
PFRMAT AL
TARGET T0113
AUTHOR 4220-7928-8231 
METHOD various , almost identical to automatic seqpmprf 
MODEL  2
PARENT  1bdb
REMARK        bbbbb     hhhhhhhhhhhh  bbbbb    hhhhhhhhhh 
REMARK  RSVKGLVAVITGGASGLGLSTAKRLVGQGATAVLLDVPNSEGETEAKKLG
REMARK     ||    |||||||||     | |  ||    ||             |
REMARK  MKLKGEAVLITGGASGLGRALVDRFVAEGAKVAVLDKSAERLAELETDHG
REMARK       bbbbbbb  hhhhhhhhhhhhhh  bbbbbb hhhhhhhhhhhhh
REMARK    bbbbbb     hhhhhhhhhhhhhh   bbbbb               
REMARK  GNCIFAPANVTSEKEVQAALTLAKEKFGRIDVAVNCAGIAVAIKTYHEKK
REMARK   |       | |      |       || ||     |||           
REMARK  DNVLGIVGDVRSLEDQKQAASRCVARFGKIDTLIPNAGIWDYSTALVDLP
REMARK   bbbbbbb   hhhhhhhhhhhhhhhhh  bbbb          hhhhh 
REMARK       hhhhhhhbbbb    hhhhhhhhhhhhh          bbbbbbb
REMARK  NQVHTLEDFQRVINVNLIGTFNVIRLVAGVMGQNEPDQGGQRGVIINTAS
REMARK          |  |   |  |                      ||  | | |
REMARK  EE.SLDAAFDEVFHINVKGYIHAVKACLPALVAS.......RGNVIFTIS
REMARK     hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh       hbbbbbbbh
REMARK  b            hhhhhhhhhhhhhhhhhhh   bbbbbb         
REMARK  VAAFEGQVGQAAYSASKGGIVGMTLPIARDLAPIGIRVVTIAPGLFATPL
REMARK   | |    |   | | |  |||     |  |||   ||     |     |
REMARK  NAGFYPNGGGPLYTAAKHAIVGLVRELAFELAP.YVRVNGVGSGGINSDL
REMARK  hhhh     hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh    bbbbbbbb      
REMARK        hhhhhhhhh          hhhhhhhhhhhhbbbb     bbbb
REMARK  LTT.LPDKVRNFLASQVPFPSRLGDPAEYAHLVQMVIENPF...LNGEVI
REMARK              | |  |   |     ||                 |   
REMARK  RGPSSLGPLADMLKSVLPI.GRMPEVEEYTGAYVFFATRGDAAPATGALL
REMARK    hhhhhhhhhhhh          hhhhhhhhhhhhhhhhhhh    bbb
REMARK  bb        
REMARK  RLDGAIRMQP
REMARK    ||      
REMARK  NYDGGLGVRG
REMARK  bb  hhhhh 
REMARK  seq 1bdb
REMARK TARGET  FROM-TO   FOLD       FROM-TO  ALIG No.
REMARK TALIGN SEQ 0     6 107  1BDB - 0      0 101  1.0 1
R 6 M 1
S 7 K 2
V 8 L 3
K 9 K 4
G 10 G 5
L 11 E 6
V 12 A 7
A 13 V 8
V 14 L 9
I 15 I 10
T 16 T 11
G 17 G 12
G 18 G 13
A 19 A 14
S 20 S 15
G 21 G 16
L 22 L 17
G 23 G 18
L 24 R 19
S 25 A 20
T 26 L 21
A 27 V 22
K 28 D 23
R 29 R 24
L 30 F 25
V 31 V 26
G 32 A 27
Q 33 E 28
G 34 G 29
A 35 A 30
T 36 K 31
A 37 V 32
V 38 A 33
L 39 V 34
L 40 L 35
D 41 D 36
V 42 K 37
P 43 S 38
N 44 A 39
S 45 E 40
E 46 R 41
G 47 L 42
E 48 A 43
T 49 E 44
E 50 L 45
A 51 E 46
K 52 T 47
K 53 D 48
L 54 H 49
G 55 G 50
G 56 D 51
N 57 N 52
C 58 V 53
I 59 L 54
F 60 G 55
A 61 I 56
P 62 V 57
A 63 G 58
