


PFRMAT AL
TARGET T0095
AUTHOR 9885-9936-6780
METHOD Smith-Waterman alignment of
METHOD secondary structure annotated
METHOD sequence.
MODEL 1
PARENT 1qjb_B
G  411   M    1
N  412   D    2
E  413   K    3
K  414   N    4
E  415   E    5
V  416   L    6
K  417   V    7
E  418   Q    8
Y  419   K    9
A  420   A   10
Q  421   K   11
V  422   L   12
F  423   A   13
E  425   E   14
H  426   E   17
A  427   Y   19
N  428   D   20
K  429   D   21
L  430   M   22
I  431   A   23
E  432   A   24
V  433   C   25
A  434   M   26
N  435   K   27
L  436   S   28
A  437   V   29
C  438   T   30
S  439   E   31
I  440   Q   32
S  441   G   33
N  442   L   36
N  443   S   37
E  444   N   38
E  445   E   39
G  446   E   40
V  447   R   41
K  448   N   42
L  449   L   43
V  450   L   44
R  451   S   45
M  452   V   46
S  453   A   47
A  454   Y   48
S  455   K   49
Q  456   N   50
L  457   V   51
E  458   V   52
A  459   A   54
L  460   R   55
P  462   R   56
Q  463   S   57
V  464   S   58
I  465   W   59
N  466   R   60
A  467   V   61
A  468   V   62
L  469   S   63
A  470   S   64
L  471   I   65
A  472   E   66
A  473   Q   67
K  474   K   68
P  475   T   69
Q  476   E   70
S  477   A   72
K  478   E   73
L  479   K   74
A  480   K   75
Q  481   Q   76
E  482   Q   77
N  483   M   78
M  484   A   79
D  485   R   80
L  486   E   81
F  487   Y   82
K  488   R   83
E  489   E   84
Q  490   K   85
W  491   I   86
E  492   E   87
K  493   T   88
Q  494   E   89
V  495   L   90
R  496   R   91
V  497   I   93
L  498   C   94
T  499   N   95
D  500   D   96
A  501   V   97
V  502   L   98
D  503   S   99
D  504   L  100
I  505   L  101
T  506   E  102
S  507   K  103
I  508   L  105
D  509   I  106
D  510   P  107
F  511   N  108
L  512   Q  111
A  513   A  112
V  514   E  113
S  515   S  114
E  516   K  115
N  517   V  116
H  518   F  117
I  519   Y  118
L  520   L  119
E  521   K  122
D  522   D  124
V  523   Y  125
N  524   Y  126
K  525   R  127
C  526   Y  128
V  527   V  132
A  529   A  133
Q  531   A  134
E  532   G  135
K  533   D  136
D  534   D  137
V  535   K  138
D  536   K  139
G  537   G  140
L  538   V  142
D  539   D  143
R  540   Q  144
T  541   S  145
A  542   Q  146
G  543   Q  147
A  544   A  148
I  545   Y  149
R  546   Q  150
R  548   E  151
A  549   A  152
A  550   F  153
R  551   E  154
V  555   I  155
V  556   S  156
T  557   K  157
S  558   K  158
E  559   E  159
M  560   M  160
D  561   Q  161
Y  563   P  162
E  564   T  163
P  565   H  164
G  566   P  165
V  567   I  166
Y  568   R  167
T  569   L  168
E  570   G  169
K  571   L  170
V  572   A  171
L  573   L  172
E  574   N  173
A  575   F  174
K  577   S  175
L  578   V  176
L  579   F  177
S  580   Y  178
N  581   Y  179
T  582   E  180
V  583   I  181
M  584   S  184
P  585   P  185
R  586   E  186
F  587   K  187
T  588   A  188
E  589   C  189
Q  590   S  190
V  591   L  191
E  592   A  192
A  593   K  193
A  594   T  194
V  595   A  195
E  596   F  196
A  597   D  197
L  598   E  198
S  599   A  199
S  600   I  200
D  601   A  201
P  602   E  202
A  603   L  203
Q  604   L  206
P  605   S  207
M  606   E  208
D  607   E  209
E  608   S  210
F  611   Y  211
I  612   K  212
D  613   D  213
S  615   S  214
R  616   T  215
L  617   L  216
V  618   I  217
Y  619   M  218
D  620   Q  219
G  621   L  220
I  622   L  221
R  623   R  222
D  624   D  223
I  625   N  224
R  626   L  225
K  627   T  226
A  628   L  227
V  629   W  228
L  630   T  229
M  631   S  230
TER
END
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Ajay K. Royyuru, PhD                   Phone: (914) 945-1335
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