
PFRMAT AL
TARGET T0122
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  5
PARENT 1THF_D
REMARK DATE	2000-07-14
REMARK SCORE	 1e-19	91.1	43/241 (17%)
L 26 E 24
A 27 N 25
L 28 L 26
D 29 R 27
E 30 D 28
Y 31 S 29
A 32 G 30
G 33 D 31
A 34 P 32
I 35 V 33
E 36 E 34
L 37 L 35
G 38 G 36
I 39 K 37
P 40 F 38
F 41 Y 39
S 42 S 40
D 43 E 41
P 44 I 42
I 45 G 43
A 46 I 44
D 47 D 45
G 48 E 46
K 49 L 47
T 50 V 48
I 51 I 52
Q 52 T 53
E 53 A 54
S 54 S 55
H 55 V 56
Y 56 E 57
R 57 K 58
A 58 R 59
R 66 K 60
E 67 T 61
A 68 M 62
F 69 L 63
W 70 E 64
I 71 L 65
V 72 V 66
K 73 E 67
E 74 K 68
F 75 V 69
R 76 A 70
R 77 E 71
H 78 Q 72
S 79 I 73
S 80 D 74
T 81 I 75
P 82 P 76
I 83 F 77
V 84 T 78
L 85 V 79
M 86 G 80
T 87 G 81
G 96 G 82
V 97 I 83
R 98 H 84
N 99 D 85
F 100 F 86
L 101 A 89
A 102 S 90
E 103 E 91
A 104 L 92
K 105 I 93
A 106 L 94
S 107 R 95
G 108 G 96
V 109 A 97
D 110 D 98
G 111 K 99
I 112 V 100
L 113 S 101
V 114 I 102
V 115 N 103
D 116 T 104
L 117 A 105
P 118 A 106
V 119 V 107
F 120 E 108
H 121 N 109
A 122 P 110
K 123 S 111
E 124 L 112
F 125 I 113
T 126 T 114
E 127 Q 115
I 128 I 116
A 129 A 117
R 130 Q 118
E 131 T 119
E 132 F 120
G 133 G 121
I 134 S 122
K 135 Q 123
T 136 A 124
V 137 V 125
F 138 V 126
L 139 V 127
A 140 A 128
A 141 I 129
P 142 K 147
N 143 N 148
T 144 T 149
P 145 G 150
D 146 I 151
E 147 D 155
R 148 W 156
L 149 V 157
K 150 V 158
V 151 E 159
I 152 V 160
D 153 E 161
D 154 K 162
M 155 R 163
T 156 G 164
T 157 A 165
G 158 G 166
F 159 E 167
V 160 I 168
Y 161 L 169
L 162 L 170
V 163 T 171
S 164 S 172
L 165 I 173
Y 166 D 174
G 167 R 175
T 169 D 176
G 170 G 177
A 171 T 178
R 172 K 179
E 173 S 180
E 174 G 181
I 175 Y 182
P 176 D 183
K 177 T 184
D 181 E 185
L 182 M 186
L 183 I 187
R 184 R 188
R 185 F 189
A 186 V 190
K 187 R 191
R 188 P 192
I 189 L 193
C 190 T 194
R 191 T 195
N 192 L 196
K 193 P 197
V 194 I 198
A 195 I 199
V 196 A 200
G 197 S 201
F 198 G 202
G 199 G 203
V 200 A 204
S 201 G 205
K 202 K 206
R 203 M 207
E 204 E 208
H 205 H 209
V 206 F 210
V 207 L 211
S 208 E 212
L 209 A 213
L 210 F 214
K 211 L 215
E 212 A 216
G 213 G 217
A 214 A 218
N 215 D 219
G 216 A 220
V 217 A 221
V 218 L 222
V 219 A 223
G 220 A 224
S 221 S 225
A 222 V 226
L 223 F 227
V 224 F 229
K 225 R 230
I 226 E 231
I 227 I 232
K 230 D 233
G 231 V 234
R 232 R 235
E 233 E 236
A 234 L 237
T 235 K 238
E 236 E 239
F 237 Y 240
L 238 L 241
K 239 K 242
K 240 K 243
TER
END

