
PFRMAT AL
TARGET T0116
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  2
PARENT 2FOK_A
REMARK DATE	1998-06-17
REMARK SCORE	 0.015	35.8	25/185 (13%)
F 273 L 272
S 274 K 273
V 275 V 274
L 276 L 275
D 277 R 276
E 278 R 277
T 279 A 278
R 280 K 279
T 281 T 285
A 282 R 286
P 283 V 287
G 284 P 288
R 285 K 289
R 286 R 290
L 287 V 291
L 288 Y 292
Q 289 W 293
S 290 E 294
W 291 M 295
L 292 L 296
R 293 A 297
H 294 T 298
P 295 N 299
L 296 L 300
L 297 T 301
D 298 D 302
R 299 K 303
G 300 E 304
P 301 Y 305
L 302 V 306
E 303 R 307
A 304 T 308
R 305 R 309
L 306 R 310
D 307 A 311
R 308 L 312
V 309 I 313
G 316 L 314
A 317 E 315
L 318 I 316
R 319 L 317
E 320 I 318
G 321 K 319
V 322 A 320
R 323 G 321
R 324 S 322
L 325 L 323
R 328 K 324
L 329 I 325
A 330 E 326
D 331 Q 327
L 332 I 328
E 333 Q 329
R 334 D 330
L 335 N 331
A 336 L 332
T 337 K 333
R 338 K 334
L 339 L 335
D 348 G 336
L 349 F 337
G 350 D 338
A 351 E 339
L 352 V 340
R 353 I 341
R 354 E 342
S 355 T 343
L 356 I 344
Q 357 E 345
P 360 N 346
E 361 D 347
L 362 I 348
R 363 K 349
A 364 G 350
L 365 L 351
L 366 I 352
G 367 N 353
E 368 T 354
E 369 G 355
V 370 I 356
G 371 F 357
L 372 I 358
P 373 E 359
D 374 I 360
L 375 K 361
S 376 G 362
P 377 R 363
L 378 F 364
K 379 Y 365
E 380 Q 366
E 381 L 367
L 382 K 368
E 383 D 369
A 384 H 370
A 385 I 371
L 386 L 372
V 387 Q 373
E 388 F 374
D 389 V 375
P 390 I 376
P 391 P 377
L 392 N 378
K 393 R 379
V 394 L 385
I 400 V 386
R 401 K 387
E 402 S 388
G 403 E 389
Y 404 L 390
D 405 E 391
P 406 E 392
D 407 K 393
L 408 K 394
D 409 S 395
A 410 E 396
L 411 L 397
R 412 R 398
A 413 H 399
A 414 K 400
H 415 L 401
R 416 K 402
E 417 Y 403
G 418 V 404
V 419 P 405
A 420 H 406
Y 421 E 407
F 422 Y 408
L 423 I 409
E 424 E 410
L 425 L 411
E 426 I 412
E 427 E 413
R 428 I 414
E 429 A 415
R 430 R 416
E 431 N 417
R 432 S 418
T 433 T 419
G 434 Q 420
I 435 D 421
P 436 R 422
T 437 I 423
L 438 L 424
K 439 E 425
V 440 M 426
G 441 K 427
Y 442 F 432
N 443 M 433
A 444 K 434
V 445 V 435
F 446 Y 436
G 447 G 437
Y 448 Y 438
TER
END

