
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  1
PARENT 1ayl
I   2    E   11
D   3    L   12
L   4    E   13
S   5    A   14
K   6    Y   15
T   7    G   16
V   8    I   17
F   9    S   18
Y  10    D   19
T  11    V   20
S  12    H   21
I  13    D   22
D  14    I   23
I  15    V   24
G  16    Y   25
S  17    N   26
R  18    P   27
Y  19    S   28
I  20    Y   29
K  21    D   30
G  22    L   31
L  23    L   32
V  24    Y   33
L  25    Q   34
G  26    E   35
K  27    E   36
R  28    L   37
D  29    D   38
Q  30    P   39
E  31    S   40
W  32    L   41
E  33    T   42
A  34    G   43
L  35    Y   44
A  36    E   45
F  37    R   46
S  38    G   47
S  39    V   48
V  40    L   49
K  41    T   50
S  42    N   51
R  43    L   52
G  44    G   53
L  45    A   54
D  46    V   55
E  47    A   56
G  48    V   57
E  49    D   58
I  50    T   59
K  51    G   60
D  52    I   61
A  53    F   62
I  54    T   63
A  55    G   64
F  56    R   65
K  57    S   66
E  58    P   67
S  59    K   68
K  65    S   98
E  66    P   99
L  67    E  100
E  68    T  101
E  69    W  102
Q  70    Q  103
L  71    H  104
L  75    G  107
R  76    L  108
S  77    V  109
D  78    T  110
F  79    R  111
V  80    Q  112
I  81    L  113
S  82    S  114
F  83    G  115
S  84    K  116
S  85    R  117
V  86    L  118
S  87    F  119
F  88    V  120
E  89    V  121
R  90    D  122
E  91    A  123
D  92    F  124
T  93    C  125
V  94    G  126
I  95    A  127
E  96    N  128
R  97    P  129
D  98    D  130
F  99    T  131
G 100    R  132
E 101    L  133
E 102    S  134
K 103    V  135
R 104    R  136
S 105    F  137
I 106    I  138
T 107    T  139
L 108    E  140
D 109    V  141
I 110    A  142
L 111    W  143
S 112    Q  144
E 113    A  145
M 114    H  146
Q 115    F  147
S 116    V  148
E 117    K  149
A 118    N  150
L 119    M  151
E 120    F  152
K 121    I  153
L 122    R  154
K 123    P  155
E 124    S  156
N 125    D  157
G 126    E  158
L 130    A  161
H 131    G  162
I 132    F  163
F 133    K  164
S 134    P  165
K 135    D  166
R 136    F  167
Y 137    I  168
L 138    V  169
L 139    M  170
D 140    N  171
D 141    G  172
E 142    A  173
R 143    K  174
I 144    C  175
V 145    T  176
F 146    N  177
N 147    P  178
P 148    Q  179
A 153    E  182
S 154    Q  183
K 155    G  184
I 156    L  185
A 157    N  186
I 158    S  187
E 159    E  188
Y 160    N  189
T 161    F  190
S 162    V  191
I 163    A  192
V 164    F  193
V 165    N  194
P 166    L  195
L 167    T  196
K 168    E  197
M 172    M  218
F 173    M  219
Y 174    N  220
N 175    Y  221
F 176    L  222
L 177    L  223
Q 178    P  224
D 179    L  225
T 180    K  226
V 181    G  227
K 182    I  228
S 183    A  229
P 184    S  230
F 185    M  231
Q 186    H  232
L 187    C  233
K 188    S  234
S 189    A  235
S 190    N  236
L 191    V  237
V 192    G  238
S 193    E  239
T 194    K  240
A 195    G  241
E 196    D  242
T 201    D  275
P 202    D  276
E 203    G  277
K 204    V  278
D 205    F  279
R 206    N  280
G 207    F  281
V 208    E  282
V 209    G  283
V 210    G  284
V 211    C  285
N 212    Y  286
L 213    A  287
G 214    K  288
Y 215    T  289
N 216    I  290
F 217    K  291
T 218    L  292
G 219    S  293
L 220    K  294
I 221    E  295
A 222    A  296
Y 223    E  297
K 224    P  298
N 225    E  299
G 226    I  300
V 227    Y  301
P 228    N  302
I 229    A  303
K 230    I  304
I 231    R  305
S 232    R  306
Y 233    D  307
V 234    A  308
P 235    L  309
V 236    L  310
G 237    E  311
M 238    N  312
K 239    V  313
H 240    T  314
V 241    V  315
I 242    R  316
K 243    E  317
D 244    D  318
V 245    G  319
S 246    T  320
D 250    F  323
T 251    D  324
S 252    D  325
F 253    G  326
E 254    S  327
E 255    K  328
S 256    T  329
E 257    E  330
R 258    N  331
L 259    T  332
I 260    R  333
I 261    V  334
T 262    S  335
H 263    Y  336
G 264    P  337
N 265    I  338
A 266    Y  339
V 267    H  340
Y 268    I  341
N 269    D  342
D 270    N  343
L 271    I  344
K 272    V  345
E 273    K  346
E 274    P  347
E 275    V  348
I 276    S  349
Q 277    K  350
Y 278    A  351
R 279    G  352
G 280    H  353
L 281    A  354
D 282    T  355
G 283    K  356
N 284    V  357
T 285    I  358
I 286    F  359
K 287    L  360
T 288    T  361
T 289    A  362
T 290    D  363
A 291    A  364
K 292    F  365
K 293    G  366
L 294    V  367
S 295    L  368
V 296    P  369
I 297    P  370
I 298    V  371
H 299    S  372
A 300    R  373
R 301    L  374
L 302    T  375
R 303    A  376
E 304    D  377
S 309    Q  380
F 313    V  424
E 317    K  427
E 322    G  433
E 323    A  434
G 324    Q  435
E 325    A  436
I 326    Y  437
G 327    L  438
I 328    V  439
P 329    N  440
G 330    T  441
G 331    G  442
V 332    W  443
V 333    N  444
L 334    G  445
T 335    T  446
G 336    G  447
G 337    K  448
G 338    R  449
A 339    I  450
K 340    S  451
I 344    D  454
N 345    T  455
E 346    R  456
L 347    A  457
A 348    I  458
T 349    I  459
E 350    D  460
V 351    A  461
F 352    I  462
K 353    L  463
S 354    N  464
P 355    G  465
V 356    S  466
R 357    L  467
T 358    D  468
G 359    N  469
C 360    A  470
Y 361    E  471
A 362    T  472
P 367    T  484
S 368    E  485
I 369    L  486
I 370    P  487
N 371    G  488
A 372    V  489
D 373    D  490
E 374    T  491
V 375    K  492
A 376    I  493
N 377    L  494
D 378    D  495
P 379    P  496
S 380    R  497
F 381    N  498
A 382    T  499
A 383    Y  500
A 384    A  501
F 385    S  502
G 386    P  503
N 387    E  504
V 388    Q  505
F 389    W  506
A 390    Q  507
V 391    E  508
P 395    E  511
T 399    F  517
S 403    N  520
E 404    F  521
N 405    D  522
P 406    K  523
L 407    Y  524
K 408    T  525
K 409    D  526
I 410    T  527
F 411    P  528
R 412    A  529
E 416    A  532
L 417    L  533
M 418    V  534
E 419    A  535
TER
END


