
PFRMAT AL
TARGET T0122
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  1
PARENT 2TYS_A
REMARK DATE	1997-04-02
REMARK SCORE	 2e-75	276	82/248 (33%)
K 3 R 15
D 4 E 16
G 5 G 17
S 6 A 18
L 7 F 19
I 8 V 20
P 9 P 21
Y 10 F 22
L 11 V 23
T 12 T 24
A 13 L 25
G 14 G 26
D 15 D 27
P 16 P 28
D 17 G 29
K 18 I 30
Q 19 E 31
S 20 Q 32
T 21 S 33
L 22 L 34
N 23 K 35
F 24 I 36
L 25 I 37
L 26 D 38
A 27 T 39
L 28 L 40
D 29 D 42
E 30 A 43
Y 31 G 44
A 32 A 45
G 33 D 46
A 34 A 47
I 35 L 48
E 36 E 49
L 37 L 50
G 38 G 51
I 39 V 52
P 40 P 53
F 41 F 54
S 42 S 55
D 43 D 56
P 44 P 57
I 45 L 58
A 46 A 59
D 47 D 60
G 48 G 61
K 49 P 62
T 50 T 63
I 51 I 64
Q 52 Q 65
E 53 N 66
S 54 A 67
H 55 N 68
Y 56 L 69
R 57 R 70
A 58 A 71
L 59 F 72
K 60 A 73
N 61 A 74
G 62 G 75
F 63 V 76
K 64 T 77
L 65 P 78
R 66 A 79
E 67 Q 80
A 68 C 81
F 69 F 82
W 70 E 83
I 71 M 84
V 72 L 85
K 73 A 86
E 74 L 87
F 75 I 88
R 76 R 89
R 77 K 91
H 78 H 92
S 79 P 93
S 80 T 94
T 81 I 95
P 82 P 96
I 83 I 97
V 84 G 98
L 85 L 99
M 86 L 100
T 87 M 101
Y 88 Y 102
Y 89 A 103
N 90 N 104
P 91 L 105
I 92 V 106
Y 93 F 107
R 94 N 108
A 95 N 109
G 96 G 110
V 97 I 111
R 98 D 112
N 99 A 113
F 100 F 114
L 101 Y 115
A 102 A 116
E 103 R 117
A 104 C 118
K 105 E 119
A 106 Q 120
S 107 V 121
G 108 G 122
V 109 V 123
D 110 D 124
G 111 S 125
I 112 V 126
L 113 L 127
V 114 V 128
V 115 A 129
D 116 D 130
L 117 V 131
P 118 P 132
V 119 V 133
F 120 E 134
H 121 E 135
A 122 S 136
K 123 A 137
E 124 P 138
F 125 F 139
T 126 R 140
E 127 Q 141
I 128 A 142
A 129 A 143
R 130 L 144
E 131 R 145
E 132 H 146
G 133 N 147
I 134 I 148
K 135 A 149
T 136 P 150
V 137 I 151
F 138 F 152
L 139 I 153
A 140 C 154
A 141 P 155
P 142 P 156
N 143 N 157
T 144 A 158
P 145 D 159
D 146 D 160
E 147 D 161
R 148 L 162
L 149 L 163
K 150 R 164
V 151 Q 165
I 152 V 166
D 153 A 167
D 154 S 168
M 155 Y 169
T 156 G 170
T 157 R 171
G 158 G 172
F 159 Y 173
V 160 T 174
Y 161 Y 175
L 162 L 176
V 163 L 177
S 164 S 178
T 178 P 192
A 179 L 193
Y 180 H 194
D 181 H 195
L 182 L 196
L 183 I 197
R 184 E 198
R 185 K 199
A 186 L 200
K 187 K 201
R 188 E 202
I 189 Y 203
C 190 H 204
R 191 A 205
N 192 A 206
K 193 P 207
V 194 A 208
A 195 L 209
V 196 Q 210
G 197 G 211
F 198 F 212
G 199 G 213
V 200 I 214
S 201 S 215
K 202 S 216
R 203 P 217
E 204 E 218
H 205 Q 219
V 206 V 220
V 207 S 221
S 208 A 222
L 209 A 223
L 210 V 224
K 211 R 225
E 212 A 226
G 213 G 227
A 214 A 228
N 215 A 229
G 216 G 230
V 217 A 231
V 218 I 232
V 219 S 233
G 220 G 234
S 221 S 235
A 222 A 236
L 223 I 237
V 224 V 238
K 225 K 239
I 226 I 240
I 227 I 241
G 228 E 242
E 229 K 243
K 230 N 244
G 231 L 245
R 232 A 246
E 233 S 247
A 234 P 248
T 235 K 249
E 236 Q 250
F 237 M 251
L 238 L 252
K 239 A 253
K 240 E 254
K 241 L 255
V 242 R 256
E 243 S 257
E 244 F 258
L 245 V 259
L 246 S 260
G 247 A 261
I 248 M 262
TER
END

