
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  5
PARENT 1bhe
A 25 E 8
T 26 P 9
T 27 K 10
Y 28 T 11
N 29 P 12
A 30 S 13
V 31 S 14
V 32 T 17
S 33 L 18
K 34 K 19
S 36 A 20
S 37 D 21
D 38 S 22
G 39 S 23
K 40 T 24
T 41 A 25
F 42 T 26
K 43 S 27
T 44 T 28
I 45 I 29
A 46 Q 30
D 47 K 31
A 48 A 32
I 49 L 33
A 50 N 34
S 51 N 35
A 52 C 36
P 53 D 37
A 54 Q 38
G 55 G 39
S 56 K 40
T 57 A 41
P 58 V 42
F 59 R 43
V 60 L 44
I 61 S 45
L 62 A 46
I 63 G 47
K 64 S 48
N 65 T 49
G 66 S 50
V 67 V 51
Y 68 F 52
N 69 S 54
E 70 G 55
R 71 P 56
L 72 L 57
T 73 S 58
I 74 L 59
T 75 P 60
R 76 S 61
N 77 G 62
N 78 V 63
L 79 L 65
H 80 L 66
L 81 I 67
K 82 D 68
G 83 K 69
E 84 G 70
S 85 V 71
R 86 N 77
N 87 N 78
G 88 A 79
A 89 K 80
V 90 S 81
I 91 T 108
A 92 T 109
A 93 N 110
A 94 S 111
T 95 G 112
A 96 I 113
A 97 Y 114
G 98 G 115
T 99 P 116
L 100 G 117
K 101 T 118
S 102 I 119
D 103 D 120
G 104 G 121
S 105 Q 122
K 106 G 123
W 107 G 124
G 108 V 125
T 109 N 149
A 110 T 150
G 111 P 151
S 112 R 152
S 113 L 153
T 114 I 154
I 115 Q 155
T 116 I 156
I 117 N 157
S 118 K 158
A 119 S 159
K 120 K 160
D 121 N 161
F 122 F 162
S 123 T 163
A 124 L 164
Q 125 Y 165
S 126 N 166
L 127 V 167
T 128 S 168
I 129 L 169
R 130 I 170
N 131 N 171
D 132 S 172
A 154 P 173
V 155 N 174
A 156 F 175
L 157 H 176
Y 158 V 177
V 159 V 178
T 160 F 179
K 161 S 180
S 162 D 181
G 163 G 182
D 164 D 183
R 165 G 184
A 166 F 185
Y 167 T 186
F 168 A 187
K 169 W 188
D 170 K 189
V 171 T 190
S 172 T 191
L 173 I 192
V 174 K 193
G 175 T 194
Y 176 P 195
Q 177 S 196
D 178 T 197
T 179 T 201
L 180 D 202
Y 181 G 203
V 182 I 204
S 183 D 205
G 184 P 206
G 185 M 207
R 186 S 208
F 188 T 213
F 189 I 214
S 190 A 215
D 191 Y 216
C 192 S 217
R 193 N 218
I 194 I 219
S 195 A 220
G 196 T 221
T 197 G 222
V 198 D 223
D 199 D 224
F 200 N 225
I 201 V 226
F 202 A 227
G 203 I 228
D 204 K 229
G 205 A 230
T 206 Y 231
A 207 K 232
L 208 G 233
F 209 R 234
N 210 A 235
N 211 E 236
C 212 T 237
D 213 R 238
L 214 N 239
V 215 I 240
S 216 S 241
R 217 I 242
Y 218 L 243
R 219 H 244
A 220 N 245
D 221 D 246
V 222 F 247
K 223 G 248
S 224 T 249
G 225 G 250
N 226 H 251
V 227 G 252
S 228 M 253
G 229 S 254
Y 230 I 255
S 235 G 256
T 236 S 257
N 237 E 258
I 238 T 259
N 239 M 260
Q 240 G 261
K 241 V 262
Y 242 Y 263
G 243 N 264
L 244 V 265
V 245 T 266
I 246 V 267
T 247 D 268
N 248 D 269
S 249 L 270
R 250 K 271
V 251 M 272
I 252 N 273
R 253 G 274
E 254 T 275
S 255 T 276
D 256 N 277
S 257 G 278
V 258 L 279
P 259 R 280
A 260 I 281
K 261 K 282
S 262 S 283
Y 263 D 284
G 264 K 285
L 265 S 286
G 266 A 287
P 283 A 288
N 284 G 289
A 285 V 290
I 286 V 291
G 287 N 292
Q 288 G 293
T 289 V 294
V 290 R 295
F 291 Y 296
L 292 S 297
N 293 N 298
T 294 V 299
S 295 V 300
M 296 M 301
D 297 K 302
N 298 N 303
H 299 V 304
I 300 V 309
Y 301 I 310
G 302 D 311
W 303 T 312
D 304 V 313
K 305 Y 314
M 306 E 315
S 307 K 316
G 308 K 317
K 309 E 318
D 310 G 319
T 315 S 320
I 316 N 321
W 317 V 322
F 318 P 323
N 319 D 324
P 320 W 325
E 321 S 326
D 322 D 327
S 323 I 328
R 324 T 329
F 325 F 330
F 326 K 331
K 329 D 332
S 330 V 333
Y 331 T 334
G 332 S 335
A 336 E 336
V 337 T 337
S 338 K 338
K 339 G 339
D 340 V 340
R 341 V 341
R 342 V 342
L 344 L 343
T 345 N 344
D 346 G 345
A 347 E 346
Q 348 N 347
A 349 A 348
A 350 K 349
E 351 K 350
Y 352 P 351
T 353 I 352
Q 354 E 353
S 355 V 354
K 356 T 355
V 357 M 356
L 358 K 357
G 359 N 358
D 360 V 359
W 361 K 360
T 362 L 361
P 363 T 362
T 364 S 363
L 365 D 364
TER
END

