
PFRMAT AL
TARGET T0103
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  3
PARENT 6cgt
A   1    Q   55
A   2    G   56
G   3    L   57
T   4    I   58
A   5    N   59
K   6    K   60
G   7    I   61
H   8    N   62
N   9    D   63
P  10    N   64
T  11    Y   65
E  12    F   66
F  13    S   67
P  14    D   68
T  15    L   69
I  16    G   70
Y  17    V   71
D  18    T   72
A  19    A   73
S  20    L   74
S  21    W   75
A  22    I   76
P  23    S   77
T  24    Q   78
A  25    P   79
A  26    V   80
N  27    E   81
T  28    N   82
T  29    I   83
V  30    F   84
G  31    A   85
I  32    T   86
I  33    I   87
T  34    N   88
I  35    Y   89
G  36    S   90
G  37    G   91
V  38    V   92
S  39    T   93
Q  40    N   94
T  41    T   95
L  42    A   96
Q  43    Y   97
D  44    H   98
L  45    G   99
Q  46    Y  100
Q  47    W  101
F  48    A  102
T  49    R  103
S  50    D  104
A  51    F  105
N  52    K  106
G  53    K  107
V  57    Y  158
N  58    D  159
T  59    N  160
Q  60    G  161
S  66    T  206
D  70    K  212
D  74    I  215
G  79    S  245
D  84    K  275
S  85    S  276
Q  86    G  277
S  87    M  278
I  88    S  279
V  89    L  280
G  90    L  281
S  91    D  282
A  92    F  283
G  93    R  284
G  94    F  285
A  95    N  286
V  96    S  287
Q  97    A  288
Q  98    V  289
L  99    R  290
L 100    N  291
F 101    V  292
Y 102    F  293
M 103    R  294
A 104    D  295
D 105    N  296
Q 106    T  297
S 107    S  298
A 108    N  299
T 112    A  302
G 113    L  303
L 114    D  304
T 115    S  305
Q 116    M  306
A 117    I  307
F 118    N  308
N 119    S  309
Q 120    T  310
A 121    A  311
V 122    T  312
S 123    D  313
D 124    Y  314
N 125    N  315
V 126    Q  316
A 127    V  317
K 128    N  318
V 129    D  319
I 130    Q  320
N 131    V  321
V 132    T  322
S 133    F  323
L 134    I  324
G 135    D  325
W 136    N  326
C 137    H  327
E 138    D  328
A 139    M  329
D 140    D  330
A 141    R  331
N 142    F  332
A 143    K  333
D 144    T  334
G 145    S  335
T 146    A  336
L 147    V  337
Q 148    N  338
R 152    Q  344
I 153    A  345
F 154    L  346
A 155    A  347
T 156    F  348
A 157    T  349
A 158    L  350
A 159    T  351
Q 160    S  352
G 161    R  353
Q 162    G  354
T 163    V  355
F 164    P  356
S 165    A  357
V 166    I  358
S 167    Y  359
S 168    Y  360
G 169    G  361
D 170    T  362
E 171    E  363
G 172    Q  364
V 173    Y  365
R 179    N  389
S 185    A  482
T 186    A  483
Y 187    G  484
S 188    A  485
V 189    T  486
S 190    A  487
W 191    V  488
P 192    W  489
A 193    Q  490
S 194    Y  491
S 195    T  492
P 196    T  493
N 197    A  494
V 198    E  495
I 199    T  496
A 200    T  497
V 201    P  498
G 202    T  499
G 203    I  500
T 204    G  501
T 205    H  502
L 206    V  503
Y 207    G  504
T 208    P  505
T 209    V  506
S 210    M  507
A 211    G  508
G 212    K  509
A 213    P  510
Y 214    G  511
S 215    N  512
N 216    V  513
E 217    V  514
T 218    T  515
V 219    I  516
W 220    D  517
N 221    G  518
E 222    R  519
G 223    G  520
L 224    F  521
D 225    G  522
S 226    S  523
N 227    T  524
W 231    S  542
A 232    W  543
T 233    E  544
G 234    D  545
G 235    T  546
G 236    Q  547
Y 237    I  548
S 238    K  549
V 239    V  550
Y 240    T  551
E 241    I  552
S 242    P  553
K 243    S  554
P 244    V  555
S 245    A  556
W 246    A  557
Q 247    G  558
S 248    N  559
V 249    Y  560
V 250    A  561
S 251    V  562
G 252    K  563
T 253    V  564
P 254    A  565
G 255    A  566
R 256    S  567
R 257    G  568
L 258    V  569
L 259    N  570
P 260    S  571
D 261    N  572
I 262    A  573
S 263    Y  574
F 264    N  575
D 265    N  576
A 266    F  577
A 267    T  578
Q 268    I  579
G 269    L  580
T 270    T  581
G 271    G  582
A 272    D  583
L 273    Q  584
I 274    V  585
Y 275    T  586
N 276    V  587
Y 277    R  588
G 278    F  589
Q 279    V  590
L 280    V  591
Q 281    N  592
Q 282    N  593
I 283    A  594
G 284    S  595
G 285    T  596
T 286    T  597
S 287    L  598
L 288    G  599
A 289    Q  600
S 290    N  601
P 291    L  602
I 292    Y  603
F 293    L  604
V 294    T  605
G 295    G  606
L 296    N  607
W 297    V  608
A 298    A  609
R 299    E  610
L 300    L  611
Q 301    G  612
S 302    N  613
A 303    W  614
N 304    S  615
S 305    T  616
N 306    G  617
S 307    S  618
L 308    T  619
G 309    A  620
F 310    I  621
P 311    G  622
A 312    P  623
A 313    A  624
S 314    F  625
F 315    N  626
Y 316    Q  627
S 317    V  628
A 318    I  629
I 319    H  630
S 320    Q  631
S 321    Y  632
T 322    P  633
P 323    T  634
S 324    W  635
L 325    Y  636
V 326    Y  637
H 327    D  638
D 328    V  639
V 329    S  640
K 330    V  641
S 331    P  642
G 332    A  643
N 333    G  644
N 334    K  645
G 335    Q  646
Y 336    L  647
G 337    E  648
G 338    F  649
Y 339    K  650
G 340    F  651
Y 341    F  652
N 342    K  653
A 343    K  654
G 344    N  655
T 345    G  656
G 346    S  657
W 347    T  658
D 348    I  659
Y 349    T  660
P 350    W  661
T 351    E  662
G 352    S  663
W 353    G  664
G 354    S  665
S 355    N  666
L 356    H  667
D 357    T  668
I 358    F  669
A 359    T  670
K 360    T  671
L 361    P  672
S 362    A  673
A 363    S  674
Y 364    G  675
I 365    T  676
R 366    A  677
S 367    T  678
N 368    V  679
G 369    T  680
F 370    V  681
G 371    N  682
H 372    W  683
TER
END


