
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  5
PARENT 7req_D
I 2 L 129
D 3 E 130
L 4 R 131
S 5 G 132
K 6 V 133
T 7 T 134
V 8 S 135
F 9 L 136
Y 10 L 137
T 11 L 138
S 12 R 139
I 13 V 140
D 14 D 141
I 15 P 142
G 16 D 143
S 17 A 144
R 18 I 145
Y 19 A 146
I 20 P 147
K 21 E 148
G 22 H 149
L 23 L 150
V 24 D 151
L 25 E 152
G 26 V 153
K 27 L 154
R 28 S 155
D 29 D 156
Q 30 V 157
E 31 L 158
W 32 L 159
E 33 E 160
A 34 M 161
L 35 T 162
A 36 K 163
F 37 V 164
S 38 E 165
S 39 V 166
S 42 F 167
R 43 S 168
G 44 R 169
L 45 Y 170
D 46 D 171
E 47 Q 172
G 48 G 173
E 49 A 174
I 50 A 175
K 51 A 176
D 52 E 177
A 53 A 178
I 54 L 179
A 55 V 180
F 56 S 181
K 57 V 182
V 60 Y 183
N 61 E 184
T 62 R 185
L 63 S 186
L 64 D 187
K 65 K 188
E 66 P 189
L 67 A 190
E 68 K 191
E 69 D 192
Q 70 L 193
L 71 A 194
Q 72 L 195
K 73 L 199
S 74 D 200
L 75 P 201
R 76 I 202
S 77 G 203
D 78 F 204
F 79 A 205
V 80 A 206
I 81 L 207
S 82 Q 208
F 83 G 209
S 84 T 210
S 85 E 211
V 86 P 212
S 87 D 213
F 88 L 214
E 89 T 215
R 90 V 216
E 91 L 217
D 92 G 218
T 93 D 219
V 94 W 220
I 95 V 221
E 96 R 222
R 97 R 223
D 98 L 224
F 99 A 225
G 100 K 226
E 101 F 227
E 102 S 228
K 103 P 229
R 104 D 230
S 105 T 235
I 106 I 236
T 107 D 237
L 108 A 238
D 109 N 239
I 110 I 240
L 111 Y 241
S 112 H 242
E 113 N 243
M 114 A 244
Q 115 G 245
S 116 A 246
E 117 G 247
A 118 D 248
L 119 V 249
E 120 A 250
K 121 E 251
L 122 L 252
K 123 A 253
E 124 W 254
N 125 A 255
G 126 A 260
K 127 E 261
T 128 Y 262
P 129 V 263
L 130 R 264
H 131 A 265
I 132 L 266
F 133 V 267
S 134 E 268
K 135 Q 269
R 136 G 270
Y 137 F 271
L 138 T 272
L 139 A 273
D 140 T 274
D 141 E 275
E 142 A 276
R 143 F 277
P 148 T 285
L 149 A 286
D 150 T 287
M 151 H 288
K 152 A 299
A 153 L 300
S 154 R 301
K 155 E 302
I 156 A 303
A 157 W 304
I 158 A 305
E 159 R 306
Y 160 I 307
T 161 G 308
S 162 E 309
I 163 V 310
V 164 F 311
V 165 G 312
P 166 V 313
L 167 D 314
K 168 E 315
V 169 D 316
Y 170 K 317
E 171 R 318
M 172 G 319
F 173 A 320
Y 174 R 321
N 175 Q 322
F 176 N 323
L 177 A 324
Q 178 I 325
D 179 T 326
T 180 S 327
V 181 W 328
K 182 R 329
S 183 N 339
P 184 I 340
F 185 L 341
Q 186 R 342
L 187 G 343
K 188 S 344
S 189 I 345
S 190 A 346
L 191 T 347
V 192 F 348
S 193 S 349
T 194 A 350
A 195 S 351
E 196 V 352
G 197 G 353
P 202 G 354
E 203 A 355
K 204 E 356
D 205 S 357
R 206 I 358
G 207 T 359
V 208 T 360
V 209 L 361
V 210 P 362
