204
T 218 F 205
G 219 D 206
L 220 V 207
I 221 S 208
A 222 I 209
Y 223 L 210
K 224 T 211
N 225 I 212
G 226 E 213
V 227 D 214
P 228 G 215
I 229 I 216
K 230 F 217
I 231 A 223
S 232 G 224
Y 233 D 225
V 234 T 226
P 235 H 227
V 236 L 228
G 237 G 229
M 238 G 230
K 239 E 231
H 240 D 232
V 241 F 233
I 242 D 234
K 243 K 251
D 244 D 252
V 245 I 253
S 246 S 254
A 247 E 255
V 248 A 259
L 249 V 260
D 250 R 261
T 251 R 262
S 252 L 263
F 253 R 264
E 254 T 265
E 255 A 266
S 256 C 267
E 257 E 268
R 258 R 269
L 259 A 270
I 260 K 271
I 261 R 272
T 262 T 273
H 263 L 274
G 264 S 275
N 265 S 276
N 269 S 277
D 270 T 278
L 271 Q 279
K 272 A 280
E 273 S 281
E 274 I 282
E 275 E 283
I 276 I 284
Q 277 D 285
Y 278 S 286
R 279 L 287
G 280 Y 288
L 281 E 289
D 282 G 290
G 283 I 291
N 284 D 292
T 285 F 293
I 286 Y 294
K 287 T 295
T 288 S 296
T 289 I 297
T 290 T 298
A 291 R 299
K 292 A 300
K 293 R 301
L 294 F 302
S 295 E 303
V 296 E 304
I 297 L 305
I 298 N 306
H 299 A 307
A 300 D 308
R 301 L 309
L 302 F 310
R 303 R 311
E 304 G 312
I 305 T 313
M 306 L 314
S 307 D 315
K 308 P 316
S 309 V 317
K 310 E 318
K 311 K 319
F 312 A 320
F 313 L 321
R 314 R 322
E 315 D 323
V 316 A 324
E 323 K 325
G 324 L 326
E 325 D 327
I 326 K 328
G 327 S 329
I 328 Q 330
P 329 I 331
G 330 H 332
G 331 D 333
V 332 I 334
V 333 V 335
L 334 L 336
T 335 V 337
G 336 G 338
G 337 G 339
G 338 S 340
A 339 T 341
K 340 R 342
I 341 I 343
P 342 P 344
R 343 K 345
I 344 I 346
N 345 Q 347
E 346 K 348
L 347 L 349
A 348 L 350
T 349 Q 351
E 350 D 352
V 351 F 353
F 352 F 354
K 353 N 355
N 363 G 356
S 364 K 357
D 365 E 358
R 366 L 359
P 367 N 360
S 368 K 361
I 369 S 362
I 370 I 363
N 371 N 364
A 372 P 365
D 373 D 366
E 374 E 367
V 375 A 368
A 376 V 369
S 380 A 370
F 381 Y 371
A 382 G 372
A 383 A 373
A 384 A 374
F 385 V 375
G 386 Q 376
N 387 A 377
V 388 A 378
F 389 I 379
A 390 L 380
V 391 S 381
REMARK S 392 G 382
REMARK E 393 D 383
REMARK N 394 K 384
REMARK P 395 S 385
REMARK Y 396 E 386
TER
END

