
PFRMAT AL
TARGET T0117
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  1
PARENT 1QHI_B
REMARK DATE	1999-07-08
REMARK SCORE	 2e-30	126	32/205 (15%)
F 21 L 50
T 22 R 51
V 23 V 52
L 24 Y 53
I 25 I 54
E 26 D 55
G 27 G 56
N 28 P 57
I 29 H 58
G 30 G 59
S 31 M 60
G 32 G 61
K 33 K 62
T 34 T 63
T 35 T 64
Y 36 T 65
L 37 T 66
N 38 Q 67
H 39 L 68
F 40 L 69
E 41 V 70
K 42 A 71
Y 43 L 72
D 46 D 77
I 47 I 78
C 48 V 79
L 49 Y 80
L 50 V 81
T 51 P 82
E 52 E 83
P 53 P 84
V 54 M 85
E 55 T 86
K 56 Y 87
W 57 W 88
R 58 R 89
N 59 V 90
V 60 L 91
N 61 G 92
G 62 A 93
V 63 S 94
N 64 E 95
L 65 T 96
L 66 I 97
E 67 A 98
L 68 N 99
M 69 I 100
Y 70 Y 101
K 71 T 102
D 72 T 103
P 73 Q 104
K 74 H 105
K 75 R 106
W 76 L 107
A 77 D 108
M 78 V 120
P 79 M 121
F 80 T 122
Q 81 S 123
S 82 A 124
Y 83 Q 125
V 84 I 126
T 85 T 127
L 86 M 128
T 87 G 129
M 88 M 130
L 89 P 131
Q 90 Y 132
S 91 A 133
H 92 V 134
T 93 T 135
A 94 D 136
P 95 A 137
T 96 V 138
N 97 P 155
K 98 A 156
K 99 L 157
L 100 T 158
K 101 L 159
I 102 I 160
M 103 F 161
E 104 D 162
R 105 R 163
S 106 H 164
I 107 P 165
F 108 I 166
S 109 A 167
A 110 A 168
R 111 L 169
Y 112 L 170
C 113 C 171
F 114 Y 172
V 115 P 173
E 116 A 174
N 117 A 175
M 118 R 176
R 119 Y 177
R 120 L 178
N 121 M 179
G 122 G 180
S 123 S 181
L 124 M 182
E 125 T 183
Q 126 P 184
G 127 Q 185
M 128 A 186
Y 129 V 187
N 130 L 188
T 131 A 189
L 132 F 190
E 133 V 191
E 134 A 192
W 135 L 193
Y 136 I 194
S 142 P 195
I 143 P 196
H 144 T 197
V 145 L 198
Q 146 P 199
A 147 G 200
D 148 T 201
L 149 N 202
I 150 I 203
I 151 V 204
Y 152 L 205
L 153 G 206
R 154 A 207
T 155 L 208
S 156 P 209
P 157 E 210
E 158 D 211
V 159 R 212
A 160 H 213
Y 161 I 214
E 162 D 215
R 163 R 216
I 164 L 217
R 165 A 218
Q 166 K 219
R 167 R 220
A 168 Q 221
R 169 R 222
S 170 P 223
E 171 G 224
E 172 E 225
S 173 R 226
V 175 L 227
P 176 D 228
L 177 L 229
K 178 A 230
Y 179 M 231
L 180 L 232
Q 181 A 233
E 182 A 234
L 183 I 235
H 184 R 236
E 185 R 237
L 186 V 238
H 187 Y 239
E 188 G 240
D 189 L 241
W 190 L 242
L 191 A 243
I 192 N 244
H 193 T 245
Q 194 V 246
R 195 R 247
R 196 Y 248
TER
END

