
PFRMAT AL
TARGET T0103
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  4
PARENT 4sli
A   1    E  187
A   2    R  188
G   3    V  189
T   4    F  190
A   5    N  191
K   6    T  192
G   7    V  193
H   8    A  194
N   9    L  195
P  10    K  196
T  11    A  197
E  12    D  198
F  13    A  199
P  14    A  200
T  15    N  201
I  16    K  202
Y  17    Q  203
D  18    C  204
A  19    R  205
S  20    L  206
S  21    F  207
A  22    A  208
P  23    N  209
T  24    G  210
A  25    E  211
A  26    L  212
N  27    L  213
T  28    A  214
T  29    T  215
V  30    L  216
G  31    D  217
I  32    K  218
I  33    D  219
T  34    A  220
I  35    F  221
G  36    K  222
G  37    F  223
V  38    I  224
S  39    S  225
Q  40    D  226
Q  46    Q  241
Q  47    G  242
F  48    K  243
T  49    I  244
S  50    A  245
A  51    Y  246
N  52    P  247
G  53    F  248
L  54    G  249
A  55    G  250
S  56    T  251
V  57    I  252
N  58    G  253
T  59    D  254
Q  60    I  255
T  61    K  256
I  62    V  257
Q  63    Y  258
T  64    S  259
G  65    N  260
S  66    A  261
S  67    L  262
N  68    S  263
G  69    D  264
D  70    E  265
D  74    I  268
G  79    A  283
E  80    G  284
W  81    D  285
D  82    V  286
L  83    T  287
D  84    E  288
S  85    S  289
Q  86    N  290
S  87    Y  291
I  88    F  292
V  89    R  293
G  90    I  294
S  91    P  295
A  92    S  296
G  93    L  297
G  94    L  298
A  95    T  299
V  96    L  300
Q  97    S  301
Q  98    T  302
L  99    G  303
L 100    T  304
D 105    K  382
Q 106    L  383
S 107    T  384
A 108    K  385
S 109    R  386
G 110    I  387
N 111    F  388
T 112    L  389
G 113    F  390
L 114    A  391
T 115    D  392
Q 116    L  393
A 117    M  394
F 118    P  395
N 119    A  396
Q 120    G  397
A 121    I  398
V 122    G  399
S 123    S  400
D 124    S  401
N 125    N  402
V 126    A  403
A 127    S  404
K 128    V  405
V 129    G  406
I 130    S  407
N 131    G  408
V 132    F  409
S 133    K  410
L 134    E  411
G 135    V  412
W 136    N  413
C 137    G  414
E 138    K  415
N 142    E  436
A 143    K  437
D 144    G  438
G 145    V  439
A 149    N  442
E 150    D  443
D 151    A  444
R 152    T  445
T 156    P  448
G 161    D  454
Q 162    G  455
T 163    E  456
F 164    Y  457
S 165    N  458
V 166    L  459
S 167    Y  460
S 168    Q  461
G 169    H  462
D 170    D  463
E 171    T  464
G 172    N  465
V 173    L  466
Y 174    T  467
E 175    C  468
C 176    K  469
N 177    Q  470
N 178    Y  471
R 179    D  472
G 180    Y  473
Y 181    N  474
P 182    F  475
D 183    S  476
G 184    G  477
S 185    N  478
T 186    N  479
Y 187    L  480
S 188    I  481
V 189    E  482
S 190    S  483
W 191    K  484
P 192    T  485
A 193    D  486
S 194    V  487
S 195    D  488
P 196    V  489
N 197    N  490
V 198    M  491
I 199    N  492
A 200    I  493
V 201    F  494
G 202    Y  495
G 203    K  496
T 204    N  497
T 205    S  498
L 206    V  499
Y 207    F  500
T 208    K  501
T 209    A  502
S 210    F  503
A 211    P  504
G 212    T  505
A 213    N  506
Y 214    Y  507
S 215    L  508
N 216    A  509
E 217    M  510
T 218    R  511
V 219    Y  512
W 220    S  513
N 221    D  514
E 222    D  515
G 223    E  516
L 224    G  517
D 225    A  518
S 226    S  519
N 227    W  520
G 228    S  521
K 229    D  522
L 230    L  523
G 235    V  526
G 236    S  527
Y 237    S  528
S 238    F  529
V 239    K  530
Y 240    P  531
E 241    E  532
S 242    V  533
K 243    S  534
P 244    K  535
S 245    F  536
W 246    L  537
Q 247    V  538
S 248    V  539
V 249    G  540
V 250    P  541
S 251    G  542
G 252    I  543
T 253    G  544
P 254    K  545
G 255    Q  546
R 256    I  547
R 257    S  548
L 258    T  549
L 259    G  550
P 260    E  551
D 261    N  552
I 262    A  553
A 267    M  601
Q 268    P  602
G 269    D  603
T 270    G  604
G 271    S  605
A 272    L  606
L 273    K  607
I 274    T  608
Y 275    Y  609
N 276    L  610
Y 277    R  611
G 278    T  612
Q 279    G  613
L 280    S  614
Q 281    N  615
Q 282    C  616
T 286    G  637
S 287    I  638
L 288    S  639
A 289    T  640
S 290    T  641
P 291    S  642
I 292    Y  643
F 293    G  644
V 294    T  645
G 295    Q  646
L 296    L  647
W 297    S  648
A 298    V  649
R 299    I  650
L 300    N  651
Q 301    Y  652
S 305    P  655
N 306    I  656
S 307    D  657
L 308    G  658
A 312    D  685
A 313    T  686
S 314    G  687
F 315    N  688
Y 316    T  689
S 317    G  690
A 318    I  691
I 319    D  692
S 320    K  693
S 321    Y  694
T 322    S  695
P 323    V  696
S 324    E  697
L 325    W  698
V 326    K  699
H 327    Y  700
D 328    S  701
V 329    Y  702
K 330    A  703
S 331    V  704
G 332    D  705
N 333    T  706
N 334    P  707
G 335    Q  708
Y 336    M  709
G 337    G  710
G 338    Y  711
Y 339    S  712
G 340    Y  713
Y 341    S  714
N 342    C  715
A 343    L  716
G 344    A  717
T 345    E  718
G 346    L  719
W 347    P  720
D 348    D  721
Y 349    G  722
P 350    Q  723
T 351    V  724
G 352    G  725
W 353    L  726
G 354    L  727
S 355    Y  728
L 356    E  729
D 357    K  730
I 358    Y  731
A 359    D  732
K 360    S  733
L 361    W  734
S 362    S  735
A 363    R  736
Y 364    N  737
I 365    E  738
R 366    L  739
S 367    H  740
N 368    L  741
G 369    K  742
F 370    D  743
G 371    I  744
H 372    L  745
TER
END


