
PFRMAT AL
TARGET T0127
AUTHOR 3995-5176-6362
METHOD Chandonia & Cohen, mostly unpublished.
METHOD Uses a combination of PSI-BLAST scoring matrix
METHOD and Pred2ary secondary structure prediction.
METHOD Pred2ary page is http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/pred2ary/
METHOD The potential is documented in the paper by
METHOD Schwartz et al which is referenced on
METHOD my research page: http://www.cmpharm.ucsf.edu/~jmc/research.html
MODEL 1
PARENT 1qrq_A
M 1 L 36
T 2 E 67
T 3 M 68
A 4 A 69
V 5 E 70
A 6 H 71
R 7 L 72
L 8 M 73
Q 9 T 74
P 10 L 75
S 11 A 76
A 12 Y 77
S 13 D 78
G 14 N 79
A 15 G 80
K 16 I 81
T 17 N 82
R 18 L 83
F 21 F 84
P 22 D 85
F 23 T 86
S 24 A 87
A 25 E 88
I 26 V 89
V 27 Y 90
G 28 G 93
Q 29 K 94
E 30 A 95
D 31 E 96
M 32 V 97
K 33 V 98
L 34 L 99
A 35 G 100
L 36 N 101
L 37 I 102
L 38 I 103
T 39 K 104
A 40 K 105
V 41 K 106
D 42 G 107
P 43 W 108
G 44 R 109
I 45 R 110
G 46 S 111
G 47 S 112
V 48 L 113
L 49 V 114
V 50 I 115
F 51 T 116
G 52 G 123
D 53 E 128
R 54 R 129
G 55 G 130
T 56 L 131
G 57 S 132
K 58 R 133
S 59 K 134
T 60 H 135
A 61 I 136
V 62 I 137
R 63 E 138
A 64 G 139
L 65 L 140
A 66 K 141
A 67 A 142
L 68 S 143
L 69 L 144
P 70 E 145
E 71 R 146
I 72 L 147
E 73 Q 148
A 74 L 149
L 95 E 150
S 96 Y 151
T 97 V 152
N 98 D 153
V 99 V 154
I 100 V 155
R 101 F 156
K 102 A 157
P 103 N 158
T 104 R 159
P 105 P 160
V 106 D 161
V 107 P 162
D 108 N 163
L 109 T 164
P 110 P 165
L 111 M 166
D 158 E 167
H 159 E 168
I 160 T 169
V 161 V 170
D 162 R 171
L 163 A 172
L 164 M 173
L 165 T 174
D 166 H 175
V 167 V 176
A 168 I 177
Q 169 N 178
S 170 Q 179
G 171 G 180
E 172 M 181
N 173 A 182
V 174 M 183
V 175 Y 184
E 176 W 185
G 192 G 186
S 193 T 187
G 194 S 188
N 195 R 189
P 196 W 190
E 197 S 191
E 198 S 192
G 199 M 193
D 200 E 194
L 201 I 195
R 202 M 196
P 203 E 197
Q 204 A 198
L 205 V 201
L 206 A 202
D 207 R 203
R 208 Q 204
F 209 F 205
G 210 N 206
L 211 L 207
S 212 I 208
V 213 P 209
E 214 P 210
V 215 I 211
L 216 C 212
S 217 E 213
P 218 Q 214
R 219 A 215
D 220 E 216
V 221 Y 217
E 222 H 218
T 223 M 219
R 224 R 222
V 225 E 223
E 226 K 224
V 227 V 225
I 228 E 226
R 229 V 227
R 230 Q 228
R 231 L 229
D 232 P 230
T 233 E 231
Y 234 L 232
D 235 F 233
A 236 H 234
D 237 K 235
P 238 I 250
K 239 V 251
A 240 S 252
F 241 G 253
L 242 K 254
E 243 Y 255
E 244 D 256
W 245 S 257
R 246 G 258
P 247 I 259
K 248 P 260
D 249 P 261
E 258 Y 262
A 259 S 263
R 260 R 264
E 261 A 265
R 262 S 266
L 263 L 267
P 264 K 268
K 265 G 269
V 266 Y 270
E 267 Q 271
A 268 W 272
P 269 L 273
N 270 K 274
T 271 D 275
A 272 K 276
L 273 I 277
L 279 L 278
C 280 S 279
I 281 E 280
A 282 E 281
L 283 G 282
R 289 R 283
G 290 R 284
E 291 Q 285
L 292 Q 286
T 293 A 287
L 294 K 288
L 295 L 289
R 296 K 290
S 297 E 291
A 298 L 292
R 299 Q 293
A 300 A 294
L 301 I 295
A 302 A 296
A 303 E 297
L 304 R 298
E 305 L 299
G 306 G 300
A 307 C 301
T 308 T 302
R 312 L 303
D 313 P 304
H 314 Q 305
L 315 L 306
K 316 A 307
R 317 I 308
V 318 A 309
A 319 A 327
T 320 E 328
M 321 Q 329
A 322 L 330
L 323 M 331
S 324 E 332
H 325 N 333
R 326 I 334
L 327 G 335
R 328 A 336
R 329 I 337
D 330 Q 338
P 331 V 339
L 332 L 340
D 333 P 341
E 334 K 342
A 335 L 343
G 336 S 344
S 337 S 345
T 338 S 346
A 339 I 347
R 340 V 348
V 341 I 351
A 342 D 352
R 343 S 353
T 344 I 354
V 345 L 355
E 346 G 356
E 347 N 357
T 348 K 358
L 349 P 359
P 350 Y 360
TER
END

