
PFRMAT AL
TARGET T0117
AUTHOR 3695-4509-4492
METHOD bioinbgu prfseq
MODEL  3
PARENT 1uky
REMARK               bbbbbb       hhhhhhhhhhh   bbb       
REMARK  ARKGTKYAEGTQPFTVLIEGNIGSGKTTYLNHFEKYKNDICLLTEPVEKW
REMARK             |       |  | || |      |      |        
REMARK  PAFSPD.....QVSVIFVLGGPGAGKGTQCEKLVKDYSFVHLSAGDLLRA
REMARK               bbbbbb     hhhhhhhhhhhhh  bbbbhhhhhhh
REMARK         hhhhhhhhhh        bbbbbb            bbb    
REMARK  RNVNGVNLLELMYKDPKKWAMPFQSYVTLTMLQSHTAPTNKKLKIMERSI
REMARK               |   |         ||  |               |  
REMARK  EQGRAGSQYGELIKNCIKEGQIVPQEITLALL...............RNA
REMARK  hhhh    hhhhhhhhhhh    hhhhhhhhh               hhh
REMARK        hhhhhh         hhhhhhhhhhhhh       bbbbb   h
REMARK  FSARYCFVENMRRNGSLEQGMYNTLEEWYKFIEESIHVQADLIIYLRTSP
REMARK   |              |  |          |           |       
REMARK  ISDNVKANKHKF....LIDGFPRKMDQAISFERDIVESKF..ILFFDCPE
REMARK  hhhhhhh  bbb    bbbb   hhhhhhhhhhhh    b  bbbbb hh
REMARK  hhhhhhhhhh        h hhhhhhhhhhh   bbbbb       bbbb
REMARK  EVAYERIRQRARSEESCVP.LKYLQELHELHEDWLIHQRRPQS..CKVLV
REMARK      ||   |                                    ||  
REMARK  DIMLERLLERGKTSGRSDDNIESIKKRFNTFKETSMPVIEYFETKSKVVR
REMARK  hhhhhhhhhhhhhh     hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh bbbb
REMARK  b     hhhhhhhhhhhhhhhh
REMARK  LDADLNLENIGTEYQRSESSIF
REMARK     |   |      |       
REMARK  VRCDRSVEDVYKDVQDAIRDSL
REMARK  bbb  hhhhhhhhhhhhhhhhh
REMARK TARGET  FROM-TO   FOLD       FROM-TO  ALIG No.
REMARK TALIGN SEQ 0     8  13  1UKY - 0      0   5  1.0 1
A 8 P 9
R 9 A 10
K 10 F 11
G 11 S 12
T 12 P 13
REMARK TALIGN SEQ 0    19  89  1UKY - 0      6  76  1.0 1
T 18 D 14
Q 19 Q 15
P 20 V 16
F 21 S 17
T 22 V 18
V 23 I 19
L 24 F 20
I 25 V 21
E 26 L 22
G 27 G 23
N 28 G 24
I 29 P 25
G 30 G 26
S 31 A 27
G 32 G 28
K 33 K 29
T 34 G 30
T 35 T 31
Y 36 Q 32
L 37 C 33
N 38 E 34
H 39 K 35
F 40 L 36
E 41 V 37
K 42 K 38
Y 43 D 39
K 44 Y 40
N 45 S 41
D 46 F 42
I 47 V 43
C 48 H 44
L 49 L 45
L 50 S 46
T 51 A 47
E 52 G 48
P 53 D 49
V 54 L 50
E 55 L 51
K 56 R 52
W 57 A 53
R 58 E 54
N 59 Q 55
V 60 G 56
N 61 R 57
G 62 A 58
V 63 G 59
N 64 S 60
L 65 Q 61
L 66 Y 62
E 67 G 63
L 68 E 64
M 69 L 65
Y 70 I 66
K 71 K 67
D 72 N 68
P 73 C 69
K 74 I 70
K 75 K 71
W 76 E 72
A 77 G 73
M 78 Q 74
P 79 I 75
F 80 V 76
Q 81 P 77
S 82 Q 78
Y 83 E 79
V 84 I 80
T 85 T 81
L 86 L 82
T 87 A 83
M 88 L 84
REMARK TALIGN SEQ 0   105 119  1UKY - 0     77  91  1.0 1
E 104 L 85
R 105 R 86
S 106 N 87
I 107 A 88
F 108 I 89
S 109 S 90
A 110 D 91
R 111 N 92
Y 112 V 93
C 113 K 94
F 114 A 95
V 115 N 96
E 116 K 97
N 117 H 98
M 118 K 99
REMARK TALIGN SEQ 0   124 147  1UKY - 0     92 115  1.0 1
S 123 F 100
L 124 L 101
E 125 I 102
Q 126 D 103
G 127 G 104
M 128 F 105
Y 129 P 106
N 130 R 107
T 131 K 108
L 132 M 109
E 133 D 110
E 134 Q 111
W 135 A 112
Y 136 I 113
K 137 S 114
F 138 F 115
I 139 E 116
E 140 R 117
E 141 D 118
S 142 I 119
I 143 V 120
H 144 E 121
V 145 S 122
Q 146 K 123
REMARK TALIGN SEQ 0   150 176  1UKY - 0    116 142  1.0 1
L 149 F 124
I 150 I 125
I 151 L 126
Y 152 F 127
L 153 F 128
R 154 D 129
T 155 C 130
S 156 P 131
P 157 E 132
E 158 D 133
V 159 I 134
A 160 M 135
Y 161 L 136
E 162 E 137
R 163 R 138
I 164 L 139
R 165 L 140
Q 166 E 141
R 167 R 142
A 168 G 143
R 169 K 144
S 170 T 145
E 171 S 146
E 172 G 147
S 173 R 148
C 174 S 149
V 175 D 150
REMARK TALIGN SEQ 0   177 199  1UKY - 0    144 166  1.0 1
P 176 N 152
L 177 I 153
K 178 E 154
Y 179 S 155
L 180 I 156
Q 181 K 157
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L 183 R 159
H 184 F 160
E 185 N 161
L 186 T 162
H 187 F 163
E 188 K 164
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Q 198 F 174
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S 199 K 177
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A 207 C 185
D 208 D 186
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N 213 D 191
I 214 V 192
G 215 Y 193
T 216 K 194
E 217 D 195
Y 218 V 196
Q 219 Q 197
R 220 D 198
S 221 A 199
E 222 I 200
S 223 R 201
S 224 D 202
I 225 S 203
TER
END

