
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 3359-3308-3659
REMARK FUGUE AUTOMATIC ALIGNMENT
REMARK ZSCORE=3.40 
REMARK CONFIDENCE: UNCERTAIN (less than 50% confidence [ ZSCORE<3.5 ])
REMARK DERIVED FROM HOMSTRAD PROFILE: hs1dbga
METHOD Environment-specific substitution tables were derived from the structure-based
METHOD alignments in the HOMSTRAD database. Each alignment in HOMSTRAD was converted
METHOD into a scoring template (profile) using the environment-specific substitution 
METHOD tables and environment-dependent gap penalties. The program FUGUE searches
METHOD a sequence or sequence alignment against the library of profiles.
MODEL  1
PARENT 1dbg_A
A  25     N    31
T  26     E    32
T  27     T    33
Y  28     L    34
N  29     Y    35
A  30     Q    36
V  31     V    37
V  32     V    38
S  33     K    39
K  34     E    40
S  35     V    41
S  36     K    42
S  37     P    43
D  38     G    44
G  39     D    51
K  40     G    52
T  41     T    53
F  42     Y    54
K  43     K    55
T  44     D    56
I  45     V    57
A  46     Q    58
D  47     L    59
A  48     I    60
I  49     V    61
A  50     S    62
S  51     N    63
A  52     S    64
P  53     G    65
A  54     K    66
G  55     S    67
S  56     G    68
T  57     L    69
P  58     P    70
F  59     I    71
V  60     T    72
I  61     I    73
L  62     K    74
I  63     A    75
K  64     L    76
N  65     N    77
G  66     P    78
V  67     T    84
Y  68     G    85
N  69     D    86
E  70     A    87
R  71     K    88
L  72     V    89
T  73     E    90
I  74     L    91
T  75     R    92
R  76     G    93
N  77     E    94
N  78     H    95
L  79     L    96
H  80     I    97
L  81     L    98
K  82     E    99
G  83     G   100
G  88     I   101
A  89     W   102
V  90     F   103
I  91     K   104
A  92     D   105
A  93     G   106
A  94     N   107
T  95     R   108
A  96     A   109
A  97     I   110
G  98     Q   111
T  99     A   112
L 100     W   113
K 101     K   114
S 102     S   115
D 103     H   116
G 104     G   117
S 105     P   118
K 106     G   119
W 107     L   120
G 108     V   121
T 109     A   122
A 110     I   123
G 111     Y   124
S 112     G   125
S 113     S   126
T 114     Y   127
I 115     N   128
T 116     R   129
I 117     I   130
S 118     T   131
A 119     A   132
K 120     C   133
D 121     V   134
F 122     F   135
S 123     D   136
A 124     C   137
Q 125     F   138
S 126     D   139
L 127     T   147
T 128     T   148
I 129     S   149
R 130     L   150
N 131     T   151
D 132     E   152
F 133     D   153
D 134     G   154
F 135     K   155
P 136     V   156
A 137     P   157
N 138     Q   158
Q 139     H   159
A 140     C   160
K 141     R   161
S 142     I   162
D 143     D   163
S 144     S   166
D 145     F   167
S 146     T   168
S 147     D   169
K 148     K   170
I 149     I   171
K 150     T   172
D 151     F   173
T 152     D   174
Q 153     Q   175
A 154     V   176
V 155     I   177
A 156     N   178
L 157     L   179
Y 158     N   180
V 159     N   181
T 160     T   182
K 161     A   183
S 162     R   184
G 163     A   185
D 164     D   201
R 165     H   202
A 166     C   203
Y 167     F   204
F 168     F   205
K 169     S   206
D 170     N   207
V 171     P   208
S 172     Q   209
L 173     L   236
V 174     F   237
G 175     M   238
Y 176     R   239
Q 177     Q   240
D 178     D   241
T 179     S   242
L 180     I   247
Y 181     T   248
V 182     S   249
S 183     K   250
G 184     S   251
G 185     Q   252
R 186     E   253
S 187     N   254
F 188     V   255
F 189     Y   256
S 190     Y   257
D 191     G   258
C 192     N   259
R 193     T   260
I 194     Y   261
S 195     Q   265
G 196     G   266
T 197     T   267
V 198     M   268
D 199     N   269
F 200     F   270
I 201     R   271
F 202     H   272
G 203     G   273
D 204     D   274
G 205     H   275
T 206     Q   276
A 207     V   277
L 208     A   278
F 209     I   279
N 210     N   280
N 211     N   281
C 212     C   306
D 213     N   307
L 214     Y   308
V 215     F   309
S 216     E   310
R 217     L   311
Y 218     S   312
R 219     E   313
A 220     T   314
D 221     I   315
V 222     K   316
K 223     S   317
S 224     R   318
G 225     G   319
N 226     N   320
V 227     A   321
S 228     A   322
G 229     L   323
Y 230     Y   324
L 231     L   325
T 232     N   326
A 233     P   327
P 234     G   328
S 235     A   329
T 236     M   330
N 237     A   331
I 238     S   332
N 239     E   333
Q 240     H   334
K 241     A   335
Y 242     F   338
G 243     D   339
L 244     M   340
V 245     L   341
I 246     I   342
T 247     A   343
N 248     N   344
S 249     N   345
R 250     A   346
V 251     F   347
I 252     I   348
R 253     D   361
E 254     E   362
S 255     R   363
D 256     R   364
S 257     K   365
V 258     E   366
P 259     Y   367
A 260     C   368
K 261     A   369
S 262     A   370
Y 263     N   371
G 264     R   372
L 265     L   373
G 266     K   374
R 267     F   375
P 268     E   376
W 269     T   377
H 270     P   378
P 271     H   379
T 272     Q   380
T 273     L   381
T 274     M   382
F 275     L   383
S 276     K   384
D 277     G   385
G 278     N   386
R 279     L   387
Y 280     F   388
A 281     F   389
D 282     K   390
P 283     D   391
N 284     K   392
A 285     P   393
I 286     Y   394
G 287     V   395
Q 288     Y   396
T 289     P   397
V 290     F   398
F 291     F   399
L 292     K   400
N 293     D   401
T 294     D   402
S 295     Y   403
M 296     F   404
D 297     I   405
N 298     A   406
H 299     G   407
I 300     K   408
Y 301     N   409
G 302     S   410
W 303     W   411
D 304     T   412
K 305     G   413
M 306     V   415
S 307     A   416
G 308     L   417
K 309     G   418
D 310     V   419
K 311     E   420
N 312     K   421
G 313     G   422
N 314     I   423
T 315     P   424
I 316     V   425
W 317     N   426
F 318     I   427
N 319     S   428
P 320     A   429
E 321     N   430
D 322     R   431
S 323     S   432
R 324     A   433
F 325     Y   434
F 326     K   435
E 327     P   436
Y 328     V   437
K 329     K   438
S 330     I   439
Y 331     K   440
G 332     D   441
A 333     I   442
G 334     G   447
A 335     I   448
A 336     A   449
V 337     L   450
S 338     D   451
K 339     L   452
D 340     N   453
R 341     A   454
R 342     L   455
Q 343     I   456
L 344     S   457
T 345     K   458
D 346     G   459
A 347     I   460
Q 348     T   461
A 349     G   462
A 350     K   463
E 351     P   464
Y 352     L   465
T 353     S   466
Q 354     W   467
S 355     D   468
K 356     E   469
V 357     V   470
L 358     R   471
G 359     P   472
D 360     Y   473
W 361     W   474
T 362     L   475
P 363     K   476
T 364     E   477
L 365     M   478
P 366     P   479
TER
END

