
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  1
PARENT 1asq_A
T  26    C  19
T  27    N  20
Y  28    E  21
N  29    N  22
A  30    I  23
V  31    V  24
V  32    M  25
S  33    G  26
K  34    I  27
S  35    N  28
S  36    G  29
S  37    Q  30
D  38    F  31
G  39    P  32
K  40    G  33
T  41    P  34
F  42    T  35
K  43    I  36
T  44    R  37
I  45    A  38
A  46    N  39
D  47    A  40
A  48    G  41
A  52    D 122
P  53    P 123
A  54    P 124
G  55    Q 125
S  56    G 126
T  57    K 127
P  58    K 128
F  59    E 129
V  60    P 130
I  61    F 131
L  62    H 132
I  63    Y 133
K  64    D 134
N  65    G 135
G  66    E 136
V  67    I 137
R  71    S 209
L  72    P 210
T  73    K 211
I  74    K 212
T  75    T 213
R  76    Y 214
N  77    R 215
N  78    I 216
L  79    R 217
H  80    I 218
L  81    A 219
K  82    S 220
G  83    T 221
E  84    T 222
S  85    A 223
R  86    L 224
N  87    A 225
G  88    A 226
A  89    L 227
V  90    N 228
I  91    F 229
A  92    A 230
A  93    I 231
A  94    G 232
T  95    N 233
A  96    H 234
A  97    Q 235
G  98    L 236
T  99    L 237
L 100    V 238
K 101    V 239
S 102    E 240
D 103    A 241
G 104    D 242
S 105    G 243
K 106    N 244
W 107    Y 245
G 108    V 246
T 109    Q 247
A 110    P 248
G 111    F 249
S 112    Y 250
S 113    T 251
T 114    S 252
I 115    D 253
T 116    I 254
I 117    D 255
S 118    I 256
A 119    Y 257
K 120    S 258
D 121    G 259
F 122    E 260
S 123    S 261
A 124    Y 262
Q 125    S 263
S 126    V 264
L 127    L 265
T 128    I 266
I 129    T 267
R 130    T 268
N 131    D 269
P 136    T 308
A 137    S 309
N 138    P 310
Q 139    P 311
A 140    P 312
K 141    Q 313
S 142    T 314
D 143    P 315
S 144    A 316
D 145    W 317
S 146    D 318
S 147    D 319
K 148    F 320
T 152    S 323
Q 153    K 324
A 154    N 325
V 155    F 326
A 156    T 327
L 157    Y 328
Y 158    R 329
V 159    I 330
T 160    T 331
K 161    A 332
S 162    A 333
G 163    M 334
D 164    G 335
K 169    K 338
D 170    P 339
V 171    P 340
S 172    V 341
L 173    K 342
V 174    F 343
G 175    N 344
Y 176    R 345
Q 177    R 346
D 178    I 347
T 179    F 348
L 180    L 349
Y 181    L 350
V 182    N 351
S 183    T 352
G 184    Q 353
G 185    N 354
R 186    V 355
S 187    I 356
F 188    N 357
F 189    G 358
S 190    Y 359
D 191    V 360
C 192    K 361
R 193    W 362
I 194    A 363
S 195    I 364
G 196    N 365
T 197    D 366
V 198    V 367
D 199    S 368
F 200    L 369
I 201    A 370
F 202    L 371
G 203    P 372
D 204    P 373
G 205    T 374
T 206    P 375
A 207    Y 376
L 208    L 377
F 209    G 378
N 210    A 379
N 211    M 380
C 212    K 381
D 213    Y 382
L 214    N 383
V 215    L 384
S 216    L 385
R 217    H 386
Y 218    A 387
R 219    F 388
A 220    D 389
D 221    Q 390
V 222    N 391
K 223    P 392
S 224    P 393
G 225    P 394
N 226    E 395
V 227    V 396
S 228    F 397
G 229    P 398
Y 230    E 399
L 231    D 400
T 232    Y 401
A 233    D 402
P 234    I 403
S 235    D 404
T 236    T 405
N 237    P 406
I 238    P 407
N 239    T 408
Q 240    N 409
K 241    E 410
Y 242    K 411
G 243    T 412
L 244    R 413
V 245    I 414
I 246    G 415
T 247    N 416
N 248    G 417
S 249    V 418
R 250    Y 419
V 251    Q 420
I 252    F 421
R 253    K 422
E 254    I 423
S 255    G 424
D 256    E 425
S 257    V 426
V 258    V 427
P 259    D 428
A 260    V 429
K 261    I 430
S 262    L 431
Y 263    Q 432
G 264    N 433
L 265    A 434
G 266    N 435
R 267    M 436
P 268    M 437
W 269    K 438
H 270    E 439
P 271    N 440
T 272    L 441
T 273    S 442
T 274    E 443
G 278    D 461
R 279    G 462
Y 280    K 463
A 281    F 464
D 282    S 465
P 283    A 466
N 284    E 467
A 285    E 468
I 286    E 469
G 287    S 470
L 292    N 476
N 293    P 477
T 294    P 478
S 295    L 479
M 296    R 480
D 297    N 481
N 298    T 482
H 299    V 483
I 300    V 484
Y 301    I 485
G 302    F 486
W 303    P 487
D 304    Y 488
K 305    G 489
M 306    W 490
S 307    T 491
G 308    A 492
K 309    I 493
D 310    R 494
K 311    F 495
N 312    V 496
G 313    A 497
N 314    D 498
T 315    N 499
I 316    P 500
W 317    G 501
F 318    V 502
N 319    W 503
P 320    A 504
E 321    F 505
D 322    H 506
S 323    C 507
R 324    H 508
F 325    I 509
F 326    E 510
E 327    P 511
Y 328    H 512
K 329    L 513
S 330    H 514
Y 331    M 515
G 332    G 516
A 333    M 517
G 334    G 518
A 335    V 519
A 336    V 520
V 337    F 521
S 338    A 522
K 339    E 523
D 340    G 524
R 341    V 525
R 342    E 526
Q 343    K 527
L 344    V 528
T 345    G 529
D 346    R 530
A 347    I 531
Q 348    P 532
A 349    T 533
A 350    K 534
E 351    A 535
Y 352    L 536
T 353    A 537
Q 354    C 538
S 355    G 539
K 356    G 540
V 357    T 541
L 358    A 542
G 359    K 543
D 360    S 544
W 361    L 545
T 362    I 546
P 363    N 547
T 364    N 548
L 365    P 549
P 366    K 550
TER
END



