
PFRMAT AL
TARGET T0100
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  3
PARENT 1cf1_C
A  25    A   7
T  26    P   8
T  27    N   9
Y  28    H  10
N  29    V  11
A  30    I  12
V  31    F  13
V  32    K  14
S  33    K  15
K  34    I  16
S  35    S  17
S  36    R  18
S  37    D  19
D  38    K  20
G  39    S  21
K  40    V  22
T  41    T  23
F  42    I  24
K  43    Y  25
T  44    L  26
I  45    G  27
A  46    K  28
D  47    R  29
G  55    V  35
S  56    E  36
T  57    R  37
P  58    V  38
F  59    E  39
V  60    P  40
I  61    V  41
L  62    D  42
I  63    G  43
K  64    V  44
N  65    V  45
G  66    L  46
V  67    V  47
Y  68    D  48
N  69    P  49
E  70    E  50
T  75    K  53
R  76    G  54
N  77    K  55
N  78    R  56
L  79    V  57
H  80    Y  58
L  81    V  59
K  82    S  60
G  83    L  61
E  84    T  62
S  85    C  63
R  86    A  64
N  87    F  65
G  88    R  66
A  89    Y  67
V  90    G  68
I  91    Q  69
A  92    E  70
A  93    D  71
A  94    I  72
T  95    D  73
A  96    V  74
A  97    M  75
G  98    G  76
T  99    L  77
L 100    S  78
K 101    F  79
S 102    R  80
D 103    R  81
G 104    D  82
S 105    L  83
K 106    Y  84
W 107    F  85
G 108    S  86
T 109    Q  87
A 110    V  88
G 111    Q  89
S 112    V  90
S 113    F  91
T 114    P  92
I 115    P  93
T 116    V  94
I 117    G  95
S 118    A  96
A 119    S  97
K 120    G  98
D 121    A  99
F 122    T 100
S 123    T 101
A 124    R 102
Q 125    L 103
S 126    Q 104
L 127    E 105
T 128    S 106
I 129    L 107
R 130    I 108
N 131    K 109
D 132    K 110
F 133    L 111
D 134    G 112
F 135    A 113
P 136    N 114
A 137    T 115
N 138    Y 116
Q 139    P 117
A 140    F 118
K 141    L 119
S 142    L 120
D 143    T 121
S 144    F 122
D 145    P 123
S 146    D 124
S 147    Y 125
T 152    D 146
Q 153    F 147
A 154    E 148
V 155    I 149
A 156    K 150
L 157    A 151
Y 158    F 152
V 159    A 153
T 160    T 154
K 161    H 155
S 162    S 156
G 163    T 157
D 164    D 158
F 168    I 164
K 169    P 165
D 170    K 166
V 171    K 167
S 172    S 168
L 173    S 169
V 174    V 170
G 175    R 171
Y 176    L 172
Q 177    L 173
D 178    I 174
T 179    R 175
L 180    K 176
Y 181    V 177
V 182    Q 178
S 183    H 179
G 184    A 180
G 185    P 181
R 186    R 182
S 190    G 185
D 191    P 186
C 192    Q 187
R 193    P 188
I 194    R 189
S 195    A 190
G 196    E 191
T 197    A 192
V 198    S 193
D 199    W 194
F 200    Q 195
I 201    F 196
F 202    F 197
G 203    M 198
D 204    S 199
G 205    D 200
T 206    K 201
A 207    P 202
L 208    L 203
F 209    R 204
N 210    L 205
N 211    A 206
C 212    V 207
D 213    S 208
L 214    L 209
V 215    S 210
S 216    K 211
R 217    E 212
Y 218    I 213
R 219    Y 214
A 220    Y 215
D 221    H 216
V 222    G 217
K 223    E 218
S 224    P 219
G 225    I 220
N 226    P 221
V 227    V 222
S 228    T 223
G 229    V 224
Y 230    A 225
L 231    V 226
T 232    T 227
A 233    N 228
P 234    S 229
S 235    T 230
T 236    E 231
N 237    K 232
I 238    T 233
N 239    V 234
Q 240    K 235
K 241    K 236
Y 242    I 237
G 243    K 238
L 244    V 239
V 245    L 240
I 246    V 241
T 247    E 242
N 248    Q 243
S 249    V 244
R 250    T 245
V 251    N 246
I 252    V 247
R 253    V 248
E 254    L 249
S 255    Y 250
D 256    S 251
S 257    S 252
V 258    D 253
P 259    Y 254
A 260    Y 255
K 261    I 256
S 262    K 257
Y 263    T 258
G 264    V 259
L 265    A 260
G 266    A 261
R 267    E 262
P 268    E 263
W 269    A 264
H 270    Q 265
P 271    E 266
T 272    K 267
T 273    V 268
T 274    P 269
F 275    P 270
S 276    N 271
D 277    S 272
D 282    T 275
P 283    K 276
N 284    T 277
A 285    L 278
I 286    T 279
G 287    L 280
Q 288    V 281
T 289    P 282
V 290    L 283
F 291    L 284
L 292    A 285
N 293    N 286
T 294    N 287
S 295    R 288
M 296    E 289
D 297    R 290
N 298    R 291
H 299    G 292
I 300    I 293
Y 301    A 294
G 302    L 295
W 303    D 296
D 304    G 297
K 305    K 298
M 306    I 299
S 307    K 300
G 308    H 301
K 309    E 302
D 310    D 303
K 311    T 304
N 312    N 305
G 313    L 306
N 314    A 307
T 315    S 308
I 316    S 309
W 317    T 310
F 318    I 311
N 319    I 312
P 320    K 313
E 321    E 314
D 322    G 315
S 323    I 316
R 324    D 317
F 325    K 318
F 326    T 319
E 327    V 320
Y 328    M 321
K 329    G 322
S 330    I 323
Y 331    L 324
G 332    V 325
A 333    S 326
G 334    Y 327
A 335    Q 328
A 336    I 329
V 337    K 330
S 338    V 331
K 339    K 332
D 340    L 333
R 341    T 334
R 342    V 335
Q 343    S 336
L 344    G 337
T 345    L 338
D 346    L 339
A 347    G 340
Q 348    E 341
A 349    L 342
A 350    T 343
E 351    S 344
Y 352    S 345
T 353    E 346
Q 354    V 347
S 355    A 348
K 356    T 349
V 357    E 350
L 358    V 351
G 359    P 352
D 360    F 353
W 361    R 354
T 362    L 355
P 363    M 356
T 364    H 357
L 365    P 358
P 366    Q 359
TER
END



