
PFRMAT AL
TARGET T0119
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  5
PARENT 1fdr
I 106 A 2
H 107 D 3
H 108 W 4
F 109 V 5
E 110 T 6
G 111 G 7
T 112 K 8
L 113 V 9
A 114 T 10
R 115 K 11
V 116 V 12
E 117 Q 13
N 118 N 14
L 119 W 15
S 120 T 16
D 121 D 17
S 122 A 18
T 123 L 19
I 124 F 20
T 125 S 21
F 126 L 22
D 127 T 23
I 128 V 24
Q 129 H 25
Q 134 A 26
P 135 P 27
D 136 V 28
I 137 L 29
H 138 P 30
F 139 F 31
L 140 T 32
A 141 A 33
G 142 G 34
Q 143 Q 35
Y 144 F 36
V 145 T 37
N 146 K 38
V 147 L 39
T 148 E 42
L 149 I 43
REMARK P 150 D 44
REMARK G 151 G 45
REMARK T 152 E 46
T 153 R 47
E 154 V 48
T 155 Q 49
R 156 R 50
S 157 A 51
Y 158 Y 52
S 159 S 53
F 160 Y 54
S 161 V 55
S 162 N 56
Q 163 S 57
P 164 P 58
G 165 D 59
N 166 N 60
R 167 P 61
L 168 D 62
T 169 L 63
G 170 E 64
F 171 F 65
V 172 Y 66
V 173 L 67
R 174 V 68
N 175 T 69
V 176 V 70
P 177 P 71
Q 178 D 72
G 179 G 73
K 180 K 74
M 181 L 75
S 182 S 76
E 183 P 77
Y 184 R 78
L 185 L 79
V 187 A 80
Q 188 A 81
A 189 L 82
K 190 K 83
A 191 P 84
G 192 G 85
D 193 D 86
K 194 E 87
M 195 V 88
S 196 Q 89
F 197 V 90
T 198 V 91
G 199 S 92
P 200 E 93
F 201 A 94
G 202 A 95
S 203 G 96
F 204 F 97
Y 205 F 98
L 206 V 99
R 207 L 100
D 208 D 101
V 209 E 102
K 210 V 103
R 211 E 107
P 212 T 108
V 213 L 109
L 214 W 110
M 215 M 111
L 216 L 112
A 217 A 113
G 218 T 114
G 219 G 115
T 220 T 116
G 221 A 117
I 222 I 118
A 223 G 119
P 224 P 120
F 225 Y 121
L 226 L 122
S 227 S 123
M 228 I 124
L 229 L 125
Q 230 R 126
V 231 L 127
L 232 G 128
E 233 K 129
Q 234 D 130
K 235 L 131
G 236 D 132
S 237 R 133
E 238 F 134
H 239 K 135
P 240 N 136
V 241 L 137
R 242 V 138
L 243 L 139
V 244 V 140
F 245 H 141
G 246 A 142
V 247 A 143
T 248 R 144
Q 249 Y 145
D 250 A 146
C 251 A 147
D 252 D 148
L 253 L 149
V 254 S 150
A 255 Y 151
L 256 L 152
E 257 P 153
Q 258 L 154
L 259 M 155
D 260 Q 156
A 261 E 157
L 262 L 158
Q 263 E 159
Q 264 K 160
K 265 R 161
L 266 Y 162
P 267 E 163
W 268 K 165
F 269 L 166
E 270 R 167
Y 271 I 168
R 272 Q 169
T 273 T 170
V 274 V 171
V 275 V 172
A 276 S 173
H 277 R 174
A 278 E 175
E 279 T 176
S 280 A 177
Q 281 A 178
H 282 G 179
E 283 S 180
R 284 L 181
K 285 T 182
G 286 G 183
Y 287 R 184
V 288 I 185
T 289 P 186
G 290 A 187
H 291 L 188
I 292 I 189
E 293 E 190
Y 294 S 191
D 295 G 192
W 296 E 193
L 297 L 194
N 298 N 203
G 299 K 204
G 300 E 205
E 301 T 206
V 302 S 207
D 303 H 208
V 304 V 209
Y 305 M 210
L 306 L 211
C 307 C 212
G 308 G 213
P 309 N 214
V 310 P 215
P 311 Q 216
M 312 M 217
V 313 V 218
E 314 R 219
A 315 D 220
V 316 T 221
R 317 Q 222
S 318 Q 223
W 319 L 224
L 320 L 225
D 321 K 226
T 322 E 227
Q 323 T 228
G 324 R 229
I 325 Q 230
Q 326 R 238
P 327 P 239
A 328 G 240
N 329 H 241
F 330 M 242
L 331 T 243
F 332 A 244
E 333 E 245
K 334 H 246
F 335 Y 247
TER
END

