
PFRMAT AL
TARGET T0113
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  5
PARENT 1ae1_B
R 6 W 17
S 7 S 18
V 8 L 19
K 9 K 20
G 10 G 21
L 11 T 22
V 12 T 23
A 13 A 24
V 14 L 25
I 15 V 26
T 16 T 27
G 17 G 28
G 18 G 29
A 19 S 30
S 20 K 31
G 21 G 32
L 22 I 33
G 23 G 34
L 24 Y 35
S 25 A 36
T 26 I 37
A 27 V 38
K 28 E 39
R 29 E 40
L 30 L 41
V 31 A 42
G 32 G 43
Q 33 L 44
G 34 G 45
A 35 A 46
T 36 R 47
A 37 V 48
V 38 Y 49
L 39 T 50
L 40 C 51
D 41 S 52
V 42 R 53
P 43 N 54
N 44 E 55
S 45 K 56
E 46 E 57
G 47 L 58
E 48 D 59
T 49 E 60
E 50 C 61
A 51 L 62
K 52 E 63
K 53 E 67
L 54 K 68
G 55 G 69
G 56 L 70
N 57 N 71
C 58 V 72
I 59 E 73
F 60 G 74
A 61 S 75
P 62 V 76
A 63 C 77
N 64 D 78
V 65 L 79
T 66 L 80
S 67 S 81
E 68 R 82
K 69 T 83
E 70 E 84
V 71 R 85
Q 72 D 86
A 73 K 87
A 74 L 88
L 75 M 89
T 76 Q 90
L 77 T 91
A 78 V 92
K 79 A 93
E 80 H 94
K 81 V 95
F 82 F 96
G 83 G 98
R 84 K 99
I 85 L 100
D 86 N 101
V 87 I 102
A 88 L 103
V 89 V 104
N 90 N 105
C 91 N 106
A 92 A 107
G 93 G 108
I 94 V 109
A 95 V 110
V 96 I 111
E 103 H 112
K 104 K 113
K 105 E 114
N 106 A 115
Q 107 K 116
V 108 D 117
H 109 F 118
T 110 T 119
L 111 E 120
E 112 K 121
D 113 D 122
F 114 Y 123
Q 115 N 124
R 116 I 125
V 117 I 126
I 118 M 127
N 119 G 128
V 120 T 129
N 121 N 130
L 122 F 131
I 123 E 132
G 124 A 133
T 125 A 134
F 126 Y 135
N 127 H 136
V 128 L 137
I 129 S 138
R 130 Q 139
L 131 I 140
V 132 A 141
A 133 Y 142
G 134 P 143
V 135 L 144
M 136 L 145
G 137 K 146
Q 138 A 147
N 139 S 148
E 140 Q 149
P 141 N 150
G 148 G 151
V 149 N 152
I 150 V 153
I 151 I 154
N 152 F 155
T 153 L 156
A 154 S 157
S 155 S 158
V 156 I 159
A 157 A 160
A 158 G 161
F 159 F 162
E 160 S 163
G 161 A 164
Q 162 L 165
V 163 P 166
G 164 S 167
Q 165 V 168
A 166 S 169
A 167 L 170
Y 168 Y 171
S 169 S 172
A 170 A 173
S 171 S 174
K 172 K 175
G 173 G 176
G 174 A 177
I 175 I 178
V 176 N 179
G 177 Q 180
M 178 M 181
T 179 T 182
L 180 K 183
P 181 S 184
I 182 L 185
A 183 A 186
R 184 C 187
D 185 E 188
L 186 W 189
A 187 A 190
P 188 K 191
I 189 D 192
G 190 N 193
I 191 I 194
R 192 R 195
V 193 V 196
V 194 N 197
T 195 S 198
I 196 V 199
A 197 A 200
P 198 P 201
G 199 G 202
L 200 V 203
F 201 I 204
A 202 L 205
T 203 T 206
P 204 P 207
L 205 L 208
L 206 V 209
T 207 E 210
T 208 T 211
L 209 A 212
P 210 N 216
D 211 P 217
K 212 H 218
V 213 Q 219
R 214 K 220
N 215 E 221
F 216 E 222
L 217 I 223
A 218 D 224
S 219 N 225
Q 220 F 226
V 221 I 227
P 222 T 230
F 223 P 231
P 224 M 232
S 225 G 233
R 226 R 234
L 227 A 235
G 228 G 236
D 229 K 237
P 230 P 238
A 231 Q 239
E 232 E 240
Y 233 V 241
A 234 S 242
H 235 A 243
L 236 L 244
V 237 I 245
Q 238 A 246
M 239 F 247
V 240 L 248
I 241 C 249
E 242 A 252
N 243 A 253
P 244 S 254
F 245 Y 255
L 246 I 256
N 247 T 257
G 248 G 258
E 249 Q 259
V 250 I 260
I 251 I 261
R 252 W 262
L 253 A 263
D 254 D 264
G 255 G 265
A 256 G 266
I 257 F 267
R 258 T 268
TER
END

