
PFRMAT AL
TARGET T0127
AUTHOR 3092-8926-3558
METHOD PDB BLAST http://bioinformatics.ljcrf.edu/pdb_blast/
METHOD 1) Use PSI-Blast to collect homologs and create a sequence profile
METHOD    for the family.
METHOD 2) Use created profile to search for related proteins in PDB
MODEL  1
PARENT 1DO2_B
REMARK DATE	2000-02-25
REMARK SCORE	 4e-11	63.0	41/315 (13%)
A 25 H 16
I 26 I 17
V 27 I 18
G 28 G 19
Q 29 Q 20
E 30 D 21
D 31 N 22
M 32 A 23
K 33 K 24
L 34 R 25
A 35 S 26
L 36 V 27
L 37 A 28
L 38 I 29
T 39 A 30
A 40 L 31
V 41 R 32
D 42 N 33
P 43 R 34
G 44 T 49
I 45 P 50
G 46 K 51
G 47 N 52
V 48 I 53
L 49 L 54
V 50 M 55
F 51 I 56
G 52 G 57
D 53 P 58
R 54 T 59
G 55 G 60
T 56 V 61
G 57 G 62
K 58 K 63
S 59 T 64
T 60 E 65
A 61 I 66
V 62 A 67
R 63 R 68
A 64 R 69
L 65 L 70
A 66 A 71
A 67 K 72
L 68 L 73
L 69 A 74
P 70 N 75
E 71 K 80
I 72 V 81
E 73 E 82
A 74 A 83
V 75 T 84
E 76 K 85
G 77 F 86
C 78 T 87
P 79 E 88
V 80 V 89
S 81 G 90
S 82 Y 91
P 83 V 92
N 84 G 93
V 85 K 94
E 86 E 95
M 87 V 96
I 88 D 97
P 89 S 98
D 90 I 99
W 91 I 100
A 92 R 101
T 93 D 102
V 94 L 103
L 95 T 104
S 96 D 105
T 97 A 106
N 98 A 107
V 99 V 108
I 100 K 109
R 101 M 110
K 102 V 111
P 103 R 112
T 104 V 113
P 105 Q 114
V 106 A 115
V 107 I 116
D 108 E 117
L 109 K 118
P 110 A 123
L 111 E 124
G 112 E 125
V 113 L 126
S 114 A 127
E 115 E 128
D 116 E 129
R 117 R 130
V 118 I 131
V 119 L 132
G 120 D 133
A 121 V 134
L 122 L 135
D 123 I 136
I 124 P 137
E 125 P 138
R 126 A 139
A 127 K 140
I 128 N 141
S 129 N 142
K 130 W 143
G 131 G 144
E 132 Q 145
K 133 T 146
E 152 E 147
C 153 Q 148
N 154 Q 149
L 155 Q 150
L 156 E 151
E 157 P 152
D 158 S 153
H 159 A 154
I 160 A 155
V 161 R 156
D 162 Q 157
L 163 A 158
L 164 F 159
L 165 R 160
D 166 K 161
V 167 K 162
A 168 L 163
Q 169 R 164
S 170 E 165
G 171 G 166
E 172 Q 167
N 173 L 168
V 174 D 169
V 175 D 170
E 176 K 171
R 177 E 172
D 178 I 173
G 179 E 174
E 222 K 210
T 223 Q 211
R 224 K 212
V 225 A 213
E 226 R 214
V 227 K 215
I 228 L 216
R 229 K 217
R 230 I 218
R 231 K 219
D 232 D 220
T 233 A 221
Y 234 M 222
D 235 K 223
A 236 L 224
D 237 L 225
P 238 I 226
K 239 E 227
A 240 E 228
F 241 E 229
L 242 A 230
E 243 A 231
E 244 K 232
W 245 L 233
R 246 V 234
P 247 N 235
D 249 P 236
M 250 E 237
D 251 E 238
I 252 L 239
R 253 K 240
N 254 Q 241
Q 255 D 242
I 256 A 243
L 257 I 244
E 258 D 245
A 259 A 246
R 260 V 247
E 261 E 248
R 262 Q 249
L 263 H 250
P 264 G 251
K 265 I 252
V 266 V 253
E 267 F 254
A 268 I 255
P 269 D 256
N 270 E 257
L 273 I 258
Y 274 D 259
D 275 K 260
C 276 I 261
A 277 C 262
A 278 K 263
L 279 R 264
C 280 G 265
I 281 E 266
A 282 S 267
L 283 S 268
G 284 G 269
S 285 P 270
D 286 D 271
G 287 V 272
L 288 S 273
R 289 R 274
G 290 E 275
E 291 Q 278
L 292 R 279
T 293 D 280
L 294 L 281
L 295 L 282
R 296 P 283
S 297 L 284
A 298 V 285
R 299 E 286
A 300 G 287
L 301 C 288
A 302 T 289
A 303 V 290
L 304 S 291
E 305 T 292
G 306 K 293
A 307 H 294
T 308 G 295
A 309 M 296
V 310 V 297
G 311 K 298
R 312 T 299
D 313 D 300
H 314 H 301
L 315 I 302
TER
END

