
PFRMAT AL
TARGET T0115
AUTHOR 1205-3016-5241
METHOD Using a database which X'ed out sequence regions within coiled-coils,
METHOD transmembrane, and low entropy, SENSER was able to identify a relationship
METHOD between M. jannaschii Homoserine kinase and the CRYSTAL STRUCTURE OF 
METHOD BOTULINUM NEUROTOXIN SEROTYPE A through trailing searching. An alignment
METHOD was automatically generated with HMMer using profiles
METHOD of the target and pdb families.
MODEL 1
PARENT 3btaA
M   1    L 689
R   2    T 690
E   3    V 691
I   4    Q 692
M   5    T 693
K   6    I 694
V   7    D 695
R   8    N 696
V   9    A 697
K  10    L 698
A  11    S 699
P  12    K 700
C  13    R 701
T  14    N 702
S  15    E 703
A  16    K 704
N  17    W 705
L  18    D 706
G  19    E 707
V  20    V 708
G  21    Y 709
F  22    K 710
D  23    Y 711
V  24    I 712
F  25    V 713
G  26    T 714
L  27    N 715
C  28    W 716
L  29    L 717
K  30    A 718
E  31    K 719
P  32    V 720
Y  33    N 721
D  34    T 722
V  35    Q 723
I  36    I 724
E  37    D 725
V  38    L 726
E  39    I 727
A  40    R 728
I  41    K 729
D  42    K 730
D  43    M 731
K  44    K 732
E  45    E 733
I  46    A 734
I  47    L 735
I  48    E 736
E  49    N 737
V  50    Q 738
D  51    A 739
D  52    E 740
K  53    A 741
N  54    T 742
I  55    K 743
P  56    A 744
T  57    I 745
D  58    I 746
P  59    N 747
D  60    Y 748
K  61    Q 749
N  62    Y 750
V  63    N 751
A  64    Q 752
G  65    Y 753
I  66    T 754
V  67    E 755
A  68    E 756
K  69    E 757
K  70    K 758
M  71    N 759
I  72    N 760
D  73    I 761
D  74    N 762
F  75    F 763
N  76    N 764
I  77    I 765
G  78    D 766
K  79    D 767
G  80    L 768
V  81    S 769
K  82    S 770
I  83    K 771
T  84    L 772
I  85    N 773
K  86    E 774
K  87    S 775
G  88    I 776
V  89    N 777
K  90    K 778
A  91    A 779
G  92    M 780
S  93    I 781
G  94    N 782
L  95    I 783
G  96    N 784
S  97    K 785
S  98    F 786
A  99    L 787
A 100    N 788
S 101    Q 789
S 102    C 790
A 103    S 791
G 104    V 792
T 105    S 793
A 106    Y 794
Y 107    L 795
A 108    M 796
I 109    N 797
N 110    S 798
E 111    M 799
L 112    I 800
F 113    P 801
K 114    Y 802
L 115    G 803
N 116    V 804
L 117    K 805
D 118    R 806
K 119    L 807
L 120    E 808
K 121    D 809
L 122    F 810
V 123    D 811
D 124    A 812
Y 125    S 813
A 126    L 814
S 127    K 815
Y 128    D 816
G 129    A 817
E 130    L 818
L 131    L 819
A 132    K 820
S 133    Y 821
S 134    I 822
G 135    Y 823
A 136    D 824
K 137    N 825
H 138    R 826
A 139    G 827
D 140    T 828
N 141    L 829
V 142    I 830
A 143    G 831
P 144    Q 832
A 145    V 833
I 146    D 834
F 147    R 835
G 148    L 836
G 149    K 837
F 150    D 838
T 151    K 839
M 152    V 840
V 153    N 841
T 154    N 842
N 155    T 843
Y 156    L 844
E 157    S 845
P 158    T 846
L 159    D 847
E 160    I 848
V 161    P 849
L 162    F 850
H 163    Q 851
I 164    L 852
P 165    S 853
I 166    K 854
D 167    Y 855
F 168    V 856
K 169    D 857
L 170    N 858
D 171    Q 859
I 172    R 860
L 173    L 861
I 174    L 862
A 175    S 863
I 176    T 864
P 177    F 865
N 178    T 866
I 179    E 867
S 180    Y 868
I 181    I 982
N 182    I 983
T 183    W 984
K 184    T 985
E 185    L 986
A 186    Q 987
R 187    D 988
E 188    T 989
I 189    Q 990
L 190    E 991
P 191    I 992
K 192    K 993
A 193    Q 994
V 194    R 995
G 195    V 996
L 196    V 997
K 197    F 998
D 198    K 999
L 199    Y 1000
V 200    S 1001
N 201    Q 1002
N 202    M 1003
V 203    I 1004
G 204    N 1005
K 205    I 1006
A 206    S 1007
C 207    D 1008
G 208    Y 1009
M 209    I 1010
V 210    N 1011
Y 211    R 1012
A 212    W 1013
L 213    I 1014
Y 214    F 1015
N 215    V 1016
K 216    T 1017
D 217    I 1018
K 218    T 1019
S 219    N 1020
L 220    N 1021
F 221    R 1022
G 222    L 1023
R 223    N 1024
Y 224    N 1025
M 225    S 1026
M 226    K 1027
S 227    I 1028
D 228    Y 1029
K 229    I 1030
V 230    N 1031
I 231    G 1032
E 232    R 1033
P 233    L 1034
V 234    I 1035
R 235    D 1036
G 236    Q 1037
K 237    K 1038
L 238    P 1039
I 239    I 1040
P 240    S 1041
N 241    N 1042
Y 242    L 1043
F 243    G 1044
K 244    N 1045
I 245    I 1046
K 246    H 1047
E 247    A 1048
E 248    S 1049
V 249    N 1050
K 250    N 1051
D 251    I 1052
K 252    M 1053
V 253    F 1054
Y 254    K 1055
G 255    L 1056
I 256    D 1057
T 257    G 1058
I 258    C 1059
S 259    R 1060
G 260    D 1061
S 261    T 1062
G 262    H 1063
P 263    R 1064
S 264    Y 1065
I 265    I 1066
I 266    W 1067
A 267    I 1068
F 268    K 1069
P 269    Y 1070
K 270    F 1071
E 271    N 1072
E 272    L 1073
F 273    F 1074
I 274    D 1075
D 275    K 1076
E 276    E 1077
V 277    L 1078
E 278    N 1079
N 279    E 1080
I 280    K 1081
L 281    E 1082
R 282    I 1083
D 283    K 1084
Y 284    D 1085
Y 285    L 1086
E 286    Y 1087
N 287    D 1088
T 288    N 1089
I 289    Q 1090
R 290    S 1091
T 291    N 1092
E 292    S 1093
V 293    G 1094
G 294    I 1095
K 295    L 1096
G 296    K 1097
V 297    D 1098
E 298    F 1099
V 299    W 1100
V 300    G 1101
TER
END

