
PFRMAT AL
TARGET T0112
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1SDG
REMARK DATE	1994-10-26
REMARK SCORE	?
D 4 A 8
N 5 E 9
L 6 N 10
S 7 L 11
A 8 S 12
V 9 L 13
L 10 V 14
Y 11 V 15
K 12 G 17
Q 13 P 18
N 14 G 19
D 15 D 20
L 16 L 21
R 17 R 22
L 18 L 23
E 19 E 24
Q 20 N 25
R 21 Y 26
P 22 P 27
I 23 I 28
P 24 P 29
E 25 E 30
P 26 P 31
K 27 G 32
E 28 P 33
D 29 N 34
E 30 E 35
V 31 V 36
L 32 L 37
L 33 L 38
Q 34 K 39
M 35 M 40
A 36 H 41
Y 37 S 42
V 38 V 43
G 39 G 44
I 40 I 45
C 41 C 46
G 42 G 47
S 43 S 48
D 44 D 49
V 45 V 50
H 46 H 51
Y 47 Y 52
Y 48 W 53
E 49 Q 54
H 50 G 55
G 51 R 56
R 52 I 57
REMARK I 53 G 57
REMARK A 54 D 57
REMARK D 55 F 57
F 56 V 58
I 57 V 59
V 58 K 60
K 59 K 61
D 60 P 62
P 61 M 63
M 62 V 64
V 63 L 65
I 64 G 66
G 65 H 67
H 66 E 68
E 67 A 69
A 68 S 70
S 69 G 71
G 70 T 72
T 71 V 73
V 72 V 74
V 73 K 75
K 74 V 76
V 75 G 77
G 76 S 78
K 77 L 79
N 78 V 80
V 79 R 81
K 80 H 82
H 81 L 83
L 82 Q 84
K 83 P 85
K 84 G 86
G 85 D 87
D 86 R 88
R 87 V 89
V 88 A 90
A 89 I 91
V 90 Q 92
E 91 P 93
P 92 G 94
G 93 A 95
V 94 P 96
P 95 R 97
C 96 Q 98
R 97 T 99
R 98 D 100
C 99 E 101
Q 100 F 102
F 101 C 103
C 102 K 104
K 103 I 105
E 104 G 106
G 105 R 107
K 106 Y 108
Y 107 N 109
N 108 L 110
L 109 S 111
C 110 P 112
P 111 T 113
D 112 I 114
L 113 F 115
T 114 F 116
F 115 C 117
C 116 A 118
A 117 T 139
T 118 P 140
P 119 P 141
P 120 D 142
D 121 D 143
D 122 G 144
G 123 N 145
N 124 L 146
L 125 C 147
A 126 R 148
R 127 F 149
Y 128 Y 150
Y 129 K 151
V 130 H 152
H 131 N 153
A 132 A 154
A 133 N 155
D 134 F 156
F 135 C 157
C 136 Y 158
H 137 K 159
K 138 L 160
L 139 P 161
P 140 D 162
D 141 N 163
N 142 V 164
V 143 T 165
S 144 F 166
L 145 E 167
E 146 E 168
E 147 G 169
G 148 A 170
A 149 L 171
L 150 I 172
L 151 E 174
E 152 P 175
P 153 L 176
L 154 S 177
S 155 V 178
V 156 G 179
G 157 I 180
V 158 H 182
H 159 A 183
A 160 C 184
C 161 R 185
R 162 R 186
R 163 A 187
A 164 G 188
G 165 V 189
V 166 T 190
Q 167 L 191
L 168 G 192
G 169 N 193
T 170 K 194
T 171 V 195
V 172 L 196
L 173 V 197
V 174 C 198
I 175 G 199
G 176 A 200
A 177 G 201
G 178 P 202
P 179 I 203
I 180 G 204
G 181 L 205
L 182 V 206
V 183 N 207
S 184 L 208
V 185 L 209
L 186 A 210
A 187 A 211
A 188 K 212
K 189 A 213
A 190 M 214
Y 191 G 215
G 192 A 216
A 193 Q 218
F 194 V 219
V 195 V 220
V 196 V 221
C 197 T 222
T 198 D 223
A 199 L 224
R 200 S 225
S 201 A 226
P 202 S 227
R 203 R 228
R 204 L 229
L 205 S 230
E 206 K 231
V 207 A 232
A 208 K 233
K 209 E 234
N 210 V 235
C 211 G 236
G 212 A 237
A 213 D 238
D 214 F 239
V 215 I 240
T 216 L 241
L 217 E 242
V 218 I 243
V 219 S 244
D 220 N 245
P 221 E 246
A 222 S 247
K 223 P 248
E 224 E 249
E 225 E 250
E 226 I 251
S 227 A 252
S 228 K 253
I 229 K 254
I 230 V 255
E 231 E 256
R 232 G 257
I 233 L 258
R 234 L 259
S 235 G 260
A 236 S 261
I 237 K 262
G 238 P 263
D 239 E 264
L 240 V 265
P 241 T 266
N 242 I 267
V 243 E 268
T 244 C 269
I 245 T 270
D 246 G 271
C 247 V 272
S 248 E 273
G 249 T 274
N 250 S 275
E 251 I 276
K 252 Q 277
C 253 A 278
I 254 G 279
T 255 I 280
I 256 Y 281
G 257 A 282
I 258 T 283
N 259 H 284
I 260 S 285
T 261 G 286
R 262 G 287
T 263 T 288
G 264 L 289
G 265 V 290
T 266 L 291
L 267 V 292
M 268 G 293
L 269 L 294
V 270 G 295
G 271 S 296
M 272 E 297
G 273 M 298
S 274 T 299
Q 275 S 302
M 276 V 304
V 277 P 305
T 278 L 307
V 279 V 308
P 280 H 309
L 281 A 310
V 282 A 311
N 283 T 313
A 284 R 314
C 285 E 315
A 286 V 316
R 287 D 317
E 288 I 318
I 289 K 319
D 290 G 320
I 291 V 321
K 292 F 322
S 293 R 323
V 294 Y 324
F 295 C 325
R 296 N 326
Y 297 T 327
C 298 W 328
N 299 P 329
D 300 M 330
Y 301 A 331
P 302 I 332
I 303 S 333
A 304 M 334
L 305 L 335
E 306 A 336
M 307 S 337
V 308 K 338
A 309 S 339
S 310 V 340
G 311 N 341
R 312 V 342
C 313 K 343
N 314 P 344
V 315 L 345
K 316 V 346
Q 317 T 347
L 318 H 348
V 319 R 349
T 320 F 350
H 321 P 351
S 322 L 352
F 323 E 353
K 324 K 354
L 325 A 355
E 326 L 356
Q 327 E 357
T 328 A 358
V 329 F 359
D 330 E 360
A 331 T 361
F 332 S 362
E 333 K 363
A 334 K 364
A 335 G 365
R 336 L 366
K 337 G 367
K 338 L 368
A 339 K 369
D 340 V 370
N 341 M 371
T 342 I 372
I 343 K 373
TER
END

