
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  3
PARENT 1bn8_A
A 25 A 1
T 26 D 2
T 27 L 3
Y 28 G 4
N 29 H 5
A 30 Q 6
V 31 T 7
V 32 G 9
S 33 S 10
K 34 N 11
S 35 D 12
S 36 G 13
S 37 T 22
D 38 G 23
G 39 G 24
K 40 S 25
T 41 T 34
F 42 V 35
K 43 S 36
T 44 N 37
I 45 R 38
A 46 N 39
D 47 Q 40
A 48 L 41
I 49 V 42
A 50 S 43
S 51 A 44
A 52 K 47
P 53 E 48
A 54 T 49
G 55 N 50
S 56 T 51
T 57 T 52
P 58 P 53
F 59 K 54
V 60 I 55
I 61 I 56
L 62 Y 57
I 63 I 58
K 64 K 59
G 66 G 60
V 67 T 61
N 69 R 120
E 70 V 121
R 71 M 122
L 72 V 123
T 73 D 124
I 74 I 125
T 75 P 126
N 77 A 127
N 78 N 128
L 79 T 129
H 80 T 130
L 81 I 131
K 82 V 132
G 83 G 133
E 84 S 134
S 85 G 135
R 86 T 136
N 87 N 137
G 88 A 138
A 89 K 139
V 90 V 140
I 91 V 141
A 92 G 142
A 93 G 143
A 94 N 144
I 115 F 145
T 116 Q 146
I 117 I 147
S 118 K 148
A 119 S 149
K 120 D 150
D 121 N 151
F 122 V 152
S 123 I 153
A 124 I 154
Q 125 R 155
S 126 N 156
L 127 I 157
T 128 E 158
I 129 F 159
R 130 Q 160
N 131 D 161
D 132 A 162
F 133 Y 163
D 134 D 164
F 135 Y 165
P 136 F 166
A 137 P 167
N 138 Q 168
Q 139 W 169
A 140 D 170
K 141 P 171
S 142 T 172
D 143 D 173
S 144 G 174
D 145 S 175
S 146 S 176
S 147 G 177
K 148 N 178
D 151 N 180
T 152 S 181
Q 153 Q 182
A 154 Y 183
V 155 D 184
A 156 N 185
L 157 I 186
Y 158 T 187
V 159 I 188
T 160 N 189
K 161 G 190
S 162 G 191
G 163 T 192
D 164 D 197
R 165 H 198
A 166 C 199
Y 167 T 200
F 168 F 201
K 169 N 202
D 170 D 203
V 171 G 204
S 172 S 205
L 173 R 206
V 174 P 207
G 175 D 208
Y 176 S 209
Q 177 T 210
D 178 S 211
T 179 P 212
L 180 K 213
Y 181 Y 214
V 182 Y 215
S 183 G 216
G 184 R 217
G 185 K 218
R 186 Y 219
S 187 Q 220
F 188 H 221
F 189 H 222
S 195 D 223
G 196 G 224
T 197 Q 225
V 198 T 226
D 199 D 227
F 200 A 228
I 201 S 229
F 202 N 230
G 203 G 231
G 205 A 232
T 206 N 233
A 207 Y 234
L 208 I 235
F 209 Y 242
N 210 H 243
N 211 D 244
C 212 H 245
D 213 D 246
L 214 K 247
V 215 S 248
S 216 S 249
R 217 I 250
Y 218 F 251
R 219 G 252
A 220 S 253
D 221 S 254
V 222 D 255
K 223 S 256
S 224 K 257
G 225 T 258
N 226 S 259
V 227 K 263
S 228 L 264
G 229 K 265
Y 230 I 266
L 231 T 267
T 232 L 268
A 233 H 269
P 234 V 277
S 235 Q 278
T 236 R 279
N 237 A 280
I 238 P 281
N 239 R 282
Q 240 V 283
K 241 R 284
Y 242 F 285
G 243 G 286
L 244 Q 287
V 245 V 288
I 246 V 290
T 247 Y 291
N 248 N 292
S 249 N 293
R 250 Y 294
V 251 Y 295
I 252 E 296
R 253 G 297
E 254 S 298
S 255 A 309
D 256 W 310
S 257 G 311
V 258 I 312
P 259 G 313
A 260 K 314
K 261 S 315
S 262 S 316
Y 263 K 317
G 264 I 318
L 265 Y 319
N 284 A 320
A 285 Q 321
I 286 N 322
G 287 N 323
Q 288 V 324
T 289 I 325
V 290 D 326
F 291 V 327
L 292 P 328
N 293 G 329
T 294 L 330
S 295 S 331
M 296 A 332
D 297 A 333
N 298 K 334
H 299 T 335
I 300 I 336
Y 301 S 337
G 302 V 338
W 303 F 339
D 304 S 340
K 305 G 341
M 306 G 342
S 307 T 343
G 308 A 344
K 309 L 345
D 310 Y 346
K 311 D 347
N 319 S 348
P 320 G 349
E 321 T 350
D 322 L 351
S 323 L 352
R 324 N 353
F 325 G 354
F 326 T 355
E 327 Q 356
Y 328 I 357
K 329 N 358
S 330 A 359
Y 331 S 360
G 332 A 361
A 333 A 362
G 334 N 363
A 336 G 364
V 337 L 365
S 338 S 366
K 339 S 367
D 340 S 368
R 341 V 369
R 342 G 370
Q 343 W 371
L 344 T 372
T 345 P 373
D 346 S 374
A 347 L 375
Q 348 H 376
A 349 G 377
A 350 S 378
E 351 I 379
Y 352 D 380
T 353 A 381
Q 354 S 382
S 355 A 383
K 356 N 384
V 357 V 385
L 358 K 386
G 359 S 387
D 360 N 388
W 361 V 389
T 362 I 390
P 363 N 391
T 364 Q 392
L 365 A 393
TER
END

