
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 9956-4641-5007
REMARK fully automated prediction by  p-map version 0.0.5 
METHOD P-Map 0.0.5
METHOD P-Map makes fully automated predictions using only sequence 
METHOD statistics (i.e., no 3-D models, no secondary structure 
METHOD predictions) to detect very distant sequence similarities.  
METHOD P-map constructs a multiple alignment in the manner of PSI-BLAST, 
METHOD but the statistical approach is very different.  
METHOD  
MODEL 4
PARENT 1CDO_A
D 4 K 8
N 5 C 9
L 6 K 10
S 7 A 11
A 8 A 12
V 9 V 13
L 10 A 14
Y 11 W 15
K 12 E 16
Q 13 A 17
N 14 N 18
D 15 K 19
L 16 L 21
R 17 V 22
L 18 I 23
E 19 E 24
Q 20 E 25
R 21 I 26
P 22 E 27
I 23 V 28
P 24 D 29
E 25 V 30
P 26 P 31
K 27 H 32
E 28 A 33
D 29 N 34
E 30 E 35
V 31 I 36
L 32 R 37
L 33 I 38
Q 34 K 39
M 35 I 40
A 36 I 41
Y 37 A 42
V 38 T 43
G 39 G 44
I 40 V 45
C 41 C 46
G 42 H 47
S 43 T 48
D 44 D 49
V 45 L 50
H 46 Y 51
Y 47 H 52
Y 48 L 53
E 49 F 54
H 50 E 55
G 51 G 56
R 52 K 57
I 53 H 58
A 54 K 59
D 55 D 60
F 56 G 61
I 57 F 62
P 61 P 63
M 62 V 64
V 63 V 65
I 64 L 66
G 65 G 67
H 66 H 68
E 67 E 69
A 68 G 70
S 69 A 71
G 70 G 72
T 71 I 73
V 72 V 74
V 73 E 75
K 74 S 76
V 75 V 77
G 76 G 78
K 77 P 79
N 78 G 80
V 79 V 81
K 80 T 82
H 81 E 83
L 82 F 84
K 83 Q 85
K 84 P 86
G 85 G 87
D 86 E 88
R 87 K 89
V 88 V 90
A 89 I 91
V 90 P 92
E 91 L 93
P 92 F 94
G 93 I 95
V 94 S 96
P 95 Q 97
C 96 C 98
R 97 G 99
R 98 E 100
C 99 C 101
Q 100 R 102
F 101 F 103
C 102 C 104
K 103 Q 105
E 104 S 106
G 105 P 107
K 106 K 108
Y 107 T 109
N 108 N 110
L 109 Q 111
C 110 C 112
P 111 V 113
D 112 K 114
L 113 G 115
T 114 W 116
F 115 A 117
C 116 N 118
A 117 E 119
T 118 S 120
P 119 P 121
P 120 L 142
D 121 G 143
D 122 T 144
G 123 S 145
N 124 T 146
L 125 F 147
A 126 S 148
R 127 Q 149
Y 128 Y 150
Y 129 T 151
V 130 V 152
H 131 V 153
A 132 N 154
A 133 Q 155
D 134 I 156
F 135 A 157
C 136 V 158
H 137 A 159
K 138 K 160
L 139 I 161
P 140 D 162
D 141 P 163
N 142 S 164
V 143 A 165
S 144 P 166
L 145 L 167
E 146 D 168
E 147 T 169
G 148 V 170
A 149 C 171
L 150 L 172
L 151 L 173
E 152 G 174
P 153 C 175
L 154 V 177
S 155 S 178
V 156 T 179
G 157 G 180
V 158 F 181
H 159 G 182
A 160 A 184
C 161 V 185
R 162 N 186
R 163 T 187
A 164 A 188
G 165 K 189
V 166 V 190
Q 167 E 191
L 168 P 192
G 169 G 193
T 170 S 194
T 171 T 195
V 172 C 196
L 173 A 197
V 174 V 198
I 175 F 199
G 176 G 200
A 177 L 201
G 178 G 202
P 179 A 203
I 180 V 204
G 181 G 205
L 182 L 206
V 183 A 207
S 184 A 208
V 185 V 209
L 186 M 210
A 187 G 211
A 188 C 212
K 189 H 213
A 190 S 214
Y 191 A 215
G 192 G 216
A 193 A 217
F 194 R 219
V 195 I 220
V 196 I 221
C 197 A 222
T 198 V 223
A 199 D 224
R 200 L 225
S 201 N 226
P 202 P 227
R 203 D 228
R 204 K 229
L 205 F 230
E 206 E 231
V 207 K 232
A 208 A 233
K 209 K 234
N 210 V 235
C 211 F 236
G 212 G 237
A 213 A 238
D 214 T 239
V 215 D 240
T 216 F 241
L 217 V 242
V 218 N 243
V 219 P 244
D 220 N 245
P 221 D 246
A 222 H 247
E 226 S 248
S 227 E 249
S 228 P 250
I 229 I 251
I 230 S 252
E 231 Q 253
R 232 V 254
I 233 L 255
R 234 S 256
S 235 K 257
A 236 M 258
I 237 T 259
G 238 N 260
D 239 G 261
L 240 G 262
P 241 V 263
N 242 D 264
V 243 F 265
T 244 S 266
I 245 L 267
D 246 E 268
C 247 C 269
S 248 V 270
G 249 G 271
N 250 N 272
E 251 V 273
K 252 G 274
C 253 V 275
I 254 M 276
T 255 R 277
I 256 N 278
G 257 A 279
I 258 L 280
N 259 E 281
I 260 S 282
T 261 C 283
R 262 L 284
T 263 K 285
G 264 G 286
G 265 W 287
T 266 G 288
L 267 V 289
M 268 V 291
L 269 L 292
V 270 V 293
G 271 G 294
M 272 W 295
G 273 D 300
S 274 V 301
Q 275 A 302
M 276 T 303
V 277 R 304
T 278 P 305
V 279 I 306
P 280 Q 307
L 281 L 308
V 282 I 309
N 283 A 310
A 284 G 311
C 285 R 312
A 286 T 313
R 287 W 314
E 288 K 315
I 289 G 316
D 290 S 317
I 291 M 318
K 292 F 319
S 293 G 320
V 294 G 321
F 295 F 322
R 296 K 323
Y 297 G 324
C 298 K 325
N 299 D 326
D 300 G 327
Y 301 V 328
P 302 P 329
I 303 K 330
A 304 M 331
L 305 V 332
E 306 K 333
M 307 A 334
V 308 Y 335
A 309 L 336
S 310 D 337
G 311 K 338
R 312 K 339
C 313 V 340
N 314 K 341
V 315 L 342
K 316 D 343
Q 317 E 344
L 318 F 345
V 319 I 346
T 320 T 347
H 321 H 348
S 322 R 349
F 323 M 350
K 324 P 351
L 325 L 352
E 326 E 353
Q 327 S 354
T 328 V 355
V 329 N 356
D 330 D 357
A 331 A 358
F 332 I 359
E 333 D 360
A 334 L 361
A 335 M 362
R 336 K 363
K 337 H 364
K 338 G 365
A 339 K 366
T 342 C 367
I 343 I 368
K 344 R 369
V 345 T 370
M 346 V 371
I 347 L 372
TER
END