V 211 F 363
N 212 T 364
L 213 L 367
G 214 G 368
Y 215 L 369
N 216 P 370
F 217 E 371
T 218 D 372
G 219 D 373
L 220 F 374
I 221 P 375
A 222 V 385
Y 223 L 386
K 224 A 387
N 225 E 388
G 226 E 389
V 227 V 390
P 228 N 391
I 229 I 392
K 230 G 393
I 231 R 394
S 232 V 395
Y 233 N 396
V 234 D 397
P 235 P 398
V 236 A 399
G 237 G 400
M 238 G 401
K 239 E 406
H 240 S 407
V 241 L 408
I 242 T 409
K 243 R 410
D 244 S 411
V 245 L 412
S 246 A 413
A 247 D 414
V 248 A 415
L 249 A 416
D 250 W 417
T 251 K 418
S 252 E 419
F 253 F 420
E 254 Q 421
E 255 E 422
S 256 V 423
E 257 E 424
R 258 K 425
L 259 L 426
I 261 K 431
T 262 A 432
H 263 V 433
G 264 M 434
N 265 T 435
A 266 E 436
V 267 H 437
Y 268 V 438
N 269 T 439
D 270 K 440
L 271 V 441
K 272 L 442
E 273 D 443
E 274 A 444
E 275 K 457
I 276 Q 458
Q 277 P 459
Y 278 I 460
R 279 T 461
G 280 A 462
L 281 M 468
D 282 I 469
G 283 G 470
N 284 A 471
T 285 R 472
I 286 S 473
K 287 I 474
T 288 E 475
T 289 T 476
T 290 K 477
A 291 P 478
K 292 P 483
K 293 A 484
L 294 R 485
S 295 K 486
V 296 G 487
I 297 L 488
I 298 A 489
H 299 W 490
A 300 H 491
R 301 R 492
L 302 D 493
R 303 S 494
E 304 E 495
I 305 V 496
M 306 F 497
S 307 E 498
K 308 Q 499
S 309 L 500
K 310 M 501
K 311 D 502
F 312 R 503
F 313 S 504
R 314 T 505
E 315 S 506
V 316 V 507
E 317 S 508
A 318 E 509
K 319 R 510
I 320 L 515
V 321 A 516
E 322 C 517
E 323 L 518
G 324 G 519
E 325 T 520
I 326 R 521
G 327 R 522
I 328 D 523
P 329 F 524
G 330 G 525
G 331 G 526
T 335 E 528
G 336 G 529
G 337 F 530
G 338 S 531
A 339 S 532
K 340 P 533
I 341 V 534
P 342 G 547
R 343 G 548
I 344 T 549
N 345 T 550
E 346 A 551
L 347 E 552
A 348 I 553
T 349 V 554
E 350 E 555
V 351 A 556
F 352 F 557
K 353 K 558
S 354 K 559
P 355 S 560
V 356 G 561
R 357 A 562
T 358 V 564
G 359 A 565
C 360 D 566
Y 361 L 567
A 362 C 568
N 363 S 569
S 364 S 570
D 365 A 571
R 366 K 572
P 367 V 573
S 368 Y 574
I 369 A 575
I 370 Q 576
N 371 Q 577
A 372 G 578
D 373 L 579
E 374 E 580
V 375 V 581
A 376 A 582
N 377 K 583
D 378 A 584
P 379 L 585
S 380 K 586
F 381 A 587
A 382 A 588
A 383 G 589
A 384 A 590
F 385 K 591
G 386 A 592
N 387 L 593
V 388 Y 594
F 389 L 595
A 390 S 596
V 391 G 597
S 392 A 598
E 393 F 599
N 394 K 600
P 395 E 601
Y 396 F 602
E 397 G 603
E 398 D 604
S 403 D 605
E 404 A 606
N 405 A 607
P 406 E 608
L 407 A 609
K 408 E 610
K 409 K 611
I 410 L 612
F 411 I 613
R 412 D 614
TER
END

