
PFRMAT AL
TARGET T0119
AUTHOR 1956-6867-1656
METHOD COMPASS
METHOD  K.Nishikawa and Y.Matsuo:
METHOD  Protein Eng., Vol.6, pp.811-820 (1993)
METHOD  Y.Matsuo and K.Nishikawa:
METHOD  Protein Sci., Vol.3, pp.2055-2063 (1994)
METHOD  Y.Matsuo and K.Nishikawa:
METHOD  Proteins Struct. Funct. Genet., Vol.23, pp.370-375(1995)
METHOD  The structural library for the threading contains 1692 protein
METHOD  chains, which were selected from PDB at July 11, 2000
METHOD  by using the system for PDB-REPRDB: a database of representative
METHOD  protein chains from the PDB at the PAPIA WWW server
METHOD  (http://www.rwcp.or.jp/papia/).
METHOD  All selected protein chains are of < 30 identity with one another.
MODEL  1
PARENT 1CQX_A
M   1    F  43 
S   2    N  44 
N   3    M  45 
H   4    A  46 
Q   5    H  47 
V   6    Q  48 
A   7    E  49 
L   8    Q  50 
Q   9    G  51 
F  10    Q  52 
E  11    Q  53 
D  12    Q  54 
G  13    Q  55 
V  14    A  56 
T  15    L  57 
R  16    A  58 
F  17    R  59 
I  18    A  60 
C  19    V  61 
I  20    Y  62 
A  21    A  63 
Q  22    Y  64 
G  23    A  65 
E  24    E  66 
T  25    N  67 
L  26    I  68 
S  27    E  69 
D  28    D  70 
A  29    P  71 
A  30    N  72 
Y  31    S  73 
R  32    L  74 
Q  33    M  75 
Q  34    A  76 
I  35    V  77 
N  36    L  78 
I  37    K  79 
P  38    N  80 
M  39    I  81 
D  40    A  82 
C  41    N  83 
R  42    K  84 
E  43    H  85 
G  44    A  86 
E  45    S  87 
C  46    L  88 
G  47    G  89 
T  48    V  90 
C  49    K  91 
R  50    P  92 
A  51    E  93 
F  52    Q  94 
C  53    Y  95 
E  54    P  96 
S  55    I  97 
G  56    V  98 
N  57    G  99 
Y  58    E 100 
D  59    H 101 
M  60    L 102 
P  61    L 103 
E  62    A 104 
D  63    A 105 
N  64    I 106 
Y  65    K 107 
I  66    E 108 
E  67    V 109 
D  68    G 111 
A  69    N 112 
L  70    A 113 
T  71    A 114 
P  72    T 115 
E  73    D 116 
E  74    D 117 
A  75    I 118 
Q  76    I 119 
Q  77    S 120 
G  78    A 121 
Y  79    W 122 
V  80    A 123 
L  81    Q 124 
A  82    A 125 
C  83    Y 126 
Q  84    G 127 
C  85    N 128 
R  86    L 129 
P  87    A 130 
T  88    D 131 
S  89    V 132 
D  90    L 133 
A  91    M 134 
V  92    G 135 
F  93    M 136 
Q  94    E 137 
I  95    S 138 
Q  96    E 139 
A  97    L 140 
S  98    Y 141 
S  99    E 142 
E 100    R 143 
V 101    S 144 
C 102    A 145 
K 103    E 146 
T 104    Q 147 
K 105    P 148 
I 106    K 152 
H 107    G 153 
H 108    W 154 
F 109    R 155 
E 110    T 156 
G 111    F 157 
T 112    V 158 
L 113    I 159 
A 114    R 160 
R 115    E 161 
V 116    K 162 
E 117    R 163 
N 118    P 164 
L 119    E 165 
S 120    S 166 
D 121    D 167 
S 122    V 168 
T 123    I 169 
I 124    T 170 
T 125    S 171 
F 126    F 172 
D 127    I 173 
I 128    L 174 
Q 129    E 175 
L 130    P 176 
D 131    A 177 
D 132    D 178 
G 133    G 179 
Q 134    G 180 
P 135    P 181 
D 136    V 182 
I 137    V 183 
H 138    N 184 
F 139    F 185 
L 140    E 186 
A 141    P 187 
G 142    G 188 
Q 143    Q 189 
Y 144    Y 190 
V 145    T 191 
N 146    S 192 
