
PFRMAT AL
TARGET T0103
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  2
PARENT 3VSB
REMARK DATE	1998-03-25
REMARK SCORE	?
K 6 A 1
G 7 Q 2
H 8 T 3
N 9 V 4
P 10 P 5
T 11 Y 6
E 12 G 7
F 13 I 8
P 14 P 9
T 15 L 10
I 16 I 11
Y 17 K 12
D 18 A 13
A 19 Q 17
S 20 A 18
S 21 Q 19
A 22 G 20
P 23 F 21
T 24 K 22
A 25 G 23
A 26 A 24
N 27 N 25
T 28 V 26
T 29 K 27
V 30 V 28
G 31 A 29
I 32 V 30
I 33 L 31
T 34 D 32
I 35 T 33
G 36 G 34
G 37 I 35
V 38 Q 36
S 39 A 37
Q 40 S 38
T 41 H 39
L 42 P 40
Q 43 D 41
D 44 L 42
L 45 N 43
Q 46 V 44
Q 47 V 45
F 48 G 46
T 49 G 47
S 50 A 48
A 51 S 49
N 52 F 50
G 53 V 51
L 54 A 52
A 55 G 53
S 56 E 54
V 57 A 55
N 58 Y 57
T 59 N 58
Q 60 T 59
T 61 D 60
I 62 G 61
Q 63 N 62
T 64 G 63
G 65 H 64
S 66 G 65
S 67 T 66
N 68 H 67
G 69 V 68
D 70 A 69
Y 71 G 70
S 72 T 71
D 73 V 72
D 74 A 73
Q 75 A 74
Q 76 L 75
G 77 D 76
Q 78 N 77
G 79 T 78
E 80 T 79
W 81 G 80
D 82 V 81
L 83 L 82
D 84 G 83
S 85 V 84
Q 86 A 85
S 87 P 86
I 88 S 87
V 89 V 88
G 90 S 89
S 91 L 90
A 92 Y 91
G 93 A 92
G 94 V 93
A 95 K 94
V 96 V 95
Q 97 L 96
Q 98 N 97
L 99 S 98
L 100 S 99
F 101 G 100
Y 102 S 101
M 103 G 102
A 104 S 103
D 105 Y 104
Q 106 S 105
S 107 G 106
A 108 I 107
S 109 V 108
G 110 S 109
N 111 G 110
T 112 I 111
G 113 E 112
L 114 W 113
T 115 A 114
Q 116 T 115
A 117 T 116
F 118 N 117
N 119 G 118
Q 120 M 119
A 121 D 120
V 122 V 121
S 123 I 122
D 124 N 123
N 125 M 124
V 126 S 125
A 127 L 126
K 128 G 127
V 129 G 128
I 130 A 129
N 131 S 130
V 132 G 131
S 133 S 132
L 134 T 133
G 135 A 134
W 136 M 135
C 137 K 136
E 138 Q 137
A 139 A 138
D 140 V 139
A 141 D 140
N 142 N 141
A 143 A 142
D 144 Y 143
G 145 A 144
T 146 R 145
L 147 G 146
Q 148 V 147
A 149 V 148
E 150 V 149
D 151 V 150
R 152 A 151
I 153 A 152
F 154 A 153
A 155 G 154
T 156 N 155
A 157 S 156
A 158 G 157
A 159 N 158
Q 160 S 159
G 161 G 160
Q 162 S 161
T 163 T 162
F 164 N 163
S 165 T 164
V 166 I 165
S 167 G 166
S 168 Y 167
G 169 P 168
D 170 A 169
E 171 K 170
G 172 Y 171
V 173 D 172
Y 174 S 173
E 175 V 174
C 176 I 175
N 177 A 176
N 178 V 177
R 179 G 178
G 180 A 179
Y 181 V 180
P 182 D 181
D 183 S 182
G 184 N 183
S 185 S 184
T 186 N 185
Y 187 R 186
S 188 A 187
V 189 S 188
S 190 F 189
W 191 S 190
P 192 S 191
A 193 V 192
S 194 G 193
S 195 A 194
P 196 E 195
N 197 L 196
V 198 E 197
I 199 V 198
A 200 M 199
V 201 A 200
G 202 P 201
G 203 G 202
T 204 A 203
T 205 G 204
L 206 V 205
Y 207 Y 206
T 208 S 207
T 209 T 208
S 210 Y 209
A 211 P 210
G 212 T 211
A 213 N 212
Y 214 T 213
S 215 Y 214
N 216 A 215
E 217 T 216
T 218 L 217
V 219 N 218
W 220 G 219
N 221 T 220
G 223 M 222
L 224 A 223
D 225 S 224
S 226 P 225
N 227 H 226
G 228 V 227
K 229 A 228
L 230 G 229
W 231 A 230
A 232 A 231
T 233 A 232
G 234 L 233
G 235 I 234
G 236 L 235
Y 237 S 236
S 238 K 237
V 239 H 238
Y 240 P 239
E 241 N 240
S 242 L 241
K 243 S 242
P 244 A 243
S 245 S 244
W 246 Q 245
Q 247 V 246
S 248 R 247
V 249 N 248
V 250 R 249
S 251 L 250
G 252 S 251
T 253 S 252
P 254 T 253
G 255 A 254
R 256 T 255
R 257 Y 256
L 258 L 257
L 259 G 258
P 260 S 259
D 261 S 260
I 262 F 261
S 263 Y 262
F 264 Y 263
D 265 G 264
A 266 K 265
A 267 G 266
Q 268 L 267
G 269 I 268
T 270 N 269
G 271 V 270
A 272 E 271
L 273 A 272
I 274 A 273
Y 275 A 274
N 276 Q 275
TER
END

