
PFRMAT AL
TARGET T0121
AUTHOR 9751-8684-2764
REMARK The C terminal domain had a really low alignment score in blast.
METHOD The target sequence was blasted against all proteins in the PDB, 
METHOD and the top scoring PDB chain was used as a template in the alignment.
MODEL  1
PARENT 1B0U_A
A     2 N     5
G     3 K     6
V     4 L     7
R     5 H     8
L     6 V     9
V     7 I    10
D     8 D    11
V     9 L    12
W    10 H    13
K    11 K    14
V    12 R    15
F    13 Y    16
G    14 G    17
E    15 G    18
V    16 H    19
T    17 E    20
A    18 V    21
V    19 L    22
R    20 K    23
E    21 G    24
L    22 V    25
S    23 S    26
L    24 L    27
E    25 Q    28
V    26 A    29
K    27 R    30
D    28 A    31
G    29 G    32
E    30 D    33
F    31 V    34
M    32 I    35
I    33 S    36
L    34 I    37
L    35 I    38
G    36 G    39
P    37 S    40
S    38 S    41
G    39 G    42
C    40 S    43
G    41 G    44
K    42 K    45
T    43 S    46
T    44 T    47
T    45 F    48
L    46 L    49
R    47 R    50
M    48 C    51
I    49 I    52
A    50 N    53
G    51 F    54
L    52 L    55
E    53 E    56
E    54 K    57
P    55 P    58
S    56 S    59
R    57 E    60
G    58 G    61
Q    59 A    62
I    60 I    63
Y    61 I    64
I    62 V    65
G    63 N    66
D    64 G    67
R    65 G    78
L    66 Q    79
V    67 L    80
A    68 K    81
D    69 V    82
P    70 A    83
E    71 D    84
F    75 K    85
V    76 N    86
P    77 Q    87
P    78 L    88
K    79 R    89
D    80 L    90
R    81 L    91
D    82 R    92
I    83 L    95
A    84 T    96
M    85 M    97
V    86 V    98
F    87 F    99
Q    88 Q   100
S    89 H   101
Y    90 F   102
A    91 N   103
L    92 L   104
Y    93 W   105
P    94 S   106
H    95 H   107
M    96 M   108
T    97 T   109
V    98 V   110
Y    99 L   111
D   100 E   112
N   101 N   113
I   102 V   114
A   103 M   115
F   104 E   116
P   105 A   117
L   106 P   118
K   107 I   119
L   108 Q   120
R   109 V   121
K   110 L   122
V   111 G   123
P   112 L   124
Q   114 S   125
E   115 K   126
I   116 H   127
D   117 D   128
Q   118 A   129
R   119 R   130
V   120 E   131
R   121 R   132
E   122 K   135
V   123 Y   136
A   124 L   137
E   125 A   138
L   126 K   139
L   127 V   140
G   128 G   141
L   129 I   142
T   130 D   143
E   131 R   145
L   132 A   146
L   133 Q   147
N   134 G   148
R   135 K   149
K   136 Y   150
P   137 P   151
R   138 V   152
E   139 H   153
L   140 L   154
S   141 S   155
G   142 G   156
G   143 G   157
Q   144 Q   158
R   145 Q   159
Q   146 Q   160
R   147 R   161
V   148 V   162
A   149 S   163
L   150 I   164
G   151 A   165
R   152 R   166
A   153 A   167
I   154 L   168
V   155 A   169
R   156 M   170
K   157 E   171
P   158 P   172
Q   159 D   173
V   160 V   174
F   161 L   175
L   162 L   176
M   163 F   177
D   164 D   178
E   165 E   179
P   166 P   180
L   167 T   181
S   168 S   182
N   169 A   183
L   170 L   184
D   171 D   185
A   172 P   186
K   173 E   187
L   174 L   188
R   175 V   189
V   176 G   190
R   177 E   191
M   178 V   192
R   179 L   193
A   180 R   194
E   181 I   195
L   182 M   196
K   183 Q   197
K   184 Q   198
L   185 L   199
Q   186 A   200
R   187 E   201
Q   188 E   202
G   190 G   203
V   191 K   204
T   192 T   205
T   193 M   206
I   194 V   207
Y   195 V   208
V   196 V   209
T   197 T   210
H   198 H   211
D   199 E   212
Q   200 M   213
V   201 G   214
E   202 F   215
A   203 A   216
M   204 R   217
T   205 H   218
M   206 V   219
G   207 S   220
D   208 S   221
R   209 H   222
I   210 V   223
A   211 I   224
V   212 F   225
M   213 L   226
N   214 H   227
R   215 Q   228
G   216 G   229
TER
PARENT 1DOO_E
E   277 E    88
L   278 V    89
G   279 G    90
Y   280 Y    91
V   281 V    92
G   282 G    93
R   283 K    94
E   284 E    95
V   285 V    96
I   286 D    97
F   287 S    98
G   288 I    99
I   289 I   100
R   290 R   101
D   293 D   102
L   294 L   103
Y   295 T   104
D   296 D   105
A   297 A   106
M   298 A   107
F   299 V   108
A   300 K   109
R   301 M   110
V   302 V   111
R   303 R   112
V   304 V   113
P   305 Q   114
G   306 A   115
E   307 I   116
N   308 E   117
L   309 K   118
V   310 N   119
R   311 R   120
A   312 Y   121
V   313 R   122
V   314 A   123
E   318 E   124
N   319 E   125
L   320 L   126
G   321 A   127
S   322 E   128
E   323 E   129
R   324 R   130
I   325 I   131
V   326 L   132
H   327 D   133
L   328 V   134
R   329 L   135
V   330 I   136
G   331 P   137
TER
END


