
PFRMAT AL
TARGET T0089
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  5
PARENT 1kax
M   1    V    7
I   2    G    8
D   3    I    9
L   4    D   10
S   5    L   11
K   6    G   12
T   7    T   13
V   8    T   14
F   9    Y   15
Y  10    S   16
T  11    C   17
S  12    V   18
I  13    G   19
D  14    V   20
I  15    F   21
G  16    Q   22
S  17    H   23
R  18    G   24
Y  19    K   25
I  20    V   26
K  21    E   27
G  22    I   28
L  23    I   29
V  24    A   30
L  25    N   31
G  26    D   32
K  27    Q   33
R  28    G   34
D  29    N   35
Q  30    R   36
E  31    T   37
W  32    T   38
E  33    P   39
A  34    S   40
L  35    Y   41
A  36    V   42
F  37    A   43
S  38    F   44
S  39    T   45
V  40    D   46
K  41    T   47
S  42    E   48
R  43    R   49
G  44    L   50
L  45    I   51
D  46    G   52
E  47    D   53
A  53    K   56
I  54    N   57
A  55    Q   58
F  56    V   59
K  57    A   60
E  58    M   61
S  59    N   62
V  60    P   63
N  61    T   64
T  62    N   65
L  63    T   66
L  64    V   67
K  65    F   68
E  66    D   69
L  67    A   70
E  68    M   71
E  69    R   72
Q  70    L   73
L  71    I   74
Q  72    G   75
K  73    R   76
S  74    R   77
L  75    F   78
R  76    D   79
S  77    D   80
S  82    V   83
V  86    D   86
S  87    M   87
F  88    K   88
E  89    H   89
R  90    W   90
E  91    P   91
D  92    F   92
T  93    M   93
V  94    V   94
I  95    V   95
E 102    A   98
K 103    G   99
R 104    R  100
S 105    P  101
I 106    K  102
T 107    V  103
L 108    Q  104
L 119    Y  107
N 125    E  110
P 129    S  113
L 130    F  114
H 131    Y  115
I 132    P  116
F 133    E  117
S 134    E  118
K 135    V  119
R 136    S  120
Y 137    S  121
L 138    M  122
L 139    V  123
D 140    L  124
D 141    T  125
F 146    Y  134
N 147    L  135
P 148    G  136
L 149    K  137
D 150    T  138
M 151    V  139
K 152    T  140
A 153    N  141
S 154    A  142
K 155    V  143
I 156    V  144
A 157    T  145
I 158    V  146
E 159    P  147
Y 160    A  148
T 161    Y  149
S 162    F  150
I 163    N  151
V 164    D  152
Y 170    R  155
E 171    Q  156
M 172    A  157
F 173    T  158
Y 174    K  159
N 175    D  160
F 176    A  161
L 177    G  162
Q 178    T  163
D 179    I  164
T 180    A  165
V 181    G  166
K 182    L  167
S 183    N  168
P 184    V  169
F 185    L  170
Q 186    R  171
L 187    I  172
K 188    I  173
S 189    N  174
S 190    E  175
L 191    P  176
V 192    T  177
S 193    A  178
T 194    A  179
A 195    A  180
E 196    I  181
G 197    A  182
V 198    Y  183
L 199    G  184
T 200    L  185
T 201    D  186
P 202    K  187
E 203    K  188
K 204    V  189
D 205    G  190
R 206    A  191
G 207    E  192
V 208    R  193
V 209    N  194
V 210    V  195
V 211    L  196
N 212    I  197
L 213    F  198
G 214    D  199
Y 215    L  200
N 216    G  201
F 217    G  202
T 218    G  203
I 229    D  206
K 230    V  207
I 231    S  208
S 232    I  209
Y 233    L  210
V 234    T  211
P 235    I  212
V 236    E  213
G 237    D  214
M 238    G  215
K 239    I  216
H 240    F  217
V 241    E  218
I 242    V  219
K 243    K  220
D 244    S  221
V 245    T  222
S 246    A  223
A 247    G  224
V 248    D  225
L 249    T  226
D 250    H  227
T 251    L  228
S 252    G  229
F 253    G  230
E 254    E  231
E 255    D  232
S 256    F  233
E 257    D  234
R 258    N  235
L 259    R  236
H 263    N  239
L 271    I  242
K 272    A  243
E 273    E  244
E 274    F  245
I 286    K  248
K 287    H  249
T 288    K  250
T 289    K  251
T 290    D  252
A 291    I  253
K 292    S  254
K 293    E  255
L 294    N  256
S 295    K  257
V 296    R  258
I 297    A  259
I 298    V  260
H 299    R  261
A 300    R  262
R 301    L  263
L 302    R  264
R 303    T  265
E 304    A  266
S 309    R  269
F 313    R  272
E 317    S  275
E 322    S  281
E 323    I  282
G 324    E  283
E 325    I  284
I 326    D  285
G 327    S  286
I 328    L  287
P 329    Y  288
G 330    E  289
G 331    G  290
V 332    I  291
V 333    D  292
L 334    F  293
T 335    Y  294
G 336    T  295
G 337    S  296
I 341    R  299
P 342    A  300
R 343    R  301
I 344    F  302
N 345    E  303
E 346    E  304
L 347    L  305
A 348    N  306
T 349    A  307
E 350    D  308
S 354    R  311
P 355    G  312
V 356    T  313
R 357    L  314
A 362    D  323
N 363    A  324
S 364    K  325
D 365    L  326
R 366    D  327
P 367    K  328
S 368    S  329
A 372    H  332
D 373    D  333
E 374    I  334
V 375    V  335
A 376    L  336
N 377    V  337
D 378    G  338
P 379    G  339
S 380    S  340
F 381    T  341
A 382    R  342
A 383    I  343
A 384    P  344
F 385    K  345
G 386    I  346
N 387    Q  347
V 388    K  348
F 389    L  349
A 390    L  350
V 391    Q  351
S 392    D  352
E 393    F  353
N 394    F  354
P 395    N  355
Y 396    G  356
E 397    K  357
E 398    E  358
T 399    L  359
P 400    N  360
V 401    K  361
K 402    S  362
S 403    I  363
E 404    N  364
N 405    P  365
P 406    D  366
L 407    E  367
K 408    A  368
K 409    V  369
I 410    A  370
F 411    Y  371
R 412    G  372
L 413    A  373
F 414    A  374
K 415    V  375
E 416    Q  376
L 417    A  377
M 418    A  378
E 419    I  379
TER
END


