
PFRMAT AL
TARGET T0103
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  1
PARENT 1dyu_B
A   1    D   11
A   2    K   12
G   3    T   13
T   4    L   14
A   5    K   15
K   6    E   16
G   7    F   17
H   8    G   18
N   9    A   19
P  10    D   20
T  11    V   21
E  12    Q   22
I  16    D   25
Y  17    Y   26
D  18    A   27
A  19    Q   28
P  23    K   40
T  24    V   41
A  25    K   42
A  26    P   43
N  27    G   44
T  28    A   45
T  29    Q   46
T  34    I   49
I  35    V   50
G  36    N   51
G  37    G   52
Q  43    N   76
D  44    D   77
L  45    V   78
Q  46    F   79
Q  47    Q   80
F  48    S   81
T  49    G   82
S  50    L   83
A  51    D   84
N  52    Q   85
G  53    T   86
L  54    F   87
A  55    Q   88
S  56    V   89
V  57    E   90
N  58    K   91
T  59    R   92
Q  60    P   93
T  61    H   94
I  62    P   95
Q  63    L   96
T  64    N   97
G  65    A   98
S  66    L   99
S  67    T  100
N  68    A  101
G  69    D  102
D  70    E  103
D  74    Q  106
Q  78    K  112
G  79    A  113
E  80    S  114
W  81    A  115
D  82    D  116
L  83    F  117
D  84    K  118
S  85    P  119
Q  86    N  120
S  87    T  121
I  88    R  122
V  89    F  123
G  90    T  124
S  91    E  125
A  92    I  126
G  93    S  127
G  94    L  128
A  95    L  129
V  96    P  130
Q  97    P  131
Q  98    D  132
L  99    K  133
M 103    E  142
A 104    N  143
D 105    K  144
Q 106    P  145
S 107    V  146
A 108    D  147
S 109    Q  148
G 110    P  149
N 111    R  150
T 112    K  151
G 113    A  152
L 114    D  153
T 115    V  154
Q 116    I  155
A 117    M  156
F 118    L  157
N 119    D  158
Q 120    G  159
A 121    K  160
A 127    Q  178
K 128    P  179
V 129    I  180
I 130    K  181
N 131    D  182
V 132    A  183
S 133    H  184
L 134    G  185
G 135    M  186
W 136    V  187
C 137    L  188
E 138    L  189
A 139    D  190
A 143    A  193
D 144    S  194
G 145    V  195
T 146    Q  196
L 147    N  197
Q 148    I  198
A 149    I  199
E 150    N  200
D 151    N  201
R 152    S  202
I 153    E  203
F 154    E  204
A 155    F  205
T 156    A  206
A 157    A  207
A 158    A  208
A 159    V  209
Q 160    K  210
G 161    K  211
Q 162    R  212
T 163    G  213
F 164    I  214
S 168    A  217
G 169    K  218
D 170    K  219
E 171    V  220
G 172    I  221
V 173    T  222
Y 174    T  223
E 175    P  224
C 176    L  225
N 177    T  226
N 178    V  227
R 179    G  228
G 180    Y  229
Y 181    F  230
P 182    D  231
D 183    G  232
G 184    K  233
S 185    D  234
T 186    G  235
Y 187    L  236
S 188    K  237
V 189    Q  238
S 190    D  239
W 191    A  240
P 192    R  241
A 193    L  242
S 194    L  243
S 195    K  244
P 196    V  245
N 197    I  246
V 198    S  247
I 199    Y  248
A 200    L  249
V 201    D  250
G 202    V  251
G 203    G  252
T 204    D  253
T 205    G  254
L 206    N  255
Y 207    Y  256
T 208    W  257
T 209    A  258
S 210    H  259
A 211    P  260
G 212    I  261
A 213    E  262
Y 214    N  263
S 215    L  264
N 216    V  265
E 217    A  266
T 218    V  267
V 219    V  268
W 220    D  269
N 221    L  270
E 222    E  271
G 223    Q  272
L 224    K  273
D 225    K  274
S 226    I  275
N 227    V  276
G 228    K  277
G 234    E  280
G 235    G  281
G 236    P  282
Y 237    V  283
S 238    V  284
V 239    P  285
Y 240    V  286
E 241    P  287
S 242    M  288
K 243    T  289
P 244    A  290
S 245    R  291
W 246    P  292
Q 247    F  293
S 248    D  294
V 249    G  295
V 250    R  296
S 251    D  297
G 252    R  298
T 253    V  299
P 254    A  300
G 255    P  301
R 256    A  302
R 257    V  303
L 258    K  304
L 259    P  305
P 260    M  306
D 261    Q  307
A 266    K  400
A 267    D  401
Q 268    A  402
G 269    P  403
T 270    S  404
G 271    N  405
A 272    A  406
L 273    V  407
I 274    L  408
Y 275    L  409
N 276    N  410
Y 277    E  411
G 278    T  412
Q 279    I  413
L 280    A  414
Q 281    D  415
Q 282    Y  416
I 283    T  417
G 284    G  418
G 285    V  419
T 286    P  420
S 287    M  421
L 288    E  422
A 289    I  423
S 290    P  424
P 291    R  425
I 292    A  426
F 293    I  427
V 294    A  428
G 295    V  429
L 296    F  430
W 297    E  431
A 298    R  432
R 299    Y  433
A 303    P  436
S 307    E  451
L 308    R  452
G 309    R  453
F 310    E  454
P 311    L  455
A 312    V  456
A 313    V  457
S 314    R  458
F 315    W  459
Y 316    I  460
S 317    S  461
A 318    T  462
I 319    V  463
S 320    G  464
S 321    N  465
T 322    X  466
P 323    D  467
S 324    Y  468
L 325    I  469
V 326    F  470
H 327    D  471
D 328    W  472
V 329    I  473
K 330    F  474
S 331    H  475
G 332    E  476
N 333    N  477
N 334    G  478
G 335    T  479
Y 336    I  480
G 337    G  481
G 338    I  482
Y 339    D  483
G 340    A  484
Y 341    G  485
N 342    A  486
A 343    T  487
G 344    G  488
T 345    I  489
G 346    E  490
W 347    A  491
D 348    V  492
Y 349    K  493
P 350    G  494
T 351    V  495
G 352    K  496
W 353    A  497
G 354    K  498
S 355    T  499
L 356    M  500
D 357    H  501
I 358    D  502
A 359    E  503
K 360    T  504
L 361    A  505
S 362    K  506
A 363    D  507
Y 364    D  508
I 365    T  509
R 366    R  510
S 367    Y  511
N 368    G  512
G 369    T  513
F 370    L  514
G 371    I  515
H 372    D  516
TER
END


