
PFRMAT AL
TARGET T0119
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1CQX_B
REMARK DATE	2000-07-05
REMARK SCORE	?
V 14 E 69
T 15 D 70
R 16 P 71
F 17 N 72
I 18 S 73
C 19 L 74
I 20 M 75
A 21 A 76
Q 22 V 77
G 23 L 78
E 24 K 79
T 25 N 80
L 26 I 81
S 27 A 82
D 28 N 83
A 29 K 84
A 30 H 85
Y 31 A 86
R 32 S 87
Q 33 L 88
Q 34 G 89
I 35 V 90
N 36 K 91
I 37 P 92
P 38 E 93
M 39 Q 94
D 40 Y 95
C 41 P 96
R 42 I 97
E 43 V 98
G 44 G 99
E 45 E 100
C 46 H 101
G 47 L 102
T 48 L 103
C 49 A 104
R 50 A 105
A 51 I 106
F 52 K 107
C 53 E 108
E 54 V 109
S 55 L 110
G 56 G 111
N 57 N 112
Y 58 A 113
D 59 A 114
M 60 T 115
P 61 D 116
E 62 D 117
D 63 I 118
N 64 I 119
Y 65 S 120
I 66 A 121
E 67 W 122
D 68 A 123
A 69 Q 124
L 70 A 125
T 71 Y 126
P 72 G 127
E 73 N 128
E 74 L 129
A 75 A 130
Q 76 D 131
Q 77 V 132
G 78 L 133
Y 79 M 134
V 80 G 135
L 81 M 136
A 82 E 137
C 83 S 138
Q 84 E 139
C 85 L 140
R 86 Y 141
P 87 E 142
T 88 R 143
S 89 S 144
D 90 A 145
A 91 E 146
V 92 Q 147
F 93 P 148
Q 94 G 149
I 95 G 150
Q 96 W 151
A 97 K 152
S 98 G 153
S 99 W 154
E 100 R 155
V 101 T 156
C 102 F 157
K 103 V 158
T 104 I 159
K 105 R 160
I 106 E 161
H 107 K 162
H 108 R 163
F 109 P 164
E 110 E 165
G 111 S 166
T 112 D 167
L 113 V 168
A 114 I 169
R 115 T 170
V 116 S 171
E 117 F 172
N 118 I 173
L 119 L 174
S 120 E 175
D 121 P 176
S 122 A 177
T 123 D 178
I 124 G 179
T 125 G 180
F 126 P 181
D 127 V 182
I 128 V 183
Q 129 N 184
L 130 F 185
D 131 E 186
D 132 P 187
G 133 G 188
Q 134 Q 189
P 135 Y 190
D 136 T 191
I 137 S 192
H 138 V 193
F 139 A 194
L 140 I 195
A 141 D 196
G 142 G 201
Q 143 L 202
Y 144 Q 203
V 145 Q 204
N 146 I 205
V 147 R 206
T 148 Q 207
L 149 Y 208
P 150 S 209
G 151 L 210
T 152 S 211
T 153 D 212
E 154 M 213
T 155 P 214
R 156 N 215
S 157 G 216
Y 158 R 217
S 159 T 218
F 160 Y 219
S 161 R 220
S 162 I 221
Q 163 S 222
P 164 V 223
G 165 K 224
N 166 R 225
R 167 E 226
L 168 P 232
T 169 P 233
G 170 G 234
F 171 Y 235
V 172 V 236
V 173 S 237
R 174 N 238
N 175 L 239
V 176 L 240
P 177 H 241
Q 178 D 242
G 179 H 243
K 180 V 244
M 181 N 245
S 182 V 246
E 183 G 247
Y 184 D 248
L 185 Q 249
S 186 V 250
V 187 K 251
Q 188 L 252
A 189 A 253
K 190 A 254
A 191 P 255
G 192 Y 256
D 193 G 257
K 194 S 258
M 195 F 259
S 196 H 260
F 197 I 261
T 198 D 262
G 199 D 264
P 200 A 265
F 201 K 266
G 202 T 267
S 203 P 268
F 204 I 269
Y 205 V 270
L 206 L 271
R 207 I 272
D 208 S 273
V 209 G 274
K 210 G 275
R 211 V 276
P 212 G 277
V 213 L 278
L 214 T 279
M 215 P 280
L 216 M 281
A 217 V 282
G 218 S 283
G 219 M 284
T 220 L 285
G 221 K 286
I 222 V 287
A 223 A 288
P 224 L 289
F 225 Q 290
L 226 A 291
S 227 P 292
M 228 P 293
L 229 R 294
Q 230 Q 295
V 231 V 296
L 232 V 297
E 233 F 298
Q 234 V 299
K 235 H 300
G 236 G 301
S 237 A 302
E 238 R 303
H 239 N 304
P 240 S 305
V 241 A 306
R 242 V 307
L 243 H 308
V 244 A 309
F 245 M 310
G 246 R 311
V 247 D 312
T 248 R 313
Q 249 L 314
D 250 R 315
C 251 E 316
D 252 A 317
L 253 A 318
V 254 K 319
A 255 T 320
L 256 Y 321
E 257 E 322
Q 258 N 323
L 259 L 324
D 260 D 325
A 261 L 326
L 262 F 327
Q 263 V 328
Q 264 F 329
K 265 Y 330
L 266 D 331
P 267 Q 332
W 268 P 333
F 269 L 334
E 270 P 335
Y 271 D 342
R 272 Y 343
T 273 D 344
V 274 Y 345
V 275 P 346
A 276 G 347
H 277 L 348
A 278 V 349
E 279 D 350
S 280 V 351
Q 281 K 352
H 282 Q 353
E 283 I 354
R 284 E 355
K 285 K 356
G 286 S 357
Y 287 I 358
V 288 L 359
T 289 L 360
G 290 P 361
H 291 D 362
I 292 A 363
E 293 D 364
Y 294 Y 365
D 295 Y 366
W 296 I 367
L 297 C 368
N 298 G 369
G 299 P 370
G 300 I 371
E 301 P 372
V 302 F 373
D 303 M 374
V 304 R 375
Y 305 M 376
L 306 Q 377
C 307 H 378
G 308 D 379
P 309 A 380
V 310 L 381
P 311 K 382
M 312 N 383
V 313 L 384
E 314 G 385
A 315 I 386
V 316 H 387
R 317 E 388
S 318 A 389
W 319 R 390
L 320 I 391
D 321 H 392
T 322 Y 393
Q 323 E 394
G 324 V 395
I 325 F 396
Q 326 G 397
P 327 P 398
A 328 D 399
TER
END

