
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  4
PARENT 2mpr_C
A  25    G  27
T  26    A  28
T  27    Q  29
Y  28    S  30
N  29    K  31
A  30    Y  32
V  31    R  33
V  32    L  34
S  33    G  35
K  34    N  36
S  35    E  37
S  36    C  38
S  37    E  39
D  38    T  40
G  39    Y  41
K  40    A  42
T  41    E  43
F  42    L  44
K  43    K  45
T  44    L  46
I  45    G  47
A  46    Q  48
D  47    E  49
A  48    V  50
A  52    E  53
P  53    G  54
A  54    D  55
G  55    K  56
S  56    S  57
T  57    F  58
P  58    Y  59
F  59    F  60
V  60    D  61
I  61    T  62
L  62    N  63
I  63    V  64
K  64    A  65
N  65    Y  66
G  66    S  67
V  67    V  68
Y  68    N  69
N  69    Q  70
E  70    Q  71
T  75    W  74
R  76    E  75
N  77    S  76
N  78    T  77
L  79    D  78
H  80    P  79
L  81    A  80
K  82    F  81
G  83    R  82
E  84    E  83
S  85    A  84
R  86    N  85
N  87    V  86
G  88    Q  87
A  89    G  88
V  90    K  89
I  91    N  90
A  92    L  91
A  93    I  92
A  94    E  93
T  95    W  94
A  96    L  95
A  97    P  96
G  98    G  97
T  99    S  98
L 100    T  99
K 101    I 100
S 102    W 101
D 103    A 102
G 104    G 103
S 105    K 104
K 106    R 105
W 107    F 106
G 108    Y 107
T 109    Q 108
A 110    R 109
G 111    H 110
S 112    D 111
S 113    V 112
T 114    H 113
I 115    M 114
T 116    I 115
I 117    D 116
S 118    F 117
A 119    Y 118
K 120    Y 119
D 121    W 120
F 122    D 121
S 123    I 122
A 124    S 123
Q 125    G 124
S 126    P 125
L 127    G 126
T 128    A 127
I 129    G 128
R 130    I 129
N 131    E 130
D 132    N 131
P 136    L 134
A 137    G 135
N 138    F 136
Q 139    G 137
A 140    K 138
K 141    L 139
S 142    S 140
D 143    L 141
S 144    A 142
D 145    A 143
S 146    T 144
S 147    R 145
K 148    S 146
I 149    T 147
K 150    E 148
D 151    A 149
Y 158    Q 158
V 159    N 159
T 160    I 160
K 161    Y 161
S 162    D 162
G 163    E 163
D 164    V 164
R 165    K 165
A 166    D 166
Y 167    T 167
F 168    A 168
K 169    N 169
D 170    D 170
V 171    V 171
S 172    F 172
L 173    D 173
V 174    V 174
G 175    R 175
Y 176    L 176
Q 177    A 177
D 178    G 178
T 179    L 179
G 185    N 182
R 186    P 183
S 187    D 184
F 188    G 185
F 189    V 186
S 190    L 187
D 191    E 188
C 192    L 189
R 193    G 190
I 194    V 191
S 195    D 192
G 196    Y 193
T 197    G 194
V 198    R 195
D 199    A 196
F 200    N 197
I 201    T 198
F 202    T 199
G 203    D 200
D 204    G 201
G 205    Y 202
T 206    K 203
N 210    D 206
N 211    G 207
C 212    A 208
D 213    S 209
L 214    K 210
V 215    D 211
S 216    G 212
R 217    W 213
Y 218    M 214
R 219    F 215
A 220    T 216
D 221    A 217
V 222    E 218
K 223    H 219
S 224    T 220
G 225    Q 221
N 226    S 222
V 227    M 223
S 228    L 224
G 229    K 225
Y 230    G 226
L 231    Y 227
T 236    L 290
N 237    G 291
I 238    D 292
N 239    K 293
Q 240    W 294
K 241    D 295
Y 242    L 296
G 243    M 297
L 244    Y 298
V 245    V 299
I 246    G 300
T 247    M 301
N 248    Y 302
S 249    Q 303
R 250    N 304
V 251    I 305
I 252    D 306
R 253    W 307
E 254    D 308
S 255    N 309
D 256    N 310
S 257    L 311
V 258    G 312
P 259    T 313
A 260    E 314
K 261    W 315
S 262    W 316
Y 263    T 317
G 264    V 318
L 265    G 319
G 266    V 320
R 267    R 321
P 268    P 322
W 269    M 323
H 270    Y 324
P 271    K 325
T 272    W 326
T 273    T 327
T 274    P 328
F 275    I 329
S 276    M 330
D 277    S 331
G 278    T 332
R 279    L 333
Y 280    L 334
A 281    E 335
D 282    V 336
P 283    G 337
N 284    Y 338
A 285    D 339
I 286    N 340
G 287    V 341
Q 288    K 342
T 289    S 343
V 290    Q 344
F 291    Q 345
L 292    T 346
N 293    G 347
T 294    D 348
S 295    R 349
M 296    N 350
D 297    N 351
N 298    Q 352
H 299    Y 353
I 300    K 354
Y 301    I 355
G 302    T 356
W 303    L 357
D 304    A 358
K 305    Q 359
M 306    Q 360
S 307    W 361
G 308    Q 362
K 309    A 363
D 310    G 364
K 311    D 365
N 312    S 366
G 313    I 367
N 314    W 368
T 315    S 369
I 316    R 370
W 317    P 371
F 318    A 372
N 319    I 373
P 320    R 374
E 321    I 375
D 322    F 376
S 323    A 377
R 324    T 378
F 325    Y 379
F 326    A 380
E 327    K 381
Y 328    W 382
K 329    D 383
S 330    E 384
Y 331    K 385
G 332    W 386
A 333    G 387
G 334    Y 388
A 335    I 389
A 336    K 390
V 337    D 391
S 338    G 392
K 339    D 393
D 340    N 394
R 341    I 395
R 342    S 396
Q 343    R 397
L 344    Y 398
T 345    A 399
D 346    A 400
A 347    A 401
Q 348    T 402
A 349    N 403
A 350    S 404
E 351    G 405
Y 352    I 406
T 353    S 407
Q 354    T 408
S 355    N 409
K 356    S 410
V 357    R 411
L 358    G 412
G 359    D 413
D 360    S 414
W 361    D 415
T 362    E 416
P 363    W 417
T 364    T 418
L 365    F 419
P 366    G 420
TER
END



