
PFRMAT AL
TARGET T0120
AUTHOR 8971-8833-9593
METHOD FFAS (http://bioinformatics.burnham-inst.org/FFAS/)
METHOD Fold & Function Assignment System A profile-profile alignment method.
METHOD 1) PSI-Blast is used to collect homologs
METHOD 2) The sequences of homologs are translated into a profile
METHOD    [The translation is not based on PSI-Blast approach]
METHOD 3) Translated profile is aligned against a profile database
MODEL  1
PARENT 1CII
REMARK DATE	1998-01-14
REMARK SCORE	?
E 49 R 120
S 50 A 121
E 51 G 122
I 52 N 123
S 53 A 124
Q 54 D 125
E 55 A 126
A 56 A 127
D 57 D 128
D 58 I 129
M 59 T 130
A 60 R 131
M 61 Q 132
E 62 E 133
K 63 F 134
G 64 R 135
K 65 L 136
Y 66 L 137
V 67 Q 138
G 68 A 139
E 69 E 140
L 70 L 141
R 71 R 142
K 72 E 143
A 73 Y 144
L 74 G 145
L 75 F 146
S 76 R 147
G 77 T 148
A 78 E 149
G 79 I 150
P 80 A 151
A 81 G 152
D 82 Y 153
V 83 D 154
Y 84 A 155
T 85 L 156
F 86 R 157
N 87 L 158
F 88 H 159
S 89 T 160
K 90 E 161
E 91 S 162
S 92 R 163
C 93 M 164
Y 94 L 165
F 95 F 166
F 96 A 167
F 97 D 168
E 98 A 169
K 99 D 170
N 100 S 171
L 101 L 172
K 102 R 173
D 103 I 174
V 104 S 175
S 105 P 176
F 106 R 177
R 107 E 178
L 108 A 179
G 109 R 180
S 110 I 183
F 111 E 184
N 112 Q 185
L 113 A 186
E 114 E 187
K 115 K 188
V 116 R 189
E 117 Q 190
N 118 K 191
P 119 D 192
A 120 A 193
E 121 Q 194
V 122 N 195
I 123 A 196
R 124 D 197
E 125 K 198
L 126 K 199
I 127 A 200
C 128 A 201
Y 129 D 202
C 130 M 203
L 131 L 204
D 132 A 205
T 133 E 206
I 134 Y 207
A 135 E 208
E 136 R 209
N 137 R 210
Q 138 K 211
A 139 G 212
K 140 I 213
N 141 L 214
E 142 D 215
H 143 T 216
L 144 R 217
Q 145 L 218
K 146 S 219
E 147 E 220
N 148 L 221
E 149 E 222
R 150 K 223
L 151 N 224
L 152 G 225
R 153 G 226
D 154 A 227
W 155 A 228
N 156 L 229
D 157 A 230
V 158 V 231
Q 159 L 232
G 160 D 233
R 161 A 234
F 162 Q 235
E 163 Q 236
K 164 A 237
C 165 R 238
V 166 L 239
S 167 L 240
A 168 G 241
K 169 Q 242
E 170 Q 243
A 171 T 244
L 172 R 245
E 173 N 246
T 174 D 247
D 175 R 248
L 176 A 249
Y 177 I 250
K 178 R 254
R 179 N 255
F 180 K 256
I 181 L 257
L 182 S 258
V 183 S 259
L 184 V 260
N 185 T 261
E 186 E 262
K 187 S 263
K 188 L 264
T 189 N 265
K 190 T 266
I 191 A 267
R 192 R 268
S 193 N 269
L 194 A 270
H 195 L 271
N 196 T 272
K 197 R 273
L 198 A 274
L 199 E 275
N 200 Q 276
A 201 Q 277
A 202 L 278
Q 203 T 279
E 204 Q 280
R 205 Q 281
E 206 K 282
K 207 N 283
D 208 T 284
I 209 P 285
K 210 D 286
Q 211 K 288
E 212 T 289
G 213 I 290
E 214 V 291
T 215 S 292
A 216 P 293
I 217 E 294
C 218 K 295
S 219 F 296
E 220 P 297
M 221 G 298
T 222 R 299
A 223 S 300
D 224 S 301
R 225 T 302
D 226 N 303
P 227 D 304
V 228 S 305
Y 229 I 306
D 230 V 307
E 231 V 308
S 232 S 309
T 233 G 310
D 234 D 311
E 235 P 312
E 236 R 313
S 237 F 314
E 238 A 315
N 239 G 316
Q 240 T 317
T 241 I 318
D 242 K 319
L 243 I 320
S 244 T 321
G 245 T 322
L 246 S 323
A 247 A 324
S 248 V 325
A 249 I 326
A 250 D 327
V 251 N 328
S 252 R 329
K 253 A 330
D 254 N 331
D 255 L 332
S 256 N 333
I 257 Y 334
I 258 L 335
S 259 L 336
S 260 S 337
L 261 H 338
D 262 S 339
V 263 G 340
T 264 L 341
D 265 D 342
I 266 Y 343
A 267 K 344
P 268 R 345
S 269 N 346
R 270 I 347
K 271 L 348
R 272 N 349
R 273 D 350
Q 274 R 351
R 275 N 352
M 276 P 353
Q 277 V 354
R 278 V 355
N 279 T 356
L 280 E 357
G 281 D 358
T 282 V 359
E 283 E 360
P 284 G 361
K 285 D 362
M 286 K 363
A 287 K 364
P 288 I 365
Q 289 Y 366
E 290 N 367
N 291 A 368
Q 292 E 369
L 293 V 370
Q 294 A 371
E 295 E 372
K 296 W 373
E 297 D 374
N 298 K 375
S 299 L 376
R 300 R 377
P 301 Q 378
D 302 R 379
S 303 A 383
S 304 R 384
L 305 N 385
P 306 K 386
E 307 I 387
T 308 T 388
S 309 S 389
K 310 A 390
K 311 E 391
E 312 S 392
H 313 A 393
I 314 V 394
S 315 N 395
A 316 S 396
E 317 A 397
N 318 R 398
M 319 N 399
S 320 N 400
L 321 L 401
E 322 S 402
T 323 A 403
L 324 R 404
R 325 T 405
N 326 N 406
S 327 E 407
S 328 Q 408
P 329 K 409
E 330 H 410
TER
END

