
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  3
PARENT 1ao6_A
I   2    A   21
D   3    L   22
L   4    V   23
S   5    L   24
K   6    I   25
T   7    A   26
V   8    F   27
F   9    A   28
Y  10    Q   29
T  11    Y   30
S  12    L   31
I  13    Q   32
D  14    Q   33
I  15    C   34
G  16    P   35
S  17    F   36
R  18    E   37
Y  19    D   38
I  20    H   39
K  21    V   40
G  22    K   41
L  23    L   42
V  24    V   43
L  25    N   44
G  26    E   45
K  27    V   46
R  28    T   47
D  29    E   48
Q  30    F   49
E  31    A   50
W  32    K   51
F  37    V   54
S  38    A   55
S  39    D   56
V  40    E   57
K  41    S   58
S  42    A   59
R  43    E   60
G  44    N   61
L  45    C   62
D  46    D   63
E  47    K   64
G  48    S   65
E  49    L   66
A  53    L   69
I  54    F   70
A  55    G   71
F  56    D   72
K  57    K   73
E  58    L   74
S  59    C   75
L  63    N   99
L  64    E  100
K  65    C  101
E  66    F  102
L  67    L  103
E  68    Q  104
E  69    H  105
Q  70    K  106
L  71    D  107
Q  72    D  108
K  73    N  109
S  74    P  110
L  75    N  111
R  76    L  112
S  77    P  113
D  78    R  114
F  79    L  115
V  80    V  116
I  81    R  117
S  82    P  118
F  83    E  119
S  84    V  120
F  88    M  123
D  92    E  132
E  96    L  135
G 100    Y  138
R 104    K  162
D 109    C  177
I 110    L  178
L 111    L  179
S 112    P  180
E 113    K  181
M 114    L  182
Q 115    D  183
S 116    E  184
E 117    L  185
A 118    R  186
L 119    D  187
E 120    E  188
K 121    G  189
N 125    S  192
P 129    K  195
F 133    L  198
S 134    K  199
K 135    C  200
R 136    A  201
D 140    Q  204
D 141    K  205
E 142    F  206
R 143    G  207
N 147    A  210
K 152    A  213
A 153    W  214
S 154    A  215
K 155    V  216
I 156    A  217
A 157    R  218
I 158    L  219
E 159    S  220
Y 160    Q  221
T 161    R  222
S 162    F  223
I 163    P  224
V 164    K  225
V 165    A  226
P 166    E  227
L 167    F  228
K 168    A  229
V 169    E  230
Y 170    V  231
E 171    S  232
M 172    K  233
F 173    L  234
Y 174    V  235
N 175    T  236
F 176    D  237
L 177    L  238
Q 178    T  239
D 179    K  240
T 180    V  241
V 181    H  242
K 182    T  243
S 183    E  244
P 184    C  245
F 185    C  246
Q 186    H  247
L 187    G  248
K 188    D  249
S 189    L  250
S 190    L  251
L 191    E  252
V 192    C  253
S 193    A  254
T 194    D  255
A 195    D  256
E 196    R  257
G 197    A  258
T 201    H  288
P 202    C  289
E 203    I  290
K 204    A  291
D 205    E  292
R 206    V  293
G 207    E  294
V 208    N  295
V 209    D  296
V 210    E  297
V 211    M  298
N 212    P  299
L 213    A  300
G 214    D  301
Y 215    L  302
N 216    P  303
F 217    S  304
T 218    L  305
G 219    A  306
N 225    E  321
G 226    A  322
V 227    K  323
P 228    D  324
Y 233    E  333
V 234    Y  334
P 235    A  335
V 236    R  336
G 237    R  337
M 238    H  338
K 239    P  339
H 240    D  340
V 241    Y  341
I 242    S  342
K 243    V  343
D 244    V  344
V 245    L  345
S 246    L  346
A 247    L  347
V 248    R  348
L 249    L  349
D 250    A  350
T 251    K  351
S 252    T  352
F 253    Y  353
E 254    E  354
E 255    T  355
S 256    T  356
E 257    L  357
R 258    E  358
L 259    K  359
I 260    C  360
I 261    C  361
T 262    A  362
H 263    A  363
G 264    A  364
N 265    D  365
A 266    P  366
V 267    H  367
Y 268    E  368
N 269    C  369
D 270    Y  370
L 271    A  371
K 272    K  372
E 273    V  373
E 274    F  374
E 275    D  375
I 276    E  376
Q 277    F  377
Y 278    K  378
R 279    P  379
G 280    L  380
L 281    V  381
T 285    L  387
T 290    E  396
A 291    Q  397
K 292    L  398
K 293    G  399
L 294    E  400
S 295    Y  401
V 296    K  402
I 297    F  403
I 298    Q  404
H 299    N  405
A 300    A  406
R 301    L  407
L 302    L  408
R 303    V  409
E 304    R  410
I 305    Y  411
S 309    V  426
F 313    V  456
E 317    V  462
V 321    E  465
E 322    K  466
E 323    T  467
G 324    P  468
E 325    V  469
I 326    S  470
G 327    D  471
V 333    S  489
L 334    A  490
T 335    L  491
G 336    E  492
G 337    V  493
G 338    D  494
A 339    E  495
K 340    T  496
I 341    Y  497
P 342    V  498
R 343    P  499
I 344    K  500
N 345    E  501
E 346    F  502
L 347    N  503
A 348    A  504
T 349    E  505
E 350    T  506
V 351    F  507
F 352    T  508
K 353    F  509
S 354    H  510
P 355    A  511
V 356    D  512
R 357    I  513
T 358    C  514
G 359    T  515
C 360    L  516
Y 361    S  517
A 362    E  518
N 363    K  519
P 367    K  525
S 368    Q  526
I 369    T  527
I 370    A  528
E 374    P  537
V 375    K  538
A 376    A  539
N 377    T  540
D 378    K  541
P 379    E  542
S 380    Q  543
F 381    L  544
A 382    K  545
A 383    A  546
A 384    V  547
F 385    M  548
G 386    D  549
N 387    D  550
V 388    F  551
F 389    A  552
E 393    V  555
N 394    E  556
P 395    K  557
Y 396    C  558
E 397    C  559
E 398    K  560
T 399    A  561
P 400    D  562
V 401    D  563
K 402    K  564
S 403    E  565
E 404    T  566
N 405    C  567
K 409    E  570
I 410    E  571
F 411    G  572
R 412    K  573
E 416    V  576
L 417    A  577
M 418    A  578
E 419    S  579
TER
END


