
PFRMAT AL
TARGET T0103
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1DUI_A
REMARK DATE	2000-01-28
REMARK SCORE	?
K 6 A 1
G 7 K 2
H 8 C 3
N 9 V 4
P 10 S 5
T 11 Y 6
E 12 G 7
F 13 V 8
P 14 S 9
T 15 Q 10
I 16 I 11
Y 17 K 12
D 18 A 13
A 19 H 17
S 20 S 18
S 21 Q 19
A 22 G 20
P 23 Y 21
T 24 T 22
A 25 G 23
A 26 S 24
N 27 N 25
T 28 V 26
T 29 K 27
V 30 V 28
G 31 A 29
I 32 V 30
I 33 I 31
T 34 D 32
I 35 S 33
G 36 G 34
G 37 I 35
V 38 D 36
S 39 S 37
Q 40 S 38
T 41 H 39
L 42 P 40
Q 43 D 41
D 44 L 42
L 45 N 43
Q 46 V 44
Q 47 A 45
F 48 G 46
T 49 G 47
S 50 A 48
A 51 S 49
N 52 F 50
G 53 V 51
L 54 P 52
A 55 S 53
S 56 E 54
V 57 T 55
N 58 N 56
T 59 P 57
Q 60 F 58
T 61 Q 59
I 62 D 60
Q 63 N 61
T 64 N 62
G 65 S 63
S 66 H 64
S 67 G 65
N 68 T 66
G 69 H 67
D 70 V 68
Y 71 A 69
S 72 G 70
D 73 T 71
D 74 V 72
D 84 L 73
S 85 A 74
Q 86 V 84
S 87 A 85
I 88 P 86
V 89 S 87
G 90 A 88
S 91 S 89
A 92 L 90
G 93 Y 91
G 94 A 92
A 95 V 93
V 96 K 94
Q 97 V 95
Q 98 L 96
L 99 G 97
L 100 A 98
F 101 D 99
Y 102 G 100
M 103 S 101
A 104 G 102
D 105 Q 103
Q 106 Y 104
S 107 S 105
A 108 W 106
S 109 I 107
G 110 I 108
N 111 N 109
T 112 G 110
G 113 I 111
L 114 E 112
T 115 W 113
Q 116 A 114
A 117 I 115
F 118 A 116
N 119 N 117
Q 120 N 118
A 121 M 119
V 122 D 120
S 123 V 121
D 124 I 122
N 125 N 123
V 126 M 124
A 127 S 125
K 128 L 126
V 129 G 127
I 130 G 128
N 131 P 129
V 132 S 130
S 133 G 131
L 134 S 132
G 135 A 133
W 136 A 134
C 137 L 135
E 138 K 136
A 139 A 137
D 140 A 138
A 141 V 139
N 142 D 140
A 143 K 141
D 144 A 142
G 145 V 143
T 146 A 144
L 147 S 145
Q 148 G 146
A 149 V 147
E 150 V 148
D 151 V 149
R 152 V 150
I 153 A 151
F 154 A 152
A 155 A 153
T 156 G 154
A 157 N 155
A 158 E 156
A 159 G 157
Q 160 T 158
G 161 S 159
Q 162 G 160
T 163 S 161
F 164 S 162
S 165 S 163
V 166 T 164
S 167 V 165
S 168 G 166
G 169 Y 167
D 170 P 168
E 171 G 169
G 172 K 170
V 173 Y 171
Y 174 P 172
E 175 S 173
C 176 V 174
N 177 I 175
N 178 A 176
R 179 V 177
G 180 G 178
Y 181 A 179
P 182 V 180
D 183 D 181
G 184 S 182
S 185 S 183
T 186 N 184
Y 187 Q 185
S 188 R 186
V 189 A 187
S 190 S 188
W 191 F 189
P 192 S 190
A 193 S 191
S 194 V 192
S 195 G 193
P 196 P 194
N 197 E 195
V 198 L 196
I 199 D 197
A 200 V 198
V 201 M 199
G 202 A 200
G 203 P 201
T 204 G 202
T 205 V 203
L 206 S 204
Y 207 I 205
T 208 C 206
T 209 S 207
S 210 T 208
A 211 L 209
G 212 P 210
A 213 G 211
Y 214 N 212
S 215 K 213
N 216 Y 214
E 217 G 215
T 218 A 216
V 219 K 217
W 220 S 218
N 221 G 219
E 222 T 220
G 223 S 221
L 224 M 222
D 225 A 223
S 226 S 224
N 227 P 225
G 228 H 226
K 229 V 227
L 230 A 228
W 231 G 229
A 232 A 230
T 233 A 231
G 234 A 232
G 235 L 233
G 236 I 234
Y 237 L 235
S 238 S 236
V 239 K 237
Y 240 H 238
E 241 P 239
S 242 N 240
K 243 W 241
P 244 T 242
S 245 N 243
W 246 T 244
Q 247 Q 245
S 248 V 246
V 249 R 247
V 250 S 248
S 251 S 249
G 252 L 250
T 253 E 251
P 254 N 252
G 255 T 253
R 256 T 254
R 257 T 255
L 258 K 256
L 259 L 257
P 260 G 258
D 261 N 259
I 262 S 260
S 263 F 261
F 264 Y 262
D 265 Y 263
A 266 G 264
A 267 K 265
Q 268 G 266
G 269 L 267
T 270 I 268
G 271 N 269
A 272 V 270
L 273 Q 271
I 274 A 272
Y 275 A 273
N 276 A 274
Y 277 Q 275
TER
END

