
PFRMAT AL
TARGET T0103
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  4
PARENT 1DBI_A
REMARK DATE	1999-12-21
REMARK SCORE	?
T 4 T 6
A 5 Y 7
K 6 Y 8
G 7 Q 9
H 8 G 10
N 9 Y 11
P 10 Q 12
T 11 Y 13
E 12 G 14
F 13 P 15
P 14 Q 16
T 15 N 17
I 16 T 18
Y 17 Y 19
D 18 A 23
A 19 W 24
S 20 D 25
S 21 V 26
A 22 T 27
P 23 K 28
T 24 G 29
A 25 S 30
A 26 S 31
N 27 G 32
T 28 Q 33
T 29 E 34
V 30 I 35
G 31 A 36
I 32 V 37
I 33 I 38
T 34 D 39
I 35 T 40
G 36 G 41
G 37 V 42
V 38 D 43
S 39 Y 44
Q 40 T 45
T 41 H 46
L 42 P 47
Q 43 D 48
D 44 L 49
L 45 D 50
Q 46 G 51
Q 47 K 52
F 48 V 53
T 49 I 54
S 50 K 55
A 51 G 56
N 52 Y 57
G 53 D 58
L 54 F 59
A 55 V 60
S 56 D 61
V 57 N 62
N 58 D 63
T 59 Y 64
Q 60 D 65
T 61 P 66
I 62 M 67
Q 63 D 68
T 64 L 69
G 65 N 70
S 66 N 71
S 67 H 72
N 68 G 73
G 69 T 74
D 70 H 75
Y 71 V 76
S 72 A 77
D 73 G 78
D 74 I 79
Q 75 A 80
Q 76 A 81
G 77 A 82
Q 78 E 83
G 79 T 84
E 80 N 85
W 81 N 86
D 82 A 87
L 83 G 89
D 84 I 90
S 85 A 91
Q 86 G 92
S 87 M 93
I 88 A 94
V 89 P 95
G 90 N 96
S 91 T 97
A 92 R 98
G 93 I 99
G 94 L 100
A 95 A 101
V 96 V 102
Q 97 R 103
Q 98 A 104
L 99 L 105
L 100 D 106
F 101 R 107
Y 102 N 108
M 103 G 109
A 104 S 110
D 105 G 111
Q 106 T 112
S 107 L 113
A 108 S 114
S 109 D 115
G 110 I 116
N 111 A 117
T 112 D 118
G 113 A 119
L 114 I 120
T 115 I 121
Q 116 Y 122
A 117 A 123
F 118 A 124
N 119 D 125
Q 120 S 126
A 121 G 127
V 122 A 128
S 123 E 129
D 124 V 130
N 125 I 131
V 126 N 132
A 127 L 133
K 128 S 134
V 129 L 135
I 130 G 136
N 131 C 137
V 132 D 138
S 133 C 139
L 134 H 140
G 135 T 141
W 136 T 142
C 137 T 143
E 138 L 144
A 139 E 145
D 140 N 146
A 141 A 147
N 142 V 148
A 143 N 149
D 144 Y 150
G 145 A 151
T 146 W 152
L 147 N 153
Q 148 K 154
A 149 G 155
E 150 S 156
D 151 V 157
R 152 V 158
I 153 V 159
F 154 A 160
A 155 A 161
T 156 A 162
A 157 G 163
A 158 N 164
A 159 N 165
G 169 S 175
D 170 Y 176
E 171 E 177
G 172 N 178
V 173 V 179
Y 174 I 180
E 175 A 181
C 176 V 182
N 177 G 183
N 178 A 184
R 179 V 185
G 180 D 186
Y 181 Q 187
P 182 Y 188
D 183 D 189
G 184 R 190
S 185 L 191
T 186 A 192
Y 187 S 193
S 188 F 194
V 189 S 195
S 190 N 196
W 191 Y 197
P 192 G 198
A 193 T 199
S 194 W 200
S 195 V 201
P 196 D 202
N 197 V 203
V 198 V 204
I 199 A 205
A 200 P 206
V 201 G 207
G 202 V 208
G 203 D 209
T 204 I 210
T 205 V 211
L 206 S 212
Y 207 T 213
T 208 I 214
T 209 T 215
S 210 G 216
A 211 N 217
G 212 R 218
A 213 Y 219
Y 214 A 220
S 215 Y 221
N 216 M 222
E 217 S 223
T 218 G 224
V 219 T 225
W 220 S 226
N 221 M 227
E 222 A 228
G 223 S 229
L 224 P 230
D 225 H 231
S 226 V 232
N 227 A 233
G 228 G 234
K 229 L 235
L 230 A 236
W 231 A 237
A 232 L 238
T 233 L 239
G 234 A 240
G 235 S 241
G 236 Q 242
Y 237 G 243
S 238 R 244
V 239 N 245
Y 240 N 246
E 241 I 247
S 242 E 248
K 243 I 249
P 244 R 250
S 245 Q 251
W 246 A 252
Q 247 I 253
S 248 E 254
V 249 Q 255
V 250 T 256
S 251 A 257
G 252 D 258
T 253 K 259
P 254 I 260
G 255 S 261
R 256 G 262
R 257 T 263
L 258 G 264
L 259 T 265
P 260 Y 266
D 261 F 267
I 262 K 268
S 263 Y 269
F 264 G 270
D 265 R 271
A 266 I 272
A 267 N 273
Q 268 S 274
G 269 Y 275
T 270 N 276
G 271 A 277
A 272 V 278
L 273 T 279
I 274 Y 280
TER
END

