
PFRMAT AL
TARGET T0103
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  3
PARENT 1au9_
K 6 A 1
G 7 Q 2
H 8 S 3
N 9 V 4
P 10 P 5
T 11 Y 6
E 12 G 7
F 13 V 8
P 14 S 9
T 15 Q 10
I 16 I 11
Y 17 K 12
D 18 A 13
A 19 P 14
S 20 A 15
S 21 L 16
A 22 H 17
P 23 S 18
T 24 Q 19
A 25 G 20
A 26 S 24
N 27 N 25
T 28 V 26
T 29 K 27
V 30 V 28
G 31 A 29
I 32 V 30
I 33 I 31
T 34 D 32
I 35 S 33
G 36 G 34
G 37 I 35
V 38 D 36
S 39 S 37
Q 40 S 38
T 41 H 39
L 42 P 40
Q 43 D 41
D 44 G 46
L 45 G 47
Q 46 A 48
Q 47 S 49
F 48 F 50
T 49 V 51
S 50 P 52
A 51 S 53
N 52 E 54
G 53 T 55
L 54 N 56
A 55 P 57
S 56 D 60
V 57 N 61
N 58 N 62
T 59 S 63
Q 60 H 64
T 61 G 65
I 62 T 66
Q 63 H 67
T 64 V 68
G 65 A 69
S 66 G 70
S 67 T 71
N 68 V 72
G 69 A 73
D 70 A 74
Y 71 L 75
S 72 N 76
D 73 N 77
D 74 S 78
Q 75 I 79
Q 76 G 80
G 77 V 81
Q 78 L 82
G 79 G 83
E 80 V 84
W 81 A 85
D 82 P 86
L 83 C 87
D 84 A 88
S 85 S 89
Q 86 L 90
S 87 Y 91
I 88 A 92
V 89 V 93
G 90 K 94
S 91 V 95
A 92 L 96
G 93 G 97
G 94 A 98
A 95 D 99
V 96 G 100
Q 97 S 101
D 105 G 102
Q 106 Q 103
S 107 Y 104
A 108 S 105
S 109 W 106
G 110 I 107
N 111 I 108
T 112 N 109
G 113 G 110
L 114 I 111
T 115 E 112
Q 116 W 113
A 117 A 114
F 118 I 115
N 119 A 116
N 125 N 117
V 126 N 118
A 127 M 119
K 128 D 120
V 129 V 121
I 130 I 122
N 131 N 123
V 132 M 124
S 133 S 125
L 134 L 126
G 135 G 127
W 136 G 128
C 137 P 129
E 138 S 130
A 139 G 131
L 147 S 132
Q 148 A 133
A 149 A 134
E 150 L 135
D 151 K 136
R 152 A 137
I 153 A 138
F 154 V 139
A 155 D 140
T 156 K 141
A 157 A 142
A 158 V 143
A 159 A 144
Q 160 S 145
G 161 G 146
Q 162 V 147
T 163 V 148
F 164 V 149
S 165 V 150
V 166 A 151
S 167 A 152
S 168 A 153
G 169 G 154
D 170 N 155
E 171 E 156
G 172 G 157
V 173 T 158
D 183 S 159
G 184 G 160
S 185 S 161
T 186 S 162
Y 187 S 163
S 188 T 164
V 189 V 165
S 190 G 166
W 191 Y 167
P 192 P 168
A 193 A 169
S 194 K 170
S 195 Y 171
P 196 P 172
N 197 S 173
V 198 V 174
I 199 I 175
A 200 A 176
V 201 V 177
G 202 G 178
G 203 A 179
T 204 V 180
T 205 D 181
L 206 S 182
Y 207 S 183
T 208 N 184
T 233 Q 185
G 234 R 186
G 235 A 187
G 236 S 188
Y 237 F 189
S 238 S 190
V 239 S 191
Y 240 V 192
E 241 G 193
P 244 P 194
S 245 E 195
W 246 L 196
Q 247 D 197
S 248 V 198
V 249 M 199
V 250 A 200
S 251 P 201
G 252 G 202
T 253 V 203
P 254 S 204
G 255 I 205
R 256 C 206
R 257 S 207
L 258 T 208
L 259 L 209
P 260 P 210
D 261 G 211
I 262 N 212
Q 279 K 213
L 280 Y 214
Q 281 G 215
Q 282 A 216
I 283 K 217
G 284 S 218
G 285 G 219
T 286 T 220
S 287 S 221
L 288 M 222
A 289 A 223
S 290 S 224
P 291 P 225
I 292 H 226
F 293 V 227
V 294 A 228
G 295 G 229
L 296 A 230
W 297 A 231
A 298 A 232
R 299 L 233
L 300 I 234
Q 301 L 235
S 302 S 236
A 303 K 237
N 304 H 238
S 305 P 239
N 306 N 240
S 307 W 241
L 308 T 242
G 309 N 243
F 310 T 244
P 311 Q 245
A 312 V 246
A 313 R 247
S 314 S 248
F 315 S 249
Y 316 L 250
S 320 E 251
S 321 N 252
T 322 T 253
P 323 T 254
S 324 T 255
L 325 K 256
V 326 L 257
H 327 G 258
D 328 D 259
V 329 S 260
K 330 F 261
S 331 Y 262
G 332 Y 263
N 333 G 264
N 334 K 265
G 335 G 266
TER
END

