
PFRMAT AL
TARGET T0119
AUTHOR 8734-6605-4366
METHOD Main features of the approach:
METHOD 1. Threading in an external energy field of 'the template results
METHOD    in an alignment of a target sequence on the template.
METHOD    The energy of the obtainedstructure is evaluated using
METHOD    phenomelogical potentials applied to Ca and Cb atoms.
METHOD 2. Averaging over homologs is used in energy calculations.
METHOD 3. "Fragmentation" gapless threading is used for the final
METHOD    selection of predictions
MODEL  2
PARENT 1cqx_A
N   3    T    3
H   4    Q    4
Q   5    K    5
Q   9    D    8
G  13    K   11
F  17    A   14
I  18    P   15
C  19    V   16
I  20    L   17
A  21    A   18
Q  22    E   19
G  23    H   20
E  24    G   21
T  25    Y   22
L  26    D   23
S  27    I   24
D  28    I   25
A  29    K   26
A  30    C   27
Y  31    F   28
R  32    Y   29
Q  33    Q   30
Q  34    R   31
I  35    M   32
R  42    A   35
E  43    H   36
G  44    P   37
E  45    E   38
C  46    L   39
G  47    K   40
T  48    N   41
C  49    V   42
R  50    F   43
A  51    N   44
F  52    M   45
C  53    A   46
E  54    H   47
S  55    Q   48
G  56    E   49
N  57    Q   50
P  61    Q   53
Y  65    A   56
A  69    R   59
E  73    Y   62
E  74    A   63
A  75    Y   64
Q  76    A   65
Q  77    E   66
G  78    N   67
Y  79    I   68
V  80    E   69
L  81    D   70
A  82    P   71
R  86    V   77
P  87    L   78
T  88    K   79
S  89    N   80
F  93    A   86
Q  94    S   87
I  95    L   88
Q  96    G   89
A  97    V   90
S  98    K   91
S  99    P   92
E 100    E   93
V 101    Q   94
C 102    Y   95
K 103    P   96
T 104    I   97
K 105    V   98
F 109    A  104
E 110    A  105
G 111    I  106
T 112    K  107
L 113    E  108
A 114    V  109
R 115    L  110
V 116    G  111
E 117    N  112
N 118    A  113
L 119    A  114
S 120    T  115
D 121    D  116
S 122    D  117
T 123    I  118
I 124    I  119
T 125    S  120
F 126    A  121
D 127    W  122
I 128    A  123
Q 129    Q  124
L 130    A  125
Q 134    D  131
F 139    E  137
L 140    S  138
A 141    E  139
G 142    L  140
Q 143    Y  141
Y 144    E  142
V 145    R  143
N 146    S  144
V 147    A  145
T 148    E  146
L 149    Q  147
P 150    P  148
G 151    G  149
T 152    G  150
T 153    W  151
E 154    K  152
T 155    G  153
R 156    W  154
S 157    R  155
Q 163    V  197
P 164    P  198
G 165    A  199
N 166    L  200
R 167    G  201
L 168    L  202
T 169    Q  203
G 170    Q  204
F 171    I  205
V 172    R  206
V 173    Q  207
R 174    Y  208
N 175    S  209
V 176    L  210
P 177    S  211
Q 178    D  212
G 179    M  213
K 180    P  214
M 181    N  215
S 182    G  216
E 183    R  217
Y 184    T  218
A 189    N  245
K 190    V  246
A 191    G  247
G 192    D  248
D 193    Q  249
K 194    V  250
M 195    K  251
S 196    L  252
F 197    A  253
T 198    A  254
G 199    P  255
P 200    Y  256
F 201    G  257
G 202    S  258
S 203    F  259
F 204    H  260
Y 205    I  261
L 206    D  262
R 207    V  263
D 208    D  264
V 209    A  265
K 210    K  266
R 211    T  267
P 212    P  268
V 213    I  269
L 214    V  270
M 215    L  271
L 216    I  272
A 217    S  273
G 218    G  274
G 219    G  275
T 220    V  276
G 221    G  277
I 222    L  278
A 223    T  279
P 224    P  280
F 225    M  281
L 226    V  282
S 227    S  283
M 228    M  284
L 229    L  285
Q 230    K  286
V 231    V  287
L 232    A  288
E 233    L  289
Q 234    Q  290
K 235    A  291
G 236    P  292
S 237    P  293
E 238    R  294
H 239    Q  295
P 240    V  296
V 241    V  297
R 242    F  298
L 243    V  299
V 244    H  300
F 245    G  301
G 246    A  302
V 247    R  303
T 248    N  304
Q 249    S  305
D 250    A  306
C 251    V  307
D 252    H  308
L 256    R  311
E 257    D  312
Q 258    R  313
L 259    L  314
D 260    R  315
A 261    E  316
L 262    A  317
Q 263    A  318
Q 264    K  319
K 265    T  320
L 266    Y  321
P 267    E  322
W 268    N  323
F 269    L  324
E 270    D  325
Y 271    L  326
R 272    F  327
T 273    V  328
V 274    F  329
V 275    Y  330
A 276    D  331
H 277    Q  332
A 278    P  333
E 279    L  334
S 280    P  335
R 284    R  341
K 285    D  342
G 286    Y  343
Y 287    D  344
H 291    Q  353
I 292    I  354
E 293    E  355
Y 294    K  356
N 298    L  359
G 299    L  360
G 300    P  361
E 301    D  362
V 302    A  363
D 303    D  364
V 304    Y  365
Y 305    Y  366
L 306    I  367
C 307    C  368
G 308    G  369
P 309    P  370
V 310    I  371
P 311    P  372
M 312    F  373
V 313    M  374
E 314    R  375
A 315    M  376
V 316    Q  377
R 317    H  378
S 318    D  379
W 319    A  380
L 320    L  381
D 321    K  382
T 322    N  383
Q 323    L  384
G 324    G  385
I 325    I  386
Q 326    H  387
P 327    E  388
A 328    A  389
N 329    R  390
F 330    I  391
L 331    H  392
F 332    Y  393
E 333    E  394
K 334    V  395
F 335    F  396
S 336    G  397
A 337    P  398
N 338    D  399
TER
END


