
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  2
PARENT 1czf_A
G 39 S 29
K 40 C 30
T 41 T 31
F 42 F 32
K 43 T 33
T 44 T 34
I 45 A 37
A 46 A 38
D 47 K 39
A 48 A 40
I 49 G 41
A 50 K 42
S 51 A 43
A 52 K 44
P 53 C 45
A 54 S 46
G 55 T 47
S 56 I 48
T 57 T 49
P 58 L 50
F 59 N 51
V 60 N 52
I 61 I 53
L 62 E 54
I 63 V 55
K 64 P 56
N 65 A 57
G 66 G 58
V 67 T 59
Y 68 Y 82
N 69 E 83
E 70 E 84
R 71 L 89
L 72 I 90
T 73 S 91
I 74 M 92
T 75 S 93
R 76 G 94
N 77 E 95
N 78 H 96
L 79 I 97
H 80 T 98
L 81 V 99
K 82 T 100
G 83 G 101
E 84 D 116
S 85 G 117
R 86 K 118
N 87 G 122
G 88 K 123
A 89 K 124
V 90 K 125
I 91 P 126
A 92 K 127
A 93 F 128
A 94 F 129
T 95 Y 130
A 96 A 131
A 97 H 132
G 98 G 133
T 99 L 134
L 100 D 135
K 101 S 136
S 102 S 137
D 103 S 138
G 104 I 139
S 105 T 140
K 106 G 141
W 107 L 142
G 108 N 143
T 109 I 144
A 110 K 145
G 111 N 146
S 112 T 147
S 113 P 148
T 114 L 149
I 115 F 152
T 116 S 153
I 117 V 154
S 118 Q 155
A 119 A 156
K 120 N 157
D 121 D 158
F 122 I 159
S 123 T 160
A 124 F 161
Q 125 T 162
S 126 D 163
L 127 V 164
T 128 T 165
I 129 I 166
R 130 N 167
N 131 N 168
D 132 A 169
F 133 D 170
D 134 G 171
F 135 D 172
P 136 T 173
A 137 Q 174
N 138 G 175
T 160 G 176
K 161 H 177
S 162 N 178
G 163 T 179
D 164 D 180
R 165 A 181
A 166 F 182
Y 167 D 183
F 168 V 184
K 169 G 185
D 170 N 186
G 184 S 187
G 185 V 188
R 186 G 189
S 187 V 190
F 188 N 191
F 189 I 192
S 190 I 193
D 191 K 194
C 192 P 195
R 193 W 196
I 194 V 197
S 195 H 198
G 196 N 199
T 197 Q 200
V 198 D 201
D 199 D 202
F 200 C 203
I 201 L 204
A 207 A 205
L 208 V 206
F 209 N 207
N 210 S 208
N 211 G 209
C 212 E 210
D 213 N 211
L 214 I 212
V 215 W 213
S 216 F 214
Y 218 T 215
R 219 G 216
A 220 G 217
D 221 T 218
V 222 C 219
K 223 I 220
S 224 G 221
G 225 G 222
N 226 H 223
V 227 G 224
S 228 L 225
G 229 S 226
Y 230 I 227
L 231 G 228
T 232 S 229
A 233 V 230
P 234 G 231
S 235 D 232
T 236 R 233
N 237 S 234
I 238 N 235
N 239 N 236
Q 240 V 237
K 241 V 238
Y 242 K 239
G 243 N 240
L 244 V 241
V 245 T 242
I 246 I 243
T 247 E 244
N 248 H 245
S 249 S 246
R 250 T 247
V 251 V 248
I 252 S 249
R 253 N 250
E 254 S 251
S 255 E 252
D 256 N 253
S 257 A 254
V 258 V 255
P 259 R 256
A 260 I 257
K 261 K 258
S 262 T 259
Y 263 I 260
G 264 S 261
L 265 G 262
G 266 A 263
P 283 T 264
N 284 G 265
A 285 S 266
I 286 V 267
G 287 S 268
Q 288 E 269
T 289 I 270
V 290 T 271
F 291 Y 272
L 292 S 273
N 293 N 274
T 294 I 275
S 295 V 276
M 296 M 277
D 297 S 278
N 298 G 279
H 299 I 280
I 300 V 286
Y 301 I 287
G 302 Q 288
W 303 Q 289
D 304 D 290
K 305 Y 291
M 306 E 292
S 307 D 293
G 308 G 294
K 309 K 295
D 310 P 296
K 311 T 297
N 312 G 298
G 313 K 299
N 314 P 300
T 315 T 301
I 316 N 302
W 317 G 303
F 318 V 304
N 319 T 305
P 320 I 306
E 321 Q 307
D 322 D 308
S 323 V 309
R 324 K 310
F 325 L 311
F 326 E 312
K 329 S 313
S 330 V 314
Y 331 T 315
G 332 G 316
A 333 S 317
G 334 V 318
A 335 D 319
A 336 S 320
V 337 G 321
S 338 A 322
K 339 T 323
D 340 E 324
R 341 I 325
R 342 Y 326
Q 343 L 327
L 344 L 328
T 345 C 329
D 346 G 330
A 347 S 331
Q 348 G 332
A 349 S 333
A 350 S 335
E 351 D 336
Y 352 W 337
T 353 T 338
Q 354 W 339
S 355 D 340
K 356 K 343
V 357 V 344
L 358 T 345
G 359 G 346
D 360 G 347
W 361 K 348
T 362 K 349
P 363 S 350
T 364 T 351
L 365 A 352
TER
END