N 64 D 59
V 65 V 60
T 66 R 61
S 67 S 62
E 68 L 63
K 69 E 64
E 70 D 65
V 71 Q 66
Q 72 K 67
A 73 Q 68
A 74 A 69
L 75 A 70
T 76 S 71
L 77 R 72
A 78 C 73
K 79 V 74
E 80 A 75
K 81 R 76
F 82 F 77
G 83 G 78
R 84 K 79
I 85 I 80
D 86 D 81
V 87 T 82
A 88 L 83
V 89 I 84
N 90 P 85
C 91 N 86
A 92 A 87
G 93 G 88
I 94 I 89
A 95 W 90
V 96 D 91
A 97 Y 92
I 98 S 93
K 99 T 94
T 100 A 95
Y 101 L 96
H 102 V 97
E 103 D 98
K 104 L 99
K 105 P 100
N 106 E 101
REMARK TALIGN SEQ 0   109 139  1BDB - 0    102 132  1.0 1
H 109 S 103
T 110 L 104
L 111 D 105
E 112 A 106
D 113 A 107
F 114 F 108
Q 115 D 109
R 116 E 110
V 117 V 111
I 118 F 112
N 119 H 113
V 120 I 114
N 121 N 115
L 122 V 116
I 123 K 117
G 124 G 118
T 125 Y 119
F 126 I 120
N 127 H 121
V 128 A 122
I 129 V 123
R 130 K 124
L 131 A 125
V 132 C 126
A 133 L 127
G 134 P 128
V 135 A 129
M 136 L 130
G 137 V 131
Q 138 A 132
REMARK TALIGN SEQ 0   147 188  1BDB - 0    133 174  1.0 1
R 147 R 134
G 148 G 135
V 149 N 136
I 150 V 137
I 151 I 138
N 152 F 139
T 153 T 140
A 154 I 141
S 155 S 142
V 156 N 143
A 157 A 144
A 158 G 145
F 159 F 146
E 160 Y 147
G 161 P 148
Q 162 N 149
V 163 G 150
G 164 G 151
Q 165 G 152
A 166 P 153
A 167 L 154
Y 168 Y 155
S 169 T 156
A 170 A 157
S 171 A 158
K 172 K 159
G 173 H 160
G 174 A 161
I 175 I 162
V 176 V 163
G 177 G 164
M 178 L 165
T 179 V 166
L 180 R 167
P 181 E 168
I 182 L 169
A 183 A 170
R 184 F 171
D 185 E 172
L 186 L 173
A 187 A 174
REMARK TALIGN SEQ 0   190 208  1BDB - 0    175 193  1.0 1
G 190 Y 176
I 191 V 177
R 192 R 178
V 193 V 179
V 194 N 180
T 195 G 181
I 196 V 182
A 197 G 183
P 198 S 184
G 199 G 185
L 200 G 186
F 201 I 187
A 202 N 188
T 203 S 189
P 204 D 190
L 205 L 191
L 206 R 192
T 207 G 193
REMARK TALIGN SEQ 0   209 223  1BDB - 0    195 209  1.0 1
L 209 S 196
P 210 L 197
D 211 G 198
K 212 P 208
V 213 L 209
R 214 A 210
N 215 D 211
F 216 M 212
L 217 L 213
A 218 K 214
S 219 S 215
Q 220 V 216
V 221 L 217
P 222 P 218
REMARK TALIGN SEQ 0   225 245  1BDB - 0    210 230  1.0 1
S 225 G 220
R 226 R 221
L 227 M 222
G 228 P 223
D 229 E 224
P 230 V 225
A 231 E 226
E 232 E 227
Y 233 Y 228
A 234 T 229
H 235 G 230
L 236 A 231
V 237 Y 232
Q 238 V 233
M 239 F 234
V 240 F 235
I 241 A 236
E 242 T 237
N 243 R 238
P 244 G 239
REMARK TALIGN SEQ 0   246 261  1BDB - 0    234 249  1.0 1
L 246 A 244
N 247 T 245
G 248 G 246
E 249 A 247
V 250 L 248
I 251 L 249
R 252 N 250
L 253 Y 251
D 254 D 252
G 255 G 253
A 256 G 254
I 257 L 255
R 258 G 256
M 259 V 257
Q 260 R 258
TER
END

