
PFRMAT  SS
TARGET  T0100
AUTHOR  8705-2233-5900
REMARK  
METHOD  The target protein sequence is aligned with the protein segments 
METHOD  from the selected protein list provided by Dr. Uwe Hobohm according
METHOD  to secondary structural propensities and hydrophobicities.  
METHOD  Secondary structures are derived from best alignment sequences 
METHOD  for each residue.
MODEL   1  
A    C   0.7
T    H   0.7
T    H   0.9
Y    H   0.9
N    H   0.9
A    H   0.8
V    H   0.8
V    H   0.8
S    C   0.5
K    C   0.5
S    C   0.6
S    C   0.6
S    C   0.7
D    C   0.7
G    C   0.7
K    C   0.7
T    H   0.7
F    H   0.8
K    H   0.8
T    H   0.8
I    H   0.7
A    H   0.7
D    H   0.7
A    H   0.6
I    H   0.7
A    H   0.7
S    C   0.5
A    C   0.6
P    C   0.7
A    C   0.7
G    C   0.7
S    C   0.6
T    C   0.5
P    E   0.8
F    E   0.8
V    E   0.8
I    E   0.8
L    E   0.8
I    E   0.8
K    E   0.8
N    E   0.7
G    C   0.5
V    H   0.6
Y    H   0.7
N    H   0.6
E    H   0.6
R    H   0.5
L    H   0.5
T    C   0.5
I    C   0.5
T    E   0.5
R    E   0.5
N    E   0.5
N    E   0.5
L    E   0.5
H    E   0.6
L    E   0.5
K    C   0.6
G    C   0.7
E    C   0.7
S    C   0.7
R    C   0.6
N    C   0.5
G    C   0.5
A    H   0.6
V    H   0.6
I    H   0.6
A    H   0.6
A    H   0.6
A    H   0.6
T    H   0.5
A    H   0.5
A    H   0.5
G    H   0.5
T    H   0.5
L    H   0.5
K    H   0.5
S    H   0.6
D    C   0.6
G    C   0.6
S    C   0.6
K    C   0.7
W    E   0.7
G    E   0.6
T    E   0.6
A    E   0.6
G    E   0.6
S    C   0.6
S    C   0.6
T    C   0.6
I    C   0.6
T    C   0.6
I    C   0.6
S    E   0.6
A    E   0.5
K    E   0.5
D    E   0.5
F    E   0.5
S    C   0.5
A    C   0.6
Q    H   0.6
S    H   0.6
L    H   0.7
T    H   0.7
I    H   0.7
R    H   0.7
N    H   0.8
D    H   0.8
F    C   0.5
D    C   0.6
F    C   0.6
P    C   0.6
A    C   0.6
N    C   0.5
Q    H   0.5
A    H   0.5
K    H   0.5
S    H   0.5
D    H   0.8
S    H   0.8
D    H   0.8
S    H   0.8
S    C   0.5
K    C   0.5
I    C   0.5
K    H   0.8
D    H   0.8
T    H   0.7
Q    H   0.7
A    H   0.6
V    H   0.6
A    H   0.6
L    C   0.6
Y    C   0.6
V    C   0.6
T    H   0.5
K    H   0.6
S    H   0.6
G    H   0.6
D    H   0.6
R    H   0.6
A    H   0.6
Y    H   0.6
F    H   0.5
K    C   0.5
D    C   0.6
V    C   0.6
S    C   0.6
L    C   0.6
V    C   0.5
G    H   0.6
Y    H   0.6
Q    H   0.6
D    H   0.5
T    H   0.5
L    H   0.5
Y    C   0.5
V    C   0.5
S    C   0.5
G    C   0.5
G    C   0.6
R    C   0.6
S    C   0.6
F    C   0.5
F    E   0.5
S    E   0.5
D    E   0.5
C    E   0.5
R    E   0.5
I    E   0.6
S    E   0.6
G    E   0.7
T    E   0.8
V    E   0.8
D    E   0.8
F    E   0.8
I    C   0.5
F    C   0.5
G    C   0.5
D    C   0.5
G    H   0.6
T    H   0.7
A    H   0.7
L    H   0.7
F    H   0.8
N    H   0.7
N    H   0.7
C    H   0.8
D    H   0.8
L    H   0.8
V    H   0.7
S    H   0.7
R    H   0.6
Y    H   0.6
R    H   0.5
A    C   0.5
D    C   0.6
V    C   0.7
K    C   0.5
S    C   0.6
G    C   0.6
N    C   0.6
V    C   0.6
S    C   0.6
G    C   0.6
Y    C   0.6
L    C   0.7
T    C   0.7
A    C   0.7
P    C   0.7
S    C   0.7
T    C   0.7
N    C   0.7
I    C   0.7
N    C   0.6
Q    C   0.6
K    C   0.5
Y    C   0.5
G    C   0.5
L    E   0.5
V    E   0.7
I    E   0.8
T    E   0.8
N    E   0.8
S    E   0.7
R    E   0.7
V    E   0.7
I    E   0.7
R    E   0.7
E    E   0.6
S    C   0.5
D    C   0.6
S    C   0.6
V    C   0.6
P    C   0.7
A    C   0.7
K    C   0.6
S    C   0.6
Y    C   0.6
G    C   0.7
L    C   0.7
G    C   0.7
R    C   0.7
P    C   0.7
W    C   0.7
H    C   0.7
P    C   0.6
T    C   0.6
T    C   0.5
T    C   0.5
F    C   0.5
S    C   0.5
D    C   0.5
G    C   0.5
R    C   0.5
Y    C   0.6
A    C   0.6
D    C   0.6
P    C   0.6
N    C   0.6
A    C   0.6
I    C   0.5
G    H   0.7
Q    H   0.7
T    H   0.7
V    H   0.7
F    H   0.7
L    H   0.7
N    H   0.7
T    H   0.7
S    H   0.7
M    H   0.7
D    H   0.6
N    H   0.6
H    H   0.5
I    E   0.5
Y    E   0.6
G    E   0.6
W    E   0.6
D    E   0.6
K    E   0.5
M    E   0.6
S    C   0.6
G    C   0.6
K    C   0.7
D    C   0.7
K    C   0.7
N    C   0.7
G    C   0.6
N    C   0.6
T    E   0.5
I    E   0.8
W    E   0.8
F    E   0.7
N    E   0.7
P    E   0.6
E    E   0.5
D    C   0.6
S    C   0.6
R    C   0.7
F    H   0.8
F    H   0.8
E    H   0.8
Y    H   0.9
K    H   0.8
S    H   0.8
Y    C   0.7
G    C   0.7
A    C   0.7
G    C   0.7
A    H   0.7
A    H   0.5
V    H   0.7
S    H   0.7
K    C   0.7
D    C   0.7
R    C   0.5
R    C   0.5
Q    H   0.5
L    H   0.9
T    H   0.9
D    H   0.9
A    H   0.9
Q    H   0.9
A    H   0.9
A    H   0.8
E    H   0.7
Y    C   0.7
T    E   0.6
Q    E   0.5
S    E   0.5
K    E   0.5
V    E   0.6
L    C   0.6
G    C   0.6
D    E   0.6
W    E   0.5
T    E   0.6
P    E   0.7
T    C   0.9
L    C   0.9
P    C   1.0
END     



