
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  4
PARENT 1qcx_A
S 33 A 64
K 34 P 65
S 35 W 66
S 36 G 67
S 37 T 68
D 38 A 69
G 39 S 70
K 40 Q 71
T 41 C 72
F 42 Q 73
K 43 I 76
T 44 N 77
I 45 L 78
A 46 H 79
D 47 S 80
A 48 W 81
I 49 C 82
A 50 D 83
S 51 N 84
A 52 Y 85
P 53 A 87
A 54 S 88
G 55 A 89
S 56 P 90
T 57 K 91
P 58 V 92
F 59 S 93
V 60 V 94
I 61 T 95
L 62 Y 96
I 63 D 97
K 64 K 98
N 65 A 99
G 66 G 100
V 67 I 101
Y 68 L 102
N 69 P 103
E 70 I 104
R 71 T 105
L 72 V 106
T 73 N 107
N 77 S 108
N 78 N 109
L 79 K 110
H 80 S 111
L 81 I 112
K 82 V 113
G 83 G 114
E 84 Q 115
S 85 G 116
R 86 T 117
N 87 K 118
G 88 G 119
A 89 V 120
V 90 I 121
I 91 K 122
A 92 G 123
A 93 K 124
A 94 G 125
T 95 L 126
A 96 R 127
A 97 V 128
G 98 V 129
T 99 S 130
L 100 G 131
K 101 A 132
S 102 K 133
D 103 N 134
G 104 N 139
S 105 I 140
K 106 A 141
W 107 V 142
G 108 T 143
T 109 D 144
A 110 I 145
G 111 N 146
S 112 P 147
S 113 K 148
T 114 Y 149
I 115 V 150
T 116 A 155
I 117 I 156
S 118 T 157
A 119 V 158
K 120 D 159
D 121 D 160
F 122 S 161
S 123 D 162
A 124 L 163
Q 125 V 164
S 126 W 165
L 127 I 166
T 128 D 167
I 129 H 168
R 130 V 169
N 131 T 170
D 132 T 171
F 133 A 172
D 134 R 173
F 135 I 174
P 136 G 175
A 154 R 176
V 155 Q 177
A 156 H 178
L 157 I 179
Y 158 V 180
V 159 L 181
T 160 G 182
K 161 T 183
S 162 S 184
G 163 A 185
D 164 D 186
R 165 N 187
A 166 R 188
Y 167 V 189
F 168 I 191
K 169 S 192
D 170 Y 193
V 171 S 194
S 172 L 195
L 173 I 196
V 174 D 197
G 175 G 198
Y 176 R 199
Q 177 S 200
D 178 D 201
T 179 T 205
L 180 C 206
Y 181 N 207
V 182 G 208
S 183 H 209
G 184 H 210
F 189 Y 211
S 190 W 212
D 191 G 213
C 192 V 214
R 193 Y 215
I 194 L 216
S 195 D 217
G 196 G 218
T 197 S 219
V 198 N 220
D 199 D 221
F 200 M 222
I 201 V 223
G 205 K 226
T 206 G 227
A 207 N 228
L 208 Y 229
F 209 F 230
N 210 Y 231
N 211 N 232
L 214 L 233
V 215 S 234
S 216 G 235
R 217 R 236
Y 218 M 237
R 219 P 238
A 220 K 239
D 221 V 240
V 222 Q 241
K 223 G 242
S 224 N 243
G 225 T 244
N 226 L 245
V 227 L 246
S 228 H 247
G 229 A 248
Y 230 V 249
S 235 L 252
T 236 F 253
N 237 H 254
I 238 N 255
N 239 F 256
Q 240 D 257
K 241 G 258
Y 242 H 259
G 243 A 260
L 244 F 261
V 245 E 262
I 246 I 263
T 247 T 265
N 248 G 266
S 249 G 267
R 250 Y 268
V 251 V 269
I 252 L 270
R 253 A 271
E 254 E 272
S 255 G 273
D 256 N 274
S 257 N 280
V 258 V 281
P 259 V 282
A 260 V 283
K 261 E 284
S 262 T 285
Y 263 P 286
G 264 I 287
L 265 S 288
G 266 G 289
R 267 Q 290
F 291 L 291
L 292 F 292
N 293 S 293
T 294 S 294
S 295 P 295
M 296 D 296
D 297 A 297
N 298 N 298
H 299 T 299
I 300 N 300
Y 301 Q 301
G 302 Q 302
W 303 C 303
D 304 A 304
K 305 S 305
M 306 V 306
S 307 F 307
G 308 G 308
K 309 R 309
D 310 S 310
K 311 C 311
N 312 Q 312
G 313 L 313
N 314 N 314
T 315 A 315
Y 328 F 316
K 329 G 317
S 330 N 318
Y 331 S 319
G 332 G 320
A 333 S 323
G 334 G 324
A 335 S 325
A 336 D 326
V 337 T 327
S 338 S 328
K 339 I 329
D 340 I 330
R 341 S 331
R 342 K 332
Q 343 F 333
L 344 A 334
T 345 G 335
D 346 K 336
A 347 T 337
Q 348 I 338
A 349 A 339
A 350 A 340
E 351 A 341
Y 352 H 342
T 353 P 343
Q 354 P 344
S 355 G 345
K 356 A 346
V 357 I 347
L 358 A 348
G 359 Q 349
D 360 W 350
W 361 T 351
T 362 M 352
P 363 K 353
T 364 N 354
L 365 A 355
TER
END

