
PFRMAT AL
TARGET T0103
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  2
PARENT 1tcm_A
A   1    G   56
A   2    I   57
G   3    I   58
T   4    N   59
A   5    K   60
K   6    I   61
G   7    N   62
H   8    D   63
N   9    G   64
P  10    Y   65
P  14    G   68
T  15    M   69
I  16    G   70
Y  17    V   71
D  18    T   72
A  19    A   73
S  20    I   74
S  21    W   75
A  22    I   76
P  23    S   77
T  24    Q   78
A  25    P   79
A  26    V   80
N  27    E   81
T  28    N   82
T  29    I   83
V  30    Y   84
G  31    S   85
I  32    I   86
G  37    P  110
T  41    A  116
Q  46    I  122
Q  47    A  123
F  48    A  124
T  49    A  125
S  50    H  126
A  51    A  127
N  52    K  128
G  53    N  129
L  54    I  130
A  55    K  131
S  56    V  132
V  57    I  133
N  58    I  134
T  59    D  135
Q  60    F  136
T  61    A  137
I  62    P  138
Q  63    N  139
T  64    H  140
G  65    T  141
S  66    S  142
S  67    P  143
N  68    A  144
G  69    S  145
D  70    S  146
Q  75    L  194
Q  76    Y  195
G  77    D  196
Q  78    L  197
G  79    A  198
E  80    D  199
W  81    L  200
D  82    N  201
L  83    H  202
D  84    N  203
S  85    N  204
Q  86    S  205
S  87    T  206
A  92    V  209
V  96    I  215
Q  97    K  216
Q  98    M  217
L  99    W  218
M 103    A  245
A 108    E  275
S 109    S  276
G 110    G  277
N 111    M  278
T 112    S  279
G 113    L  280
L 114    L  281
T 115    D  282
Q 116    F  283
A 117    R  284
F 118    F  285
N 119    A  286
Q 120    Q  287
V 126    V  317
A 127    D  318
K 128    D  319
V 129    Q  320
I 130    V  321
N 131    T  322
V 132    F  323
S 133    I  324
L 134    D  325
G 135    N  326
W 136    H  327
C 137    D  328
E 138    M  329
A 143    S  335
D 144    N  336
G 145    A  337
T 146    N  338
L 147    R  339
Q 148    R  340
A 149    K  341
E 150    L  342
D 151    E  343
R 152    Q  344
I 153    A  345
F 154    L  346
A 155    A  347
T 156    F  348
A 157    T  349
A 158    L  350
A 159    T  351
Q 160    S  352
G 161    R  353
Q 162    G  354
T 163    V  355
F 164    P  356
S 165    A  357
V 166    I  358
S 167    Y  359
R 179    W  413
G 180    I  414
Y 181    N  415
P 182    N  416
D 183    D  417
G 184    V  418
S 185    L  419
T 186    I  420
Y 187    Y  421
S 188    E  422
V 189    R  423
S 190    K  424
W 191    F  425
P 192    G  426
A 193    S  427
S 194    N  428
S 195    V  429
P 196    A  430
N 197    V  431
V 198    V  432
I 199    A  433
A 200    V  434
V 201    N  435
G 202    R  436
G 203    N  437
T 204    L  438
T 205    N  439
L 206    A  440
Y 207    P  441
T 208    A  442
T 209    S  443
S 210    I  444
A 211    S  445
G 212    G  446
A 213    L  447
Y 214    V  448
S 215    T  449
N 216    S  450
E 217    L  451
T 218    P  452
E 222    S  473
G 223    G  474
L 224    G  475
D 225    A  476
S 226    A  477
N 227    S  478
G 228    N  479
K 229    F  480
L 230    T  481
W 231    L  482
A 232    A  483
T 233    A  484
G 234    G  485
G 235    G  486
G 236    T  487
Y 237    A  488
S 238    V  489
V 239    W  490
Y 240    Q  491
E 241    Y  492
S 242    T  493
K 243    A  494
P 244    A  495
S 245    T  496
W 246    A  497
Q 247    T  498
S 248    P  499
V 249    T  500
V 250    I  501
S 251    G  502
G 252    H  503
T 253    V  504
P 254    G  505
G 255    P  506
R 256    M  507
R 257    M  508
L 258    A  509
L 259    K  510
P 260    P  511
D 261    G  512
A 266    N  560
G 271    G  584
A 272    D  585
L 273    Q  586
I 274    V  587
Y 275    S  588
N 276    V  589
Y 277    R  590
G 278    F  591
Q 279    V  592
L 280    V  593
Q 281    N  594
Q 282    N  595
I 283    A  596
G 284    T  597
G 285    T  598
T 286    A  599
S 287    L  600
L 288    G  601
A 289    Q  602
S 290    N  603
P 291    V  604
I 292    Y  605
F 293    L  606
V 294    T  607
G 295    G  608
L 296    S  609
W 297    V  610
A 298    S  611
R 299    E  612
L 300    L  613
Q 301    G  614
S 305    D  617
N 306    P  618
S 307    A  619
L 308    K  620
G 309    A  621
F 310    I  622
P 311    G  623
A 312    P  624
A 313    M  625
S 314    Y  626
F 315    N  627
Y 316    Q  628
S 317    V  629
A 318    V  630
I 319    Y  631
S 320    Q  632
S 321    Y  633
T 322    P  634
P 323    N  635
S 324    W  636
L 325    Y  637
V 326    Y  638
H 327    D  639
D 328    V  640
V 329    S  641
K 330    V  642
S 331    P  643
G 332    A  644
N 333    G  645
N 334    K  646
G 335    T  647
Y 336    I  648
G 337    E  649
G 338    F  650
Y 339    K  651
G 340    F  652
Y 341    L  653
N 342    K  654
A 343    K  655
G 344    Q  656
T 345    G  657
G 346    S  658
W 347    T  659
D 348    V  660
Y 349    T  661
P 350    W  662
T 351    E  663
G 352    G  664
W 353    G  665
G 354    S  666
S 355    N  667
L 356    H  668
D 357    T  669
I 358    F  670
A 359    T  671
K 360    A  672
L 361    P  673
S 362    S  674
A 363    S  675
Y 364    G  676
I 365    T  677
R 366    A  678
S 367    T  679
N 368    I  680
G 369    N  681
F 370    V  682
G 371    N  683
H 372    W  684
TER
END