V 147    V 193 
T 148    D 196 
L 149    V 197 
P 150    P 198 
G 151    G 201 
T 152    L 202 
T 153    Q 203 
E 154    Q 204 
T 155    I 205 
R 156    R 206 
S 157    Q 207 
Y 158    Y 208 
S 159    S 209 
F 160    L 210 
S 161    S 211 
S 162    D 212 
Q 163    M 213 
P 164    P 214 
G 165    N 215 
N 166    G 216 
R 167    R 217 
L 168    T 218 
T 169    Y 219 
G 170    R 220 
F 171    I 221 
V 172    S 222 
V 173    V 223 
R 174    K 224 
N 175    R 225 
V 176    E 226 
P 177    G 227 
Q 178    G 228 
G 179    G 229 
K 180    P 230 
M 181    Q 231 
S 182    P 232 
E 183    P 233 
Y 184    G 234 
L 185    Y 235 
S 186    V 236 
V 187    S 237 
Q 188    H 243 
A 189    V 244 
K 190    N 245 
A 191    V 246 
G 192    G 247 
D 193    D 248 
K 194    Q 249 
M 195    V 250 
S 196    K 251 
F 197    L 252 
T 198    A 253 
G 199    A 254 
P 200    P 255 
F 201    Y 256 
G 202    G 257 
S 203    S 258 
F 204    F 259 
Y 205    H 260 
L 206    I 261 
R 207    D 262 
D 208    V 263 
V 209    D 264 
K 210    A 265 
R 211    K 266 
P 212    T 267 
V 213    I 269 
L 214    V 270 
M 215    L 271 
L 216    I 272 
A 217    S 273 
G 218    G 274 
G 219    G 275 
T 220    V 276 
G 221    G 277 
I 222    L 278 
A 223    T 279 
P 224    P 280 
F 225    M 281 
L 226    V 282 
S 227    S 283 
M 228    M 284 
L 229    L 285 
Q 230    K 286 
V 231    V 287 
L 232    A 288 
Q 234    L 289 
K 235    Q 290 
G 236    A 291 
S 237    P 292 
E 238    P 293 
H 239    R 294 
P 240    Q 295 
V 241    V 296 
R 242    V 297 
L 243    F 298 
V 244    V 299 
F 245    H 300 
G 246    G 301 
V 247    A 302 
T 248    R 303 
Q 249    N 304 
D 250    S 305 
C 251    A 306 
D 252    V 307 
L 253    H 308 
V 254    A 309 
A 255    M 310 
L 256    R 311 
E 257    D 312 
Q 258    R 313 
L 259    L 314 
D 260    R 315 
A 261    E 316 
L 262    A 317 
Q 263    A 318 
Q 264    K 319 
K 265    T 320 
L 266    Y 321 
P 267    E 322 
W 268    L 324 
F 269    D 325 
E 270    L 326 
Y 271    F 327 
R 272    V 328 
T 273    F 329 
V 274    Y 330 
V 275    Q 332 
A 276    P 333 
H 277    L 334 
A 278    P 335 
E 279    E 336 
S 280    D 337 
Q 281    V 338 
H 282    Q 339 
E 283    G 340 
R 284    R 341 
K 285    D 342 
G 286    Y 343 
Y 287    D 344 
V 288    Y 345 
T 289    P 346 
G 290    G 347 
H 291    L 348 
I 292    V 349 
E 293    D 350 
Y 294    V 351 
D 295    K 352 
W 296    S 357 
L 297    I 358 
N 298    L 359 
G 299    L 360 
G 300    P 361 
E 301    D 362 
V 302    A 363 
D 303    D 364 
V 304    Y 365 
Y 305    Y 366 
L 306    I 367 
C 307    C 368 
G 308    G 369 
P 309    P 370 
V 310    I 371 
P 311    P 372 
M 312    F 373 
V 313    M 374 
E 314    R 375 
A 315    M 376 
V 316    Q 377 
R 317    H 378 
S 318    D 379 
W 319    A 380 
L 320    L 381 
D 321    K 382 
T 322    N 383 
Q 323    L 384 
G 324    G 385 
I 325    I 386 
Q 326    H 387 
P 327    E 388 
A 328    A 389 
N 329    R 390 
F 330    I 391 
L 331    H 392 
F 332    Y 393 
E 333    E 394 
K 334    V 395 
F 335    F 396 
S 336    G 397 
A 337    P 398 
N 338    D 399 
TER
END


