
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 7023-8870-2129
METHOD SENSER identified a relationship between the target and
METHOD pectate lyase in the trailing end searches. A multiple
METHOD sequence alignment of the target sequence, a truncated
METHOD 1pcl and 16 other family members was generated using
METHOD clustalw with default parameters. 1plc was truncated
METHOD to remove the non-beta helix N- and C- terminus.
MODEL 1
PARENT 1pcl
N  29    K  26
A  30    A  27
V  31    V  28
V  32    E  29
S  33    V  30
K  34    K  31
S  35    N  32
S  36    I  33
S  37    S  34
D  38    D  35
G  39    F  36
K  40    K  37
T  41    K  38
F  42    A  39
K  43    L  40
T  44    N  41
I  45    G  42
A  46    T  43
D  47    D  44
A  48    S  45
I  49    S  46
A  50    A  47
S  51    K  48
A  52    I  49
P  53    I  50
A  54    K  51
G  55    V  52
S  56    T  53
T  57    G  54
P  58    P  55
F  59    I  56
V  60    D  57
I  61    I  58
L  62    S  59
I  63    G  60
K  64    G  61
N  65    K  62
G  66    A  63
V  67    Y  64
Y  68    T  65
N  69    S  66
E  70    F  67
R  71    D  68
L  72    D  69
T  73    Q  70
I  74    K  71
T  75    A  72
R  76    R  73
N  77    S  74
N  78    Q  75
L  79    I  76
H  80    S  77
L  81    I  78
K  82    P  79
G  83    S  80
N  87    N  81
G  88    T  82
A  89    T  83
V  90    I  84
I  91    I  85
A  92    G  86
A  93    V  87
A  94    G  88
S 102    S  89
D 103    N  90
G 104    G  91
S 105    K  92
T 109    F  93
A 110    T  94
G 111    N  95
S 112    G  96
S 113    S  97
T 114    L  98
I 115    V  99
T 116    I 100
I 117    K 101
S 118    G 102
A 119    V 103
K 120    K 104
D 121    N 105
F 122    V 106
S 123    I 107
A 124    L 108
Q 125    R 109
S 126    N 110
L 127    L 111
T 128    Y 112
I 129    I 113
R 130    E 114
N 131    T 115
D 132    P 116
F 133    V 117
D 134    D 118
F 135    V 119
P 136    A 120
A 137    P 121
N 138    H 122
Q 139    Y 123
A 140    E 124
K 141    S 125
S 142    G 126
D 143    D 127
S 144    G 128
S 146    W 129
S 147    N 130
K 148    A 131
I 149    E 132
K 150    W 133
D 151    D 134
T 152    A 135
Q 153    A 136
A 154    V 137
V 155    I 138
A 156    D 139
L 157    N 140
Y 158    S 141
V 159    T 142
T 160    N 143
K 161    V 144
S 162    W 145
G 163    V 146
D 164    D 147
R 165    H 148
A 166    V 149
Y 167    T 150
F 168    I 151
K 169    S 152
D 170    D 153
V 171    G 154
S 172    S 155
L 173    F 156
V 174    T 157
Q 177    D 158
D 178    D 159
T 179    K 160
L 180    Y 161
Y 181    T 162
V 182    T 163
S 183    K 164
G 184    D 165
G 185    G 166
R 186    E 167
S 190    K 168
D 191    Y 169
C 192    V 170
R 193    Q 171
I 194    H 172
S 195    D 173
G 196    G 174
T 197    A 175
V 198    L 176
D 199    D 177
F 200    I 178
I 201    K 179
F 202    K 180
G 203    G 181
D 204    S 182
G 205    D 183
T 206    Y 184
A 207    V 185
L 208    T 186
F 209    I 187
N 210    S 188
V 215    Y 189
S 216    S 190
R 217    R 191
Y 218    F 192
R 219    E 193
A 220    L 194
D 221    H 195
V 222    D 196
K 223    K 197
S 224    T 198
N 226    I 199
V 227    L 200
S 228    I 201
G 229    G 202
Y 230    H 203
L 231    S 204
T 232    D 205
A 233    S 206
P 234    N 207
S 235    G 208
T 236    S 209
N 237    Q 210
I 238    D 211
N 239    S 212
Q 240    G 213
K 241    K 214
Y 242    L 215
G 243    R 216
L 244    V 217
V 245    T 218
I 246    F 219
T 247    H 220
N 248    N 221
S 249    N 222
R 250    V 223
V 251    F 224
I 252    D 225
R 253    R 226
E 254    V 227
S 255    T 228
D 256    E 229
S 257    R 230
V 258    A 231
P 259    P 232
A 260    R 233
K 261    V 234
S 262    R 235
Y 263    F 236
G 264    G 237
L 265    S 238
G 266    I 239
R 267    H 240
P 268    A 241
W 269    Y 242
H 270    N 243
P 271    N 244
T 272    V 245
T 273    Y 246
T 274    L 247
F 275    G 248
S 276    D 249
D 277    V 250
G 278    K 251
R 279    H 252
Y 280    S 253
A 281    V 254
D 282    Y 255
P 283    P 256
N 284    Y 257
A 285    L 258
I 286    Y 259
G 287    S 260
Q 288    F 261
T 289    G 262
V 290    L 263
F 291    G 264
L 292    T 265
N 293    S 266
T 294    G 267
S 295    S 268
M 296    I 269
D 297    L 270
N 298    S 271
H 299    E 272
I 300    S 273
Y 301    N 274
G 302    S 275
W 303    F 276
D 304    T 277
K 305    L 278
M 306    S 279
S 307    N 280
G 308    L 281
K 309    K 282
D 310    S 283
K 311    I 284
N 312    D 285
G 313    G 286
F 318    K 287
N 319    N 288
P 320    P 289
E 321    E 290
D 322    C 291
S 323    S 292
R 324    I 293
F 325    V 294
F 326    K 295
E 327    Q 296
Y 328    F 297
K 329    N 298
S 330    S 299
Y 331    K 300
V 337    V 301
S 338    F 302
K 339    S 303
D 340    D 304
R 341    K 305
R 342    G 306
Q 343    S 307
L 344    L 308
T 345    V 309
D 346    N 310
A 347    G 311
Q 348    S 312
A 349    T 313
A 350    T 314
E 351    T 315
Y 352    K 316
T 353    L 317
Q 354    D 318
S 355    T 319
K 356    C 320
V 357    G 321
L 358    L 322
G 359    T 323
D 360    A 324
W 361    Y 325
T 362    K 326
TER
END



